生命分子の動的秩序形成におけるミクロ‐マクロ相関の探査と設計原理の探求

2015 年度 実績報告書

• 研究領域: 生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現
• 研究課題/領域番号: 25102008
• 研究機関: 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設)
• 研究代表者: 加藤 晃一 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 教授 (20211849)
• 研究分担者: 佐藤 匡史 名古屋市立大学, 薬学研究科(研究院), 准教授 (80532100) ; 山口 拓実 北陸先端科学技術大学院大学, マテリアルサイエンス研究科, 准教授 (60522430) ; 矢木 真穂 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 助教 (40608999) ; 栗原 顕輔 大学共同利用機関法人自然科学研究機構(岡崎共通研究施設), 岡崎統合バイオサイエンスセンター, 特任准教授 (80740919)
• 研究期間 (年度): 2013-06-28 – 2018-03-31
• キーワード: 動的秩序 / 生命分子 / 分子集合 / NMR / 溶液散乱

研究実績の概要

１.細胞内における糖タンパク質の運命決定のダイナミクス ：糖タンパク質を分解へと促す酵素グルコシダーゼⅡに関して3次元構造情報を得ることに成功し、分子運命決定に関わる構造基盤を求めることができた。また、小胞体内で糖タンパク質のフォールディング状態が不全なタンパク質の存在を感知してそれにシャペロンが認識する目印（糖鎖非還元末端のグルコース残基）を付ける酵素であるUGGTを活用して、安定同位体標識を施したシャペロン認識糖鎖を作出する方法論を開発し、詳細なNMR構造解析を行う道筋をつけた。さらに、小胞体フォールディング補助酵素プロテインジスルフィドイソメラーゼが活性部位の酸化還元状態の変化に応じて基質認識ドメインの空間配置を変化させるメカニズムを明らかにするとともに、本酵素の基質認識様式の構造基盤を初めて明らかにすることに成功した。
２.タンパク質の分子集合過程の解明と人工系への応用：非共有結合を保持した状態での質量分析法をはじめとする生化学的分析手段を駆使することにより、多数のサブユニットから構成されるタンパク質分解装置プロテアソームの形成過程は、非天然型のサブユニット集合体（α7サブユニットのみから形成される14量体）の生成と、これが他のサブユニットとの相互作用を通じて崩壊するスクラップ・アンド・ビルドの過程を含み得ることを示した。また、小胞輸送に関わるカーゴ受容体の酵母ホモログがpHに依存して離合集散する仕組みを明らかにすることができた。
３.糖脂質クラスターの設計・創生と構造・機能解析：生体分子と人工超分子のハイブリッドによるサイボーグ超分子を創生し、アルツハイマー病の発症にかかわるアミロイドβタンパク質と糖鎖クラスターとの相互作用解析に応用した。また、固体NMR分光法を利用することによりアミロイドβタンパク質の膜存在下での集合中間体の構造解析を行った。

現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

抗体のFc領域のNMRスペクトルの帰属を公開して医薬産業界からのニーズに応えるとともに、特定のアミノ酸側鎖に着目することでFc受容体との結合の強さを向上させることに成功した。また、ヒト免疫不全ウイルス逆転写酵素と一連の阻害剤との相互作用をNMRを用いて解析し、それらの阻害活性と阻害剤結合状態の酵素の化学シフトの相関関係を明らかにするなど、医学・薬学分野においても重要な知見をもたらすことができた。

今後の研究の推進方策

生命分子システムの動的秩序形成におけるミクロ-マクロ相関の探査を可能とする物理化学的計測手法の開発に引き続き取り組むとともに、生命分子素子がダイナミックな集合離散を通じて動的な秩序構造を形成するメカニズムを明らかにすることを目指す。また、生命分子システムのデザインルールを取り入れた人工自己組織化システムの創生に資することを目的とする。
本研究の目的を達成するため、プロテアソームに関連するタンパク質集団の集合離散系のダイナミクス解析を実施する。特に、古細菌のプロテアソーム集合シャペロン様タンパク質についても構造機能解析を推進し、プロテアソーム複合体の動的秩序形成メカニズムを分子進化の観点から理解することも視野に入れて研究を遂行する。一方、機能性糖鎖を組み込んだ人工クラスターを設計創生してNMR解析等を実施し、それらの動的秩序形成の物理化学的実体の解明に迫るとともに、その機能評価も実施する。さらに、人工細胞モデル系の進化をはかる。

研究成果

• [国際共同研究] Kasetsart University(Thailand)
  • 国名: タイ
  • 外国機関名: Kasetsart University
• [国際共同研究] Chung-Ang University(韓国)
  • 国名: 韓国
  • 外国機関名: Chung-Ang University
• [雑誌論文] Comparison of analytical methods for profiling N- and O-linked glycans from cultured cell lines: HUPO Human Disease Glycomics/Proteome Initiative multi-institutional study (2016)
  • 著者名/発表者名: H.Ito, H.Kaji, A.Togayachi, P.Azadi, M.Ishihara, R.Geyer, C.Galuska, H.Geyer, K.Kakehi, M.Kinoshita, N.G.Karlsson, C.Jin, K.Kato, H.Yagi, S.Kondo, N.Kawasaki, N.Hashii, D.Kolarich, K.Stavenhagen, N.H.Packer, M.Nakano, N.Taniguchi, A.Kurimoto, Y.Wada, M.Tajiri, P.Yang, W.Cao, H.Li, P.M.Rudd, andH.Narimatsu
  • 雑誌名: Glycoconjugate J. 巻: 33 ページ: 405-415
  • DOI: 10.1007/s10719-015-9625-3
  • 査読あり / 国際共著
• [雑誌論文] Membrane-induced dichotomous conformation of amyloid β with the disordered N-terminal segment followed by the stable C-terminal β structure (2016)
  • 著者名/発表者名: M. Yagi-Utsumi, K. Kato, K. Nishimura
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 11 ページ: e0146405
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0146405
  • 査読あり
• [雑誌論文] Application of site-specific spin labeling for NMR detecting inhibitor-induced conformational change of HIV-1 reverse transcriptase (2016)
  • 著者名/発表者名: S. Seetaha, M. Yagi-Utsumi, T. Yamaguchi, K. Ishii, S. Hannongbua, K. Choowongkomon, K. Kato
  • 雑誌名: ChemMedChem 巻: 11 ページ: 363-366
  • DOI: 10.1002/cmdc.201500554
