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2013 年度 実績報告書

生命分子の動的秩序形成におけるミクロ‐マクロ相関の探査と設計原理の探求

計画研究

研究領域生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
研究課題/領域番号 25102008
研究種目

新学術領域研究(研究領域提案型)

研究機関大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設)

研究代表者

加藤 晃一  大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (20211849)

研究分担者 佐藤 匡史  名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (80532100)
研究期間 (年度) 2013-06-28 – 2018-03-31
キーワード生命分子 / 超分子 / 動的秩序 / 高次機能 / 集合離散
研究概要

初年度は、以下の2つの生命分子システムを対象として、本研究の基盤となる方法論を整備することに注力した。
(1)細胞内のタンパク質分解装置であるプロテアソームのアッセンブリーと機能発現に関わる生命分子システム
生命分子素子の動的秩序形成におけるミクロ-マクロ相関を探査するために安定同位体標識を利用したNMRと中性子小角散乱の融合研究を実施した。具体的には、古細菌由来のプロテアソーム活性化因子PbaBのホモ4量体に重水素標識を施し、それに捕捉されたモデル基質αシヌクレインの構造を逆コントラストマッチング中性子小角散乱法により選択的に観測することに成功した。一方、15N標識を施したαシヌクレインを用いて、PbaBホモ4量体と複合体形成に関わる部位のミクロ環境に関する情報を取得した。さらに、プロテアソームの分子集合に関わるアッセンブリーシャペロンNas2を対象にNMR解析とX線結晶構造解析の融合研究を展開し、本シャペロンの作動機構を解明することに成功した。
(2)細胞内および細胞表層における糖鎖認識に関わる生命分子システム
様々な時空間スケールにおける生命分子集合系のダイナミクスを原子レベルで解明するために、NMR観測を通じて得られる実験データを分子動力学(MD)シミュレーションと統合的に解析することによって、多分岐糖鎖の立体構造ダイナミクスを探査するためのアプローチ法を開拓した。安定同位体標識とランタニドイオン導入を利用して観測した常磁性効果に基づく糖鎖のNMRスペクトル変化を、拡張アンサンブル法を用いたMD計算から導かれる結果と比較することを通じて、糖鎖の3次元構造動態を定量的に評価することを可能とした。また、糖タンパク質の細胞内輸送装置を構成するレクチンを対象とした構造解析により、その糖鎖認識のダイナミクスを原子分解能で明らかにすることにも成功した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本年度の研究成果は当初の予想を越えた広がりを示し、プロテアソームアッセンブリーシャペロンの2量体形成を阻害する化合物の作用原理の解明や先天性筋ジストロフィーの原因遺伝子産物の機能の解明に発展し、創薬や医学の領域においても興味深い知見をもたらしている。これらの成果の一部は既にマスメディアを通じて社会に発信をしている。

今後の研究の推進方策

プロテアソームのアッセンブリーと機能発現に関わる生命分子システムを対象にした物理化学的計測をさらに発展させて、生命分子集団の自己組織系に内在する精緻にデザインされた不安定性をあぶり出し、機能発現にいたる時空間的展開の原理を理解することを目指す。
糖鎖認識システムについては、安定同位体標識を利用したNMR法による研究対象を糖脂質のクラスターに拡張し、それを舞台とするアミロイド形成の機構を探求する。
さらに、タンパク質の細胞内運命の決定に関わる生命分子集団が、溶液のpHや酸化還元状態等を感知して分子間のコミュニケーションをダイナミックに変化させるメカニズムを探索して、そのデザインルールを探る。

  • 研究成果

    (73件)

すべて 2014 2013 その他

すべて 雑誌論文 (12件) (うち査読あり 12件、 謝辞記載あり 2件) 学会発表 (58件) (うち招待講演 27件) 図書 (1件) 備考 (2件)

  • [雑誌論文] Structural basis for proteasome formation controlled by an assembly chaperone Nas22014

    • 著者名/発表者名
      T.Satoh, Y.Saeki, T.Hiromoto, Y.-H. Wang, Y.Uekusa, H.Yagi, H.Yoshihara, M.Yagi-Utsumi, T.Mizushima, K.Tanaka, and K.Kato
    • 雑誌名

      Structure

      巻: 22 ページ: 731-743

    • DOI

      10.1016/j.str.2014.02.014

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Backbone 1H, 13C, and 15N assignments of yeast Ump1, an intrinsically disordered protein that functions as a proteasome assembly chaperone2014

    • 著者名/発表者名
      Y.Uekusa, K.Okawa, M.Yagi-Utsumi, O.Serve, Y. Nakagawa, T.Mizushima, H.Yagi, Y.Saeki, K.Tanaka, and K.Kato
    • 雑誌名

      Biomol. NMR Assign.