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis for two-step glucose trimming by glucosidase II involved in ER glycoprotein quality control (2016)
  • 著者名/発表者名: T. Satoh, T. Toshimori, G. Yan, T. Yamaguchi, K. Kato
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 6 ページ: 20575
  • DOI: 10.1038/srep20575
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Mass spectrometric characterization of HIV-1 reverse transcriptase interactions with non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors (2016)
  • 著者名/発表者名: R. Thammaporn, K. Ishii, M. Yagi-Utsumi, S. Uchiyama, S. Hannongbua, K. Kato
  • 雑誌名: Biol. Pharm. Bull. 巻: 39 ページ: 450-454
  • DOI: 10.1248/bpb.b15-00880
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR-based structural validation of therapeutic antibody produced in Nicotiana benthamiana (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Yagi, N. Fukuzawa, Y. Tasaka, K. Matsuo, Y. Zhang, T. Yamaguchi, S. Kondo, S. Nakazawa, N. Hashii, N. Kawasaki, T. Matsumura and K. Kato
  • 雑誌名: Plant Cell Rep. 巻: 34 ページ: 959-968
  • DOI: 10.1007/s00299-015-1757-1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Stable isotope labeling of glycoprotein expressed in silkworms using immunoglobulin G as a test molecule (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Yagi, M. Nakamura, J. Yokoyama, Y. Zhang, T. Yamaguchi, S. Kondo, J. Kobayashi, T. Kato, E. Y. Park, S. Nakazawa, N. Hashii, N. Kawasaki and K. Kato
  • 雑誌名: J. Biomol. NMR 巻: 62 ページ: 157-167
  • DOI: 10.1007/s10858-015-9930-y
  • 査読あり
• [雑誌論文] Backbone 1H, 13C, and 15N resonance assignments of the Fc fragment of human immunoglobulin G glycoprotein (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Yagi, Y. Zhang, M. Yagi-Utsumi, T. Yamaguchi, S. Iida, Y. Yamaguchi and K. Kato
  • 雑誌名: Biomol. NMR Assign. 巻: 9 ページ: 257-260
  • DOI: 10.1007/s12104-014-9586-7
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Glycan structure and serum half-life of recombinant CTLA4Ig, an immunosuppressive agent, expressed in suspension-cultured rice cells with coexpression of human β1,4-galactosyltransferase and human CTLA4Ig (2015)
  • 著者名/発表者名: S. H. Kang, H. S. Jung, S. J. Lee, C. I. Park, S. M. Lim, H. Park, B. S. Kim, K. H. Na, G. J. Han, J. W. Bae, H. J. Park, K. C. Bang, B. T. Park, H. S. Hwang, I.-S. Jung, J. I. Kim, D. B. Oh, D. I. Kim, H. Yagi, K. Kato, D. K. Kim and H. H. Kim
  • 雑誌名: Glycoconjugate J. 巻: 32 ページ: 161-172
  • DOI: 10.1007/s10719-015-9590-x
  • 査読あり
• [雑誌論文] 離合集散が織りなす生命分子機能の研究フロンティア (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一, 稲垣直之
  • 雑誌名: 実験医学 巻: 33 ページ: 1316-1320
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural and dynamic views of GM1 ganglioside (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Yagi-Utsumi and K. Kato
  • 雑誌名: Glycoconjugate J. 巻: 32 ページ: 105-112
  • DOI: 10.1007/s10719-015-9587-5
  • 査読あり
• [雑誌論文] 生命分子の自己組織化のダイナミクス (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一, 佐藤匡史
  • 雑誌名: 化学工業 巻: 66 ページ: 32-37
  • 査読あり
• [雑誌論文] Ectopic clustering of Cajal-Retzius and subplate cells is an initial pathological feature in Pomgnt2-knockout mice, a model of dystroglycanopathy (2015)
  • 著者名/発表者名: N. Nakagawa, H. Yagi, K. Kato, H. Takematsu and S. Oka
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 5 ページ: 11163
  • DOI: 10.1038/srep11163
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] A self-assembled spherical complex displaying a gangliosidic glycan cluster capable of interacting with amyloidogenic proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Sato, Y. Yoshimasa, D. Fujita, M. Yagi-Utsumi, T. Yamaguchi, K. Kato and M. Fujita
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 巻: 127 ページ: 8555-8559
  • DOI: 10.1002/anie.201501981R1
  • 査読あり
• [雑誌論文] Structural basis of redox-dependent substrate binding of protein disulfide isomerase (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Yagi-Utsumi, T. Satoh and K. Kato
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 5 ページ: 13909
  • DOI: 10.1038/srep13909
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Redox-coupled structural changes of the catalytic a’ domain of protein disulfide isomerase (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Inagaki, T. Satoh, M. Yagi-Utsumi, A.-C. Le Gulluche, T. Anzai, Y. Uekusa, Y. Kamiya and K. Kato
  • 雑誌名: FEBS Lett. 巻: 589 ページ: 2690-2694
  • DOI: 10.1016/j.febslet.2015.07.041
  • 査読あり
• [雑誌論文] Importance of the side chain at position 296 of antibody Fc in interactions with FcγRIIIa and other Fcγ receptors (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Isoda, H. Yagi, T. Satoh, M. Shibata-Koyama, K. Masuda, M. Satoh, K. Kato and S. Iida
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 10 ページ: e0140120
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0140120
  • 査読あり
• [雑誌論文] pH-dependent assembly and segregation of the coiled-coil segments of yeast putative cargo receptors Emp46p and Emp47p (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Ishii, H. Enda, M. Noda, M. Kajino, A. Kim, E. Kurimoto, K. Sato, A. Nakano, Y. Kobayashi, H. Yagi, S. Uchiyama and K. Kato,
  • 雑誌名: PLoS ONE 巻: 10 ページ: e0140287
  • DOI: 10.1371/journal.pone.0140287
  • 査読あり
• [雑誌論文] NMR characterization of HIV-1 reverse transcriptase binding to various non-nucleoside reverse transcriptase inhibitors with different activities (2015)
  • 著者名/発表者名: R. Thammaporn, M. Yagi-Utsumi, T. Yamaguchi, P. Boonsri, P. Saparpakorn, K. Choowongkomon, S. Techasakul, K. Kato and S. Hannongbua,
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 5 ページ: 15806
  • DOI: 10.1038/srep15806
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Forcible destruction of severely misfolded mammalian glycoproteins by the non-glycoprotein ERAD pathway (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Ninagawa, T. Okada, Y. Sumitomo, S. Horimoto, T. Sugimoto, T. Ishikawa, S. Takeda, T. Yamamoto, T. Suzuki, Y. Kamiya, K. Kato and K. Mori,
  • 雑誌名: J. Cell Biol. 巻: 211 ページ: 775-784
  • DOI: 10.1083/jcb.201504109
  • 査読あり
• [雑誌論文] A hybrid strategy for the preparation of 13C-labeled high-mannose-type oligosaccharides with terminal glucosylation for NMR study (2015)
  • 著者名/発表者名: T. Zhu, T. Yamaguchi, T. Satoh and K. Kato,
  • 雑誌名: Chem. Lett. 巻: 44 ページ: 1744-1746
  • DOI: 10.1246/cl.150898
  • 査読あり
• [雑誌論文] Isotope effect on the circular dichroism spectrum of methyl α-D-glucopyranoside in aqueous solution (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kanematsu, Y. Kamiya, K. Matsuo, K. Gekko, K. Kato and M. Tachikawa,
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 5 ページ: 17900
  • DOI: 10.1038/srep17900
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] Disassembly of the self-assembled, double-ring structure of proteasome α7 homo-tetradecamer by α6 (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Ishii,M. Noda, H. Yagi, R. Thammaporn, S. Seetaha, T. Satoh, K. Kato and S. Uchiyama
  • 雑誌名: Sci. Rep. 巻: 5 ページ: 18167
  • DOI: 10.1038/srep18167
  • 査読あり / オープンアクセス
• [雑誌論文] 糖鎖の生命分子科学の新展開 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山口拓実, 矢木真穂, 加藤晃一