      巻: 8 ページ: 383-386

    • DOI

      10.1007/s12104-013-9523-1

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Close Identity between Alternatively Folded State N2 of Ubiquitin and the Conformation of the Protein Bound to the Ubiquitin-Activating Enzyme2014

    • 著者名/発表者名
      Soichiro Kitazawa, Tomoshi Kameda, Ayumi Kumo, Maho Yagi-Utsumi, Nicola J. Baxter, Koichi Kato , Mike P. Williamson , and Ryo Kitahara
    • 雑誌名

      Biochemistry

      巻: 53 ページ: 447-449

    • DOI

      10.1021/bi401617n

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Conformational characterization of a protein complex involving intrinsically disordered protein by small-angle neutron scattering using the inverse contrast matching method: a case study of interaction between α-synuclein and PbaB tetramer as a model chaperone2014

    • 著者名/発表者名
      Masaaki Sugiyama, Hirokazu Yagi, Takumi Yamaguchi, Kentaro Kumoi, M.Hirai, Y.Oba, N.Sato, L.Porcar, A.Martele, and Koichi Kato
    • 雑誌名

      J. Appl. Cryst.

      巻: 47 ページ: 430-435

    • DOI

      10.1107/S1600576713033475

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Structural Basis for Disparate Sugar-Binding Specificities in the Homologous Cargo Receptors ERGIC-53 and VIP362014

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh, Kousuke Suzuki, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
    • 雑誌名

      PLoS ONE

      巻: 9 ページ: e87963

    • DOI

      10.1371/journal.pone.0087963

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Total synthesis and characterization of thielocin B1 as a protein-protein interaction inhibitor of PAC3 homodimer2014

    • 著者名/発表者名
      Takayuki Doi, Masahito Yoshida, Kosuke Ohsawa, Kazuo Shin-ya, Motoki Takagi, Yoshinori Uekusa, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato, Takatsugu Hirokawa, and Tohru Natsume
    • 雑誌名

      Chem. Sci.

      巻: 5 ページ: 1860-1868

    • DOI

      10.1039/C3SC53237B

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Ero1-α and PDIs constitute a hierarchical electron transfer network of endoplasmic reticulum oxidoreductases2013

    • 著者名/発表者名
      Kazutaka Araki, Shun-ichiro Iemura, Yukiko Kamiya, David Ron, Koichi Kato, Tohru Natsume and Kazuhiro Nagata
    • 雑誌名

      J. Cell. Biol.

      巻: 202 ページ: 861-874

    • DOI

      10.1083/jcb.201303027

    • 査読あり
  • [雑誌論文] The Unfolded Protein Response Transducer ATF6 Represents a Novel Transmembrane-type Endoplasmic Reticulum-associated Degradation Substrate Requiring Both Mannose Trimming and SEL1L Protein2013

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Horimoto, Satoshi Ninagawa, Tetsuya Okada, Hibiki Koba, Takehiro Sugimoto, Yukiko Kamiya, Koichi Kato, Shunichi Takeda and Kazutoshi Mori
    • 雑誌名

      J. Biol. Chem.

      巻: 288 ページ: 31517-31527

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.476010

    • 査読あり
  • [雑誌論文] AGO61-dependent GlcNAc modification primes the formation of functional glycans on α-dystroglycan2013

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Yagi, Naoki Nakagawa, Takuya Saito, Hiroshi Kiyonari, Takaya Abe, Tatsushi Toda, Sz-Wei Wu, Kay-Hhoo Khoo, Shogo Oka, and Koichi Kato
    • 雑誌名

      Sci. Rep.