  • 雑誌名: 機器センターたより 巻: 7 ページ: 74-78
  • 査読あり
• [雑誌論文] 糖鎖依存的構造異常タンパク質分解に必須な糖鎖刈り込み機構を解明～革新的ゲノム編集技術によって従来のモデルを一新～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 蜷川 暁, 加藤晃一, 森 和俊
  • 雑誌名: 化学と生物 巻: 53 ページ: 571-573
  • 査読あり
• [雑誌論文] 生命現象の解明に挑むサイボーグ超分子―機能を維持したまま生体分子クラスターを人工分子に移植 (2015)
  • 著者名/発表者名: 佐藤宗太, 加藤晃一, 藤田 誠
  • 雑誌名: 化学 巻: 70 ページ: 31-36
  • 査読あり
• [雑誌論文] Paramagnetic NMR probes for characterization of the dynamic conformations and interactions of oligosaccharides (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Kato and T. Yamaguchi
  • 雑誌名: Glycoconjugate J. 巻: 32 ページ: 505-513
  • DOI: 10.1007/s10719-015-9599-1
  • 査読あり
• [学会発表] Conformational and stoichiometric characterization of protein complexes by small-angle neutron scattering in conjunction with native mass spectrometry (2016)
  • 著者名/発表者名: Yasuhiro Yunoki, Kentaro Ishii, Reiko Murakami, Masanori Noda, Hirokazu Yagi, Rintaro Inoue, Masaaki Sugiyama, Susumu Uchiyama, Koichi Kato
  • 学会等名: 日本化学会第96春季年会
  • 発表場所: 同志社大学京田辺キャンパス（京都府京田辺市）
  • 年月日: 2016-03-27
  • 国際学会
• [学会発表] 安定同位体標識モノグルコシル化糖鎖の調製とNMR立体国造解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山口拓実，Zhu Tong，佐藤匡史，加藤晃一
  • 学会等名: 日本化学会第96春季年会
  • 発表場所: 同志社大学京田辺キャンパス（京都府京田辺市）
  • 年月日: 2016-03-24
• [学会発表] Structural insights into molecular assembly in the proteasomal systems (2016)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Satoh, Arunima Sikdar, Kazuyoshi Murata, Toshiya Kozai, Kentaro Ishii, Masanori Noda, Hiroki Kawamura, Hirokazu Yagi, Maho Yagi-Utsumi, Susumu Uchiyama, Takayuki Uchihashi, and Koichi Kato
  • 学会等名: The 7th Japan-Taiwan Joint Meeting on Neutron and X-ray Scattering
  • 発表場所: 京都大学原子炉実験所（大阪府泉南郡）
  • 年月日: 2016-03-12
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] NMRと分子シミュレーションによる糖鎖の三次元構造ダイナミクスの描像 (2016)
  • 著者名/発表者名: 山口拓実
  • 学会等名: 蛋白研セミナー「構造を基盤とする蛋白質科学における未解決問題」
  • 発表場所: 東京大学先端科学技術研究センター（東京都目黒区）
  • 年月日: 2016-03-02
  • 招待講演
• [学会発表] Structural insights into molecular assembly of an archaeal homolog of proteasome assembly chaperone and its partner protein (2016)
  • 著者名/発表者名: Arunima Sikdar, Chihong Song, Toshiya Kozai, Kentaro Ishii, Maho Yagi-Utsumi, Susumu Uchiyama, Takayuki Uchihashi, Kazuyoshi Murata, Tadashi Satoh, and Koichi Kato
  • 学会等名: 平成27年度 日本生物物理学会 中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県、岡崎市)
  • 年月日: 2016-02-29
• [学会発表] 小胞体グルコシダーゼⅡの糖鎖プロセシング機構の構造基盤 (2016)
  • 著者名/発表者名: 年森隆泰，佐藤匡史，野田勝紀，Tong Zhu，内山 進，加藤晃一
  • 学会等名: 平成27年度 日本生物物理学会 中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県、岡崎市)
  • 年月日: 2016-02-29
• [学会発表] 高速 AFM による 20S プロテアソーム関連タンパク質のダイナミクス観察 (2016)
  • 著者名/発表者名: 小財稔矢，佐藤匡史，Arunima Sikdar，矢木宏和，矢木-内海真穂，内橋貴之，安藤敏夫，加藤晃一
  • 学会等名: 平成27年度 日本生物物理学会 中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県、岡崎市)
  • 年月日: 2016-02-29
• [学会発表] Structural views of functional glycans of pharmaceutical interest (2016)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato
  • 学会等名: 6th International Symposium on “Current Trends in Drug Discovery & Research”
  • 発表場所: Lucknow、India
  • 年月日: 2016-02-27
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Chemical synthesis and modification of oligosaccharides toward controlling their biofunctions (2016)
  • 著者名/発表者名: Takumi Yamaguchi
  • 学会等名: DU-JAIST Indo-Japan Symposium on Chemistry of Functional Molecules/ Materials
  • 発表場所: New Delhi、 India
  • 年月日: 2016-02-26