      巻: 3 ページ: 3288

    • DOI

      10.1038/srep03288

    • 査読あり
  • [雑誌論文] New NMR tools for characterizing the dynamic conformations and interactions of oligosaccharides2013

    • 著者名/発表者名
      Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
    • 雑誌名

      Chem. Lett.

      巻: 42 ページ: 1455-1462

    • DOI

      10.1246/cl.130789

    • 査読あり
  • [雑誌論文] IgG-FcとFc受容体の複合体形成における糖鎖の役割2013

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和,加藤晃一
    • 雑誌名

      実験医学

      巻: 31 ページ: 1602-1606

    • 査読あり
  • [雑誌論文] 神経幹細胞の幹細胞性維持における複合糖質の役割2013

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和,加藤晃一
    • 雑誌名

      生化学

      巻: 85 ページ: 1012-1016

    • 査読あり
  • [学会発表] AGO61-dependent GlcNAc modification primes the formation of functional glycans on & α-dystroglycan2014

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Yagi, Naoki Nakagawa, Takuya Saito, Tatsushi Toda, Sz-Wei Wu, Kay-Hooi Khoo, Shogo Oka, and Koichi Kato
    • 学会等名
      International Symposium on Glyco-Neuroscience
    • 発表場所
      淡路夢舞台(兵庫県)
    • 年月日
      20140109-20140110
  • [学会発表] Mechanistic insights into the proteasome orchestration by a proteasome assembly chaperone Nas22013

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh, Yoshinori Uekusa, Takeshi Hiromoto, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Tsunehiro Mizushima, Yasushi Saeki, Keiji Tanaka, and Koichi Kat
    • 学会等名
      7th International Conference on Structural Genomics (ICSG2013-SLS)
    • 発表場所
      京王プラザホテル札幌(北海道)
    • 年月日
      20130729-20130801
  • [学会発表] Structural basis underlying the redox-dependent domain rearrangement of the substrate-binding region of protein disulfide isomerase2013

    • 著者名/発表者名
      Koya Inagaki, Yoshinori Uekusa, Yukiko Kamiya, Tadashi Satoh, and Koichi Kato
    • 学会等名
      7th International Conference on Structural Genomics (ICSG2013-SLS)
    • 発表場所
      京王プラザホテル札幌(北海道)
    • 年月日
      20130729-20130801
  • [学会発表] Structural and functional mosaic nature of MHC class I molecules in their peptide-free form2013

    • 著者名/発表者名
      Eiji Kurimoto, Kimiko Kuroki, Yoshiki Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi, Takahiro Igaki, Takeshi Iguchi, Katsumi Maenaka, and Koichi Kato
    • 学会等名
      7th International Conference on Structural Genomics (ICSG2013-SLS)
    • 発表場所
      京王プラザホテル札幌(北海道)
    • 年月日
      20130729-20130801
  • [学会発表] ERGIC-53/MCFD2 複合体による糖鎖認識の構造基盤

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史,鈴木康介,西尾美穂,神谷由紀子,矢木真穂,水島恒裕,加藤晃一
    • 学会等名
      第59回 日本薬学会東海支部会
    • 発表場所
      名城大学(愛知県)
  • [学会発表] 安定同位体標識と常磁性プローブ導入による高マンノース型糖鎖のNMR動的構造解析

    • 著者名/発表者名
      山口拓実,Zhang Ying,王 進政,喜多島敏彦,千葉靖典,戸谷希一郎,神谷由紀子,加藤晃一
    • 学会等名
      第32回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪府)
  • [学会発表] 積荷受容体ERGIC-53/MCFD2による糖鎖認識の構造基盤

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史,鈴木康介,西尾美穂,神谷由紀子,矢木真穂,水島恒裕,加藤晃一
    • 学会等名
      第32回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪府)
  • [学会発表] 立体構造からみた糖鎖の不均一性

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      第32回日本糖質学会年会
    • 発表場所
      大阪国際交流センター(大阪府)
    • 招待講演
  • [学会発表] NMRを用いた糖鎖のコンフォメーション揺らぎとクラスター特性の解析

    • 著者名/発表者名
      山口拓実,加藤晃一
    • 学会等名
      国際高等研研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能ネットワークと ダイナミクスの解明」第2回研究会
    • 発表場所
      国際高等研究所(京都府)
    • 招待講演
  • [学会発表] 生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      国際高等研研究プロジェクト「分子基盤に基づく生体機能ネットワークと ダイナミクスの解明」第2回研究会
    • 発表場所
      国際高等研究所(京都府)
    • 招待講演
  • [学会発表] NMRを用いた生命分子のダイナミクス解析

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      第2回 立命館大学BKC生体分子ネットワークセミナー
    • 発表場所
      立命館大学(滋賀県)
    • 招待講演
  • [学会発表] Dynamic organization of biomolecular systems for promotion of integrative functions

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      Summer School 2013 "Bioorganization"
    • 発表場所
      岡崎バイオサイエンスセンター(愛知県)
    • 招待講演
  • [学会発表] Atomic Anatomy of Antibody as Glycoprotein

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      World Biopharma Week China Focus 2013
    • 発表場所
      Shanghai,China
    • 招待講演
  • [学会発表] Paramagnetism-assisted NMR for atomic description of dynamic oligosaccharides

    • 著者名/発表者名
      Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, Sayoko Yamamoto, and Koichi Kato
    • 学会等名
      糖鎖科学中部拠点 第11回若手の力フォーラム
    • 発表場所
      名古屋市立大学(愛知県)
  • [学会発表] Bacterial expression and EM analysis of UDP-glucose glycosyltransferase from a thermophilic fungus

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu, Kazuyoshi Murata, Takahasu Toshimori, Maho Yagi-Utsumi, Tadashi Sato, and Koichi Kato
    • 学会等名
      糖鎖科学中部拠点 第11回若手の力フォーラム
    • 発表場所
      名古屋市立大学(愛知県)
  • [学会発表] 「医薬品をイメージングする-革新的医薬品創出のための基礎技術-」 バイオ医薬品の構造をみる

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      第22回日本バイオイメージング学会学術集会
    • 発表場所
      東京都薬学部講堂(東京都文京区)
    • 招待講演
  • [学会発表] 糖鎖が担う タンパク質社会の秩序維持

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      市民公開講座・第99回分子科学フォーラム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 招待講演
  • [学会発表] ランタニドイオンを活用した常磁性NMR法による糖鎖の動的構造解析

    • 著者名/発表者名
      山口拓実,Zhang Ying,王 進政,戸谷希一郎,榮 慶丈,岡本祐幸,神谷由紀子,加藤 晃一
    • 学会等名
      第7回バイオ関連化学シンポジウム
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
  • [学会発表] 生命分子の動的秩序形成におけるミクロ-マクロ相関の探査と設計原理の探求

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      新学術領域研究「動的秩序と機能」第1回公開シンポジウム
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 招待講演
  • [学会発表] 多次元HPLC法およびNMR法による糖鎖解析技術

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      抗体バイオ分析セミナー-抗体/バイオ医薬品における各種分析手法および解析手法
    • 発表場所
      ゆうぽうと(東京都品川区)
    • 招待講演
  • [学会発表] NMR characterization of dynamic conformational ensembles of oligosaccharides and intermolecular interactions in glycolipid clusters

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      5th Asia-Pacific NMR Symposium in conjunction with ANZMAG 2013
    • 発表場所
      Brisbane,Australia
    • 招待講演
  • [学会発表] 糖鎖の機能解明を目指したNMRアプローチNMR approaches for elucidating the functional roles of glycans

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      第52回NMR討論会
    • 発表場所
      石川県立音楽堂(石川県)
    • 招待講演
  • [学会発表] EM tomography analysis of ER folding sensor enzyme UDP-glucose: glycoprotein glucosyltransferase

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu, Kazuyoshi Murata, Takayasu Toshimori, Takumi Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi, Tadashi Satoh, and Koichi Kato
    • 学会等名
      平成25年度 生理学研究所研究会「電子顕微鏡機能イメージングの医学・生物学への応用」
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] 糖鎖を見る:分子模型からムービーへ

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      平成25年度 生理学研究所研究会「構造の多様性に立脚した糖鎖機能の解明に向けて」
    • 発表場所
      生理学研究所(愛知県)
    • 招待講演
  • [学会発表] 生命分子アッセンブリーにおける分子間相互作用のダイナミクス精密解析