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural insights into the working mechanisms of multi-domain enzymes involved in ER protein quality control (2016)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Satoh, Koya Inagaki, Maho Yagi-Utsumi, Toshiya Kozai, Tong Zhu, Satoru G. Itoh, Hisashi Okumura, Hironari Kamikubo, Takayuki Uchihashi, and Koichi Kato
  • 学会等名: 8th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science: Experiments and Simulation
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2016-02-17
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Design and creation of Lewis X-expressing glycoclusters toward functional analyses of oligosaccharides in membrane systems (2016)
  • 著者名/発表者名: Takumi Yamaguchi, Yan Gengwei, Hirokazu Yagi, and Koichi Kato
  • 学会等名: 8th Japan-Korea Seminars on Biomolecular Science: Experiments and Simulation
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2016-02-16
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural insights into N-glycan-mediated fate-determination of glycoproteins in cells (2016)
  • 著者名/発表者名: Tadashi Satoh, Tong Zhu, Takayasu Toshimori, Kousuke Suzuki, Gengwei Yan, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
  • 学会等名: Pure and Applied Chemistry International Conference (PACCON) 2016
  • 発表場所: Bangkok、Thailand
  • 年月日: 2016-02-11
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 糖鎖の構造生物学 (2016)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一
  • 学会等名: 第57回構造生物応用研究会
  • 発表場所: 東京大学（東京都文京区）
  • 年月日: 2016-02-04
  • 招待講演
• [学会発表] NMR characterization of dynamic conformational ensembles and interactions of carbohydrate chains (2015)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato
  • 学会等名: The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
  • 発表場所: Honolulu、U.S.A.
  • 年月日: 2015-12-17
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Conformational dynamics of high-mannose-type oligosaccharides as studied by NMR spectroscopy combined with molecular dynamics simulation (2015)
  • 著者名/発表者名: Takumi Yamaguchi, Tadashi Satoh, Tong Zhu, and Koichi Kato
  • 学会等名: The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
  • 発表場所: Honolulu、U.S.A.
  • 年月日: 2015-12-17
  • 国際学会
• [学会発表] NMR characterization of conformational transition of amyloid-β peptide promoted on ganglioside clusters (2015)
  • 著者名/発表者名: Maho Yagi-Utsumi, Katsuyuki Nishimura, and Koichi Kato
  • 学会等名: The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies
  • 発表場所: Honolulu、U.S.A.
  • 年月日: 2015-12-15
  • 国際学会
• [学会発表] Structural insights into protein-fate determination in cells (2015)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato, Maho Yagi-Utsumi, Hirokazu Yagi, Saeko Yanaka, Takumi Yamaguchi, and Tadashi Satoh
  • 学会等名: Okazaki Institute for Integrative Bioscience Retreat 2015
  • 発表場所: 岡崎統合バイオサイエンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2015-12-10
  • 招待講演
• [学会発表] Structural insights into working mechanism of PbaA, an archaealhomolog of proteasome assembly chaperone (2015)
  • 著者名/発表者名: Arunima Sikdar, Tadashi Satoh, Kentaro Kumoi, Kentaro Ishii, Maho Yagi-Utsumi, and Koichi Kato
  • 学会等名: Okazaki Institute for Integrative Bioscience Retreat 2015
  • 発表場所: 岡崎統合バイオサイエンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2015-12-09
• [学会発表] Disassembly of the self-assembled, double-ring structure of proteasome α7 homo-tetradecamer by α6 (2015)
  • 著者名/発表者名: Kentaro Ishii, Masanori Noda, Hirokazu Yagi, Ratsupa Thammaporn, Supaporn Seetaha, Tadashi Satoh, Koichi Kato, and Susumu Uchiyama
  • 学会等名: Okazaki Institute for Integrative Bioscience Retreat 2015
  • 発表場所: 岡崎統合バイオサイエンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2015-12-09