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一,山口拓実
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖ビューホテル(愛知県)
    • 招待講演
  • [学会発表] Interaction mode of a proteasome assembly chaperone Nas2 with the proteasome Rpt5 subunit

    • 著者名/発表者名
      Ying-Hui Wang, Tadashi Satoh, Takeshi Hiromoto, Yoshinori Uekusa, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Tsunehiro Mizushima, Yasushi Saeki, Keiji Tanaka, and Koichi Kato
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖ビューホテル(愛知県)
  • [学会発表] Conformation dynamics of ganglioside glycans as revealed by paramagnetism-assisted NMR spectroscopy

    • 著者名/発表者名
      Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, Sayoko Yamamoto, and Koichi Kato
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖ビューホテル(愛知県)
  • [学会発表] Overall structure of ER folding sensor UDP-glucose: glycoprotein glucosyltransferase revealed by EM tomography

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu, Kazuyoshi Murata, Takayasu Toshimori, Takumi Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi, Tadashi Satoh, and Koichi Kato
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖ビューホテル(愛知県)
  • [学会発表] Redox-dependent conformational changes of the substrate-binding region of protein disulfide isomerase

    • 著者名/発表者名
      Koya Inagaki, Yoshinori Uekusa, Yukiko Kamiya,Satoru Itoh, Hisashi Okumura, Tadashi Satoh, and Koichi Kato
    • 学会等名
      山田研究会・統合バイオサイエンスシンポジウム
    • 発表場所
      伊良湖ビューホテル(愛知県)
  • [学会発表] タンパク質社会の秩序維持における糖鎖の役割

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一
    • 学会等名
      お茶の水女子大学 糖鎖科学教育研究センター 第6回 公開シンポジウム
    • 発表場所
      お茶の水女子大学(東京都文京区)
    • 招待講演
  • [学会発表] Paramagnetism-assisted NMR evaluation of molecular dynamics simulations for conformational characterization of oligosaccharide

    • 著者名/発表者名
      Takumi Yamaguchi, Ying Zhang, Yukiko Kamiya, Yoshitake Sakae, Yuko Okamoto, and Koichi Kato
    • 学会等名
      6th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science : Experiments and Simulation
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] Structural basis for proteasome formation mediated by assembly chaperone Nas2

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh, Hirokazu Yagi, Ying-Hui Wang, Yoshinori Uekusa, Takeshi Hiromoto, Maho Yagi-Utsumi, Tsunehiro Mizushima, and Koichi Kato
    • 学会等名
      6th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science : Experiments and Simulation
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] An archaeal homolog of proteasome assembly chaperone forms a homotetramer and functions as proteasome activator

    • 著者名/発表者名
      Kentaro Kumoi, Tadashi Satoh, Kazuyoshi Murata, Takeshi Hiromoto, Tsunehiro Mizushima, Yukiko Kamiya, Masanori Noda, Susumu Uchiyama, Masaaki Sugiyama, Hirokazu Yagi, and Koichi Kato
    • 学会等名
      6th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science : Experiments and Simulation
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
    • 招待講演
  • [学会発表] NMR characterization of the interaction of a proteasome assembly chaperone Nas2 with the proteasome Rpt5 subunit

    • 著者名/発表者名
      Ying-Hui Wang, Tadashi Satoh, Takeshi Hiromoto, Yoshinori Uekusa, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Tsunehiro Mizushima, Yasushi Saeki, Keiji Tanaka, and Koichi Kato
    • 学会等名
      SOKENDAI Asian Winter School "Innovations and Challenges in Molecular Science: From Basics to Cutting-edge Researches”
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] NMR investigation of non-nucleoside inhibitors binding to HIV-1 reverse transcriptase

    • 著者名/発表者名
      Ratsupa Thammaporn, Pornthip Boonsri, Kiattawee Choowongkomon, Maho Yagi-Utsumi, Takumi Yamaguchi, Supa Hannongbua, and Koichi Kato
    • 学会等名
      SOKENDAI Asian Winter School "Innovations and Challenges in Molecular Science: From Basics to Cutting-edge Researches”
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] Position Selective 13C Labeling of Multi-Antennary Oligosaccharides for NMR Analysis