• [学会発表] Apoptosis induction of neural stem cells by a synthetic Lewis X-carrying neoglycolipid (2015)
  • 著者名/発表者名: Yan Gengwei, Takumi Yamaguchi, Hirokazu Yagi, and Koichi Kato
  • 学会等名: Okazaki Institute for Integrative Bioscience Retreat 2015
  • 発表場所: 岡崎統合バイオサイエンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2015-12-09
• [学会発表] Functional analysis of enzymes involved in the formation of laminin-binding glycans displayed on α-dystroglycan (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirokazu Yagi and Koichi Kato
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: 神戸ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 招待講演
• [学会発表] 神経変性疾患関連タンパク質と分子シャペロンとの相互作用の構造基盤 (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢木-内海真穂，佐藤匡史，山口拓実，加藤晃一
  • 学会等名: 第38回日本分子生物学会年会、第88回日本生化学会大会 合同大会
  • 発表場所: ポートアイランド（兵庫県神戸市）
  • 年月日: 2015-12-01
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Structural basis of the molecular mechanisms underlying intracellular quality control of glycoproteins mediated by the ER folding sensor enzyme UGGT (2015)
  • 著者名/発表者名: Tong Zhu, 山口拓実, 佐藤匡史, 加藤晃一
  • 学会等名: 糖鎖科学中部拠点第12回「若手の力」フォーラム
  • 発表場所: 名城大学（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-11-28
• [学会発表] 神経変性疾患関連するアミロイド形成タンパク質の多様な分子間相互作用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一
  • 学会等名: 第6回神経科学と構造生物学の融合研究会
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター（愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2015-11-26
  • 招待講演
• [学会発表] Exploration of micro-macro relationships in dynamic ordering of biomolecular systems and their underlying design principles (2015)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato, Tadashi Satoh, Takumi Yamaguchi, and Maho Yagi-Utsumi
  • 学会等名: The 4th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems
  • 発表場所: 九州大学西新プラザ（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-11-23
  • 国際学会
• [学会発表] Crystallographic snapshots of pentameric structure of PbaA, an archaeal homolog of proteasome assembly chaperone (2015)
  • 著者名/発表者名: Arunima Sikdar, Tadashi Satoh, Kentaro Kumoi, Kentaro Ishii, Maho Yagi-Utsumi, and Koichi Kato
  • 学会等名: The 4th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems
  • 発表場所: 九州大学西新プラザ（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-11-23
  • 国際学会
• [学会発表] Structural insights into intracellular quality control of glycoproteins mediated by their glucosylation (2015)
  • 著者名/発表者名: Tong Zhu, Tadashi Satoh, Takumi Yamaguchi, and Koichi Kato
  • 学会等名: The 4th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems
  • 発表場所: 九州大学西新プラザ（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-11-22
  • 国際学会
• [学会発表] Crystallographic snapshots of pentameric structure of PBAA, an archaeal homolog of proteasome assembly chaperone (2015)
  • 著者名/発表者名: Kentaro Ishii, Masanori Noda, Hirokazu Yagi, Ratsupa Thammaporn, Supaporn Seetaha, Tadashi Satoh, Koichi Kato, and Susumu Uchiyama
  • 学会等名: The 4th International Symposium on Dynamical Ordering of Biomolecular Systems
  • 発表場所: 九州大学西新プラザ（福岡県福岡市）
  • 年月日: 2015-11-22
  • 国際学会
• [学会発表] Creation of a neoglycolipid inducing cell type-specific apoptosis (2015)
  • 著者名/発表者名: Gengwei Yan, Takumi Yamaguchi, Hirokazu Yagi, and Koichi Kato
  • 学会等名: The 7th Asian Community of Glycoscience and Glycotechnology (ACGG) Conference
  • 発表場所: ホテル大観荘（宮城県松島市）
  • 年月日: 2015-11-13
  • 国際学会
• [学会発表] 分岐鎖糖鎖の配座空間探査における常磁性効果の活用Application of paramagnetic effects for exploring conformational spaces of branched oligosaccharides (2015)
  • 著者名/発表者名: 山口拓実，Tong Zhu，佐藤匡史，加藤晃一