    • 著者名/発表者名
      Panuwat Padungros, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
    • 学会等名
      SOKENDAI Asian Winter School "Innovations and Challenges in Molecular Science: From Basics to Cutting-edge Researches”
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] Structural biology of glycoconjugates: Sugar chains as therapeutic targets

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      Yonsei-IMS Seminars on Biomolecular Sciences : Protein Structures and Diseases
    • 発表場所
      Busan,Korea
    • 招待講演
  • [学会発表] Structural basis for disparate sugar-binding specificities in the homologous cargo receptors ERGIC-53 and VIP36

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh, Kosuke Suzuki, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
    • 学会等名
      Yonsei-IMS Seminars on Biomolecular Sciences : Protein Structures and Diseases
    • 発表場所
      Busan,Korea
    • 招待講演
  • [学会発表] AGO61-dependent GlcNAc modification primes the formation of functional glycans on α-dystroglycan

    • 著者名/発表者名
      Hirokazu Yagi, Naoki Nakagawa, Takuya Saito, Hiroshi Kiyonari,Takaya Abe, Tatsushi Toda, Sz-Wei Wu, Kay-Hooi Khoo, Shogo Oka, and Koichi Kato
    • 学会等名
      Yonsei-IMS Seminars on Biomolecular Sciences : Protein Structures and Diseases
    • 発表場所
      Busan,Korea
    • 招待講演
  • [学会発表] Elucidation of the conformational dynamics of oligosaccharides by using paramagnetism-assisted NMR spectroscopy

    • 著者名/発表者名
      Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, Sayoko Yamamoto, and Koichi Kato
    • 学会等名
      Yonsei-IMS Seminars on Biomolecular Sciences : Protein Structures and Diseases
    • 発表場所
      Busan,Korea
  • [学会発表] The structural biology study on ER folding sensor UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase (UGGT)

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu, Kazuyoshi Murata, Takayasu Toshimori, Takumi Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi, Tadashi Satoh, and Koichi Kato
    • 学会等名
      Yonsei-IMS Seminars on Biomolecular Sciences : Protein Structures and Diseases
    • 発表場所
      Busan,Korea
  • [学会発表] Dynamic Assembly of Proteins Involved in the Ubiquitin-/Proteasome-mediated Protein Degradation System

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      Joint IMS-KU Workshop on Molecular Sciences towards Green Sustainabili
    • 発表場所
      Bangkok,Thailand
    • 招待講演
  • [学会発表] Mechanistic Insights into Dynamic Orchestration of Proteasomes

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      Pure and Applied Chemistry International Conference (PACCON) 2014
    • 発表場所
      Khon Kaen,Thailand
    • 招待講演
  • [学会発表] Exploration of micro-macro relationships in dynamic ordering of biomolecular systems and their underlying design principles

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato and Tadashi Satoh
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都(京都府)
    • 招待講演
  • [学会発表] A structural biology study of endoplasmic reticulum glycoprotein-folding machinery

    • 著者名/発表者名
      Tadashi Satoh, Tong Zhu, Takayasu Toshimori, Kazuyoshi Murata, Takumi Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi, and Koichi Kato
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都(京都府)
  • [学会発表] Molecular mechanisms of proteasome assembly: structural basis of Nas2 with proteasome Rpt5 subunit

    • 著者名/発表者名
      Ying-Hui Wang, Tadashi Satoh, Takeshi Hiromoto, Yoshinori Uekusa, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Tsunehiro Mizushima, Yasushi Saeki, Keiji Tanaka, and Koichi Kato
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都(京都府)
  • [学会発表] Paramagnetism-assisted NMR approaches to the molecular basis of oligosaccharide functions

    • 著者名/発表者名
      Takumi Yamaguchi, Ying Zhang, Yukiko Kamiya, Yoshitake Sakae, Yuko Okamoto, and Koichi Kato
    • 学会等名
      The 2nd International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems for Creation of Integrated Functions
    • 発表場所
      キャンパスプラザ京都(京都府)
  • [学会発表] Conformational Dynamics of Oligosaccharides Characterized by Paramagnetism-assisted NMR Spectroscopy in Conjunction with Molecular Dynamics Simulation