  • 学会等名: 第54回 NMR討論会
  • 発表場所: 千葉工業大学（千葉県習志野市）
  • 年月日: 2015-11-08
• [学会発表] NMR views of physiological and pathological roles of glycanｓ (2015)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato
  • 学会等名: The 47th Annual Meeting of Korean Magnetic Resonance Society
  • 発表場所: Buyeo,Korea
  • 年月日: 2015-11-05
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] フコース転移酵素によるキャリータンパク質特異的な LewisX 糖鎖修飾機構の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤恭崇，矢木宏和，加藤晃一
  • 学会等名: 日本病院薬剤師会東海ブロック・日本薬学会東海支部合同学術大会2015
  • 発表場所: 金城学院大学（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-11-01
• [学会発表] FcγⅢ受容体との相互作用における抗体のダイナミックな構造変化 (2015)
  • 著者名/発表者名: 與語理那，矢木宏和，谷中冴子，矢木真穂，加藤晃一
  • 学会等名: 日本病院薬剤師会東海ブロック・日本薬学会東海支部合同学術大会2015
  • 発表場所: 金城学院大学（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-11-01
• [学会発表] X線結晶構造解析によるマウスIgG2b-Fc と proteinA との相互作用解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 谷口雄基，矢木宏和，Kiattawee Choowongkomon，佐藤匡史，加藤晃一
  • 学会等名: 日本病院薬剤師会東海ブロック・日本薬学会東海支部合同学術大会2015
  • 発表場所: 金城学院大学（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-11-01
• [学会発表] 糖鎖の構造生命科学 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一
  • 学会等名: 名古屋大学IGERセミナー
  • 発表場所: 名古屋大学（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-10-26
  • 招待講演
• [学会発表] 生命分子システムの動的秩序の探査・創生・展開 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一
  • 学会等名: 第13回 糖鎖科学コンソーシアムシンポジウム
  • 発表場所: 愛知県産業労働センターウインクあいち（愛知県名古屋市）
  • 年月日: 2015-10-19
  • 招待講演
• [学会発表] Fc受容体との相互作用における抗体の構造変化から抗体の足場としての機能を考える (2015)
  • 著者名/発表者名: 與語理那，矢木宏和，谷中冴子，矢木真穂，加藤晃一
  • 学会等名: 第2回「動的秩序と機能」若手研究会
  • 発表場所: ホテルたつき（愛知県蒲郡市）
  • 年月日: 2015-10-07
• [学会発表] ESI-MS analysis for the stoichiometry of proteasome subunit complex (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井健太郎，矢木宏和，加藤晃一，内山 進
  • 学会等名: 第2回「動的秩序と機能」若手研究会
  • 発表場所: ホテルたつき（愛知県蒲郡市）
  • 年月日: 2015-10-06
• [学会発表] pH-dependent assembly and segregation of the coiled-coil segments of yeast putative cargo receptors Emp46p and Emp47p (2015)
  • 著者名/発表者名: Kentaro Ishii, Hiroki Enda, Masanori Noda, Megumi Kajino, Akemi Kim, Eiji Kurimoto, Ken Sato, Akihiko Nakano, Yuji Kobayashi, Hirokazu Yagi, Susumu Uchiyama, and Koichi Kato
  • 学会等名: 第53回日本生物物理学会年会
  • 発表場所: 金沢大学（石川県金沢市）
  • 年月日: 2015-09-15
  • 国際学会
• [学会発表] ネオ糖脂質による神経幹細胞に対するアポトーシス誘導 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山口 拓実，Yan Gengwei，矢木 宏和，加藤 晃一
  • 学会等名: 第9回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 熊本大学（熊本県熊本市）
  • 年月日: 2015-09-10
• [学会発表] Structural Views of Glycan Functions in Physiological and Pathological Contexts (2015)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato, Maho Yagi-Utsumi, Takumi Yamaguchi, Hirokazu Yagi, and Tadashi Sat
  • 学会等名: 9th International Conference on Proteoglycans and 10th Pan-Pacific Connective Tissue (ICP&PPCTSS 2015)
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 2015-08-24
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] NMR Views of Fate Determination and Functional Regulation of Proteins Mediated by Sugar Chains (2015)
  • 著者名/発表者名: Koichi Kato
  • 学会等名: The 19th International Society of Magnetic Resonance (ISMAR 2015)
  • 発表場所: Shanghai、China
  • 年月日: 2015-08-20
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 生命分子システムにおける動的秩序形成と高次機能発現 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一，山口拓実，矢木真穂，栗原顕輔，佐藤匡史
  • 学会等名: 新学術領域「動的秩序と機能」平成27年度全体班会議
  • 発表場所: 兵庫県立淡路国際夢舞台会議場（兵庫県淡路市）
  • 年月日: 2015-08-05
  • 招待講演
• [学会発表] 神経系における糖鎖の機能解明のための糖鎖プロファイリング技術の開発とその応用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢木宏和
  • 学会等名: 第34回日本糖質学会年会
  • 発表場所: 東京大学（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-08-01
• [学会発表] 生命分子システムの動的秩序形成の探査・創生・展開 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一
  • 学会等名: 第1回秩序化分子システム仙台ワークショップ
  • 発表場所: ホテルニュー水戸屋（宮城県仙台市）
  • 年月日: 2015-07-11
  • 招待講演
• [学会発表] ESI-MSによるプロテアソームサブユニット複合体の化学量論の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井健太郎，矢木宏和，加藤晃一，内山 進
  • 学会等名: 第42回BMSコンファレンス
  • 発表場所: 岐阜グランドホテル(岐阜県岐阜市）
  • 年月日: 2015-07-07
• [学会発表] ガングリオシドクラスターを舞台とする神経変性疾患関連タンパク質の構造転移 (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢木-内海真穂，加藤晃一
  • 学会等名: 第15回 日本蛋白質科学会年会
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-26
  • 招待講演
• [学会発表] 糖鎖の3次元構造ダイナミクスと分子間相互作用 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一
  • 学会等名: 第2回蛋白質工学研究会ワークショップ
  • 発表場所: あわぎんホール（徳島県徳島市）
  • 年月日: 2015-06-23
  • 招待講演
• [学会発表] Binding Free Energies of Non-nucleoside Inhibitor Binding to HIV-1 Reverse Transcriptase (2015)
  • 著者名/発表者名: Ratsupa Thammaporn, Patchreenart Saparpakorn, Witcha Treesuwan, Maho Yagi-Utsumi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato, and Supa Hannongbua
  • 学会等名: The 19th International Annual Symposium on Computational Science and Engineering (ANSCSE19)
  • 発表場所: Ubon Ratchathani ,Thailand
  • 年月日: 2015-06-17 – 2015-06-19
  • 国際学会
• [学会発表] Native MSによるプロテアソームα7サブユニットの自己会合状態の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 石井健太郎，矢木宏和，加藤晃一，内山 進
  • 学会等名: 第63回質量分析総合討論会
  • 発表場所: つくば国際会議場（茨城県つくば市）
  • 年月日: 2015-06-17
• [学会発表] Paramagnetic Lanthanide-tagging for NMR Characterization of The Conformational Dynamics of Oligosaccharides (2015)
  • 著者名/発表者名: Takumi Yamaguchi and Koichi Kato
  • 学会等名: IMS Asian International Symposium "Supramolecular Dynamics at the Interface of Chemistry and Biology"
  • 発表場所: 岡崎コンファレンスセンター(愛知県岡崎市）
  • 年月日: 2015-06-12
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] NMR-based structural validation and SPR-based functional analysis of therapeutic human antibody produced in transgenic Nicotiana benthamiana cultivated by hydroponics in closed plant factory (2015)
  • 著者名/発表者名: Hirokazu Yagi, Noriho Fukuzawa, Yasushi Tasaka, Kouki Matsuo, Ying Zhang, Takumi Yamaguchi, Sachiko Kondo, Shiori Nakazawa, Noritaka Hashii, Nana Kawasaki, Takeshi Matsumura, and Koichi Kato
  • 学会等名: Plant-Based Vaccines, Antibodies & Biologics
  • 発表場所: Lausanne、Switzerland
  • 年月日: 2015-06-08 – 2015-06-10
  • 国際学会
• [学会発表] プロテインジスルフィドイソメラーゼの基質認識の構造基盤の解明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢木真穂，佐藤匡史，加藤晃一
  • 学会等名: 第79回日本生化学会中部支部例会
  • 発表場所: 信州大学（長野県松本市）
  • 年月日: 2015-05-23
• [学会発表] 糖鎖を見る (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤晃一
  • 学会等名: 第4回バイオイメージング研究会
  • 発表場所: 東京大学（東京都文京区）
  • 年月日: 2015-05-08
  • 招待講演
• [図書] Molecular Science of Fluctuations Toward Biological Functions (2016)
  • 著者名/発表者名: M. Yagi-Utsumi, T. Yamaguchi, R. Kitahara, K. Kato
  • 総ページ数: （87-103）
  • 出版者: Springer (Japan)
• [図書] 糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック～創薬・医療から食品開発まで～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 佐藤匡史, 加藤晃一
  • 総ページ数: 628（144-149）
  • 出版者: エヌ・ティー・エス
• [図書] 糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック～創薬・医療から食品開発まで～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 矢木宏和, 加藤晃一
  • 総ページ数: 628（243-249）
  • 出版者: エヌ・ティー・エス
• [図書] 糖鎖の新機能開発・応用ハンドブック～創薬・医療から食品開発まで～ (2015)
  • 著者名/発表者名: 山口拓実, 加藤晃一
  • 総ページ数: 628（265-271）
  • 出版者: エヌ・ティー・エス
• [産業財産権] 未分化細胞のアポトーシス誘導剤 (2015)
  • 発明者名: 加藤晃一, 矢木宏和, 山口拓実, ヤンゲンエイ
  • 権利者名: 公立大学法人名古屋市立大学,大学共同利用機関法人自然科学研究機構
  • 産業財産権種類: 特許
  • 産業財産権番号: 2015-102175
  • 出願年月日: 2015-05-19