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      The 10th International Symposium on Biochemical roles of Eukaryotic Cell Surface Macromolecules
    • 発表場所
      Kolkata,India
    • 招待講演
  • [学会発表] NMR approaches for elucidating the functional roles of carbohydrate chains

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      20th Symposium of National Magnetic Resonance Society (NMRS-2014)
    • 発表場所
      Assam,India
    • 招待講演
  • [学会発表] 生命分子の揺らぎと秩序形成

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      独)日本学術振興会 分子系の複合電子機能第181委員会
    • 発表場所
      国際高等研究所(京都府)
    • 招待講演
  • [学会発表] 超高磁場NMR分光法を中心としたタンパク質の高次構造・相互作用解析

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      第2回 ISITナノ・バイオフォーラム
    • 発表場所
      福岡市産業連携交流センター(福岡県)
    • 招待講演
  • [学会発表] 小胞体品質管理に関わるグルコシダーゼIIの基質認識機構の構造基盤

    • 著者名/発表者名
      年森隆泰,佐藤匡史,Zhu Tong,加藤晃一
    • 学会等名
      2013年度 生物物理中部支部会
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] プロテインジスルフィドイソメラーゼの機能発現におけるミクロ‐マクロ相関の探査

    • 著者名/発表者名
      稲垣宏弥,植草義徳,神谷由紀子,伊藤  暁,奥村久士,佐藤匡史,加藤晃一
    • 学会等名
      2013年度 生物物理中部支部会
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] Structural-architecture of the ER glycoprotein folding sensor UDP-glucose:glycoprotein glucosyltransferase (UGGT)

    • 著者名/発表者名
      Tong Zhu, Tadashi Satoh, Kazuyoshi Murata, Hironari Kamikubo, Takayasu Toshimori, Takumi Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi, and Koichi Kato
    • 学会等名
      2013年度 生物物理中部支部会
    • 発表場所
      岡崎コンファレンスセンター(愛知県)
  • [学会発表] NMRを応用した糖鎖の動的構造解析

    • 著者名/発表者名
      Koichi Kato
    • 学会等名
      よこはまNMR構造生物学研究会 第49回ワークショップ
    • 発表場所
      理化学研究所横浜研究所交流棟ホール(神奈川県)
    • 招待講演
  • [学会発表] Elucidation of the conformational dynamics of oligosaccharides by paramagnetism-assisted NMR approach

    • 著者名/発表者名
      Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, Sayoko Yamamoto, Yoshitake Sakae, Yuko Okamoto, and Koichi Kato
    • 学会等名
      日本化学会第94春季年会
    • 発表場所
      名古屋大学(愛知県)
  • [学会発表] 小胞体糖タンパク質フォールディング装置を構成するタンパク質群の構造生物学研究

    • 著者名/発表者名
      佐藤匡史,年森隆泰,Tong Zhu,村田和義,山口拓実,矢木真穂,加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会134年会
    • 発表場所
      熊本大学(熊本県)
  • [学会発表] AGO61依存的なGlcNAc修飾はα-ジストログリカン上の糖鎖形成の初期過程に必須である

    • 著者名/発表者名
      矢木宏和,中川直樹,齋藤拓也,戸田達史,呉 思緯,邱 繼輝,岡 昌吾,加藤晃一
    • 学会等名
      日本薬学会134年会
    • 発表場所
      熊本大学(熊本県)
  • [図書] 揺らぎ・ダイナミクスと生体機能 第5章1節 「NMR 原理」2013

    • 著者名/発表者名
      加藤晃一,山口拓実(寺嶋正秀 編)
    • 総ページ数
      368 (69-79)
    • 出版者
      化学同人
  • [備考] 先天性筋ジストロフィーの原因遺伝子の機能を解明

    • URL

      http://www.ims.ac.jp/news/2013/11/post.html

  • [備考] 細胞の中の「タンパク質分解装置」が出来上がる新たな仕組みを解明

    • URL

      http://www.ims.ac.jp/news/2014/03/140328.html

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公開日: 2015-05-28  

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