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2015 年度 実績報告書

高度化した一分子蛍光計測によるタンパク質の構造形成運動の解明

計画研究

研究領域理論と実験の協奏による柔らかな分子系の機能の科学
研究課題/領域番号 25104007
研究機関東北大学

研究代表者

高橋 聡  東北大学, 多元物質科学研究所, 教授 (30283641)

研究期間 (年度) 2013-06-28 – 2018-03-31
キーワードタンパク質 / フォールディング / プロテインAのBドメイン / 一分子ソーター
研究実績の概要

本研究は、先端的な分光計測法によりタンパク質のフォールディング過程や機能を理解し、新規構造をデザインするために計画した。本年度は各課題について以下の成果を挙げた。
1.マイクロ秒分解一分子観察法によるタンパク質の高速度ダイナミクスの観察 10マイクロ秒の時間分解能で一分子蛍光を観測するライン共焦点顕微鏡を用い、タンパク質の高速ダイナミクスを追跡した。プロテインAのBドメインについて、一分子蛍光観察を行った結果を報告した。ユビキチンの折り畳み転移の一分子蛍光観察を行い、ユビキチンの変性状態が比較的不均一な集合体であることを示した。また、一分子蛍光観察の障害となっていた試料のフローセル表面への吸着現象を、フローセル内面をMPCポリマーにて被覆することで大幅に低下できることを見いだした。青色蛍光タンパク質(BFP)に二色の蛍光色素ラベルを施し、変性したBFPと分子シャペロンGroELとの間の相互作用について一分子観測を進め、変性させたBFPとGroELの複合体のFRET効率の計測に成功した。ライン共焦点顕微鏡に新しい光検出器であるHPDを導入する装置開発を進めた。さらに、βラクトグロブリンのフォールディング過程についての報告を行った。
2.タンパク質デザインを目指した一分子ソーターの開発 タンパク質ライブラリーを提示したファージを一分子ごとに観測し、目的の分光特性を持つファージをセレクトすることで、タンパク質デザインの新しい方法を開発する実験を継続した。蛍光ファージを感度よく検出するための取り組みを行った。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

本年度は、一分子蛍光測定を難しくする要素として長い間の課題であったタンパク質の吸着問題を防止する方法を発見したことにより、研究の大幅な進展が見られた。すなわち、ユビキチンについての一分子測定をほぼ完了し、論文投稿の直前の状態になっている。BFPについての実験も大きく進み、論文化を検討中である。さらに、二つの溶液を今後し、混合直後の一分子の振る舞いを調べる研究も進めている。このように、平成27年度の研究は計画以上に大きく進展したと考えている。

今後の研究の推進方策

平成28年度は、以下のように研究をすすめる予定である。第一に、ユビキチンを題材とした一分子蛍光測定の結果を投稿する。第二に、ユビキチンを題材として、フォールディング反応を溶液混合で引き起こした直後の構造変化を一分子観測する実験を進める。第三に、青色蛍光タンパク質が分子シャペロンの助けを借りて構造形成する過程の一分子測定を進める。第四に、プロテインLを題材としたフォールディング過程の一分子測定を進める。第五に、一分子ソーターを用いたファージ選別実験を進める。このように、これまでの方針を堅持し本研究の完成を目指す。

  • 研究成果

    (22件)

すべて 2016 2015

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 4件、 謝辞記載あり 4件) 学会発表 (18件) (うち国際学会 4件、 招待講演 5件)

  • [雑誌論文] Highly Collapsed Conformation of the Initial Folding Intermediates of β-Lactoglobulin with Non-Native α-Helix2015

    • 著者名/発表者名
      Tsuyoshi Konuma, Kazumasa Sakurai, Masanori Yagi, Yuji Goto, Teturo Fujisawa, Satoshi Takahashi
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 427 ページ: 3158-3165

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2015.07.018

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] One-dimensional sliding of p53 along DNA is accelerated in the presence of Ca2+ or Mg2+ at millimolar concentrations2015

    • 著者名/発表者名
      Agato Murata, Yuji Ito, Risa Kashima, Saori Kanbayashi, Kei Nanatani, Chihiro Igarashi, Masaki Okumura, Kenji Inaba, Takashi Tokino, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology

      巻: 427 ページ: 2663-2678

    • DOI

      10.1016/j.jmb.2015.06.016

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Complexity of the Folding Transition of the B domain of Protein A Revealed by the High-Speed Tracking of Single-Molecule Fluorescence Time Series2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata ,Munehito Arai, and Satoshi Takahashi
    • 雑誌名

      The Journal of Physical Chemistry B

      巻: 119 ページ: 6081-6091

    • DOI

      10.1021/acs.jpcb.5b00414

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [雑誌論文] Where the complex things are: single molecule andensemble spectroscopic investigations of protein folding dynamics2015

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Tkahahshi, Kiyoto Kamagata, Hiroyuki Oikawa
    • 雑誌名

      Current Opinion in Structural Biology

      巻: 36 ページ: 1-9

    • DOI

      10.1016/j.sbi.2015.11.006

    • 査読あり / 謝辞記載あり
  • [学会発表] Direct observation of target DNA recognition of p53 mutants by single-molecule fluorescence microscopy2016

    • 著者名/発表者名
      Itoh, Yuji, Agato Murata, Seiji Sakamoto, Kei Nanatani, Chihiro Igarashi, Takehiko Wada, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      京都府京田辺市・同志社大学
    • 年月日
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [学会発表] Effect of Linker Elongation in the DNA-binding of Tumor Suppressor p532016

    • 著者名/発表者名
      Dwiky Rendra Graha Subekti, Agato Murata ,Yuji Itoh ,Chihiro Igarashi Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      京都府京田辺市・同志社大学
    • 年月日
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [学会発表] 1分子FRET測定によるシャペロニンGroELのおりたたみ補助機構の解明2016

    • 著者名/発表者名
      松田智紗・吉田文・元島史尋・小井川浩之・鎌形清人・吉田賢右・高橋聡
    • 学会等名
      日本化学会第96春季年会
    • 発表場所
      京都府京田辺市・同志社大学
    • 年月日
      2016-03-24 – 2016-03-27
  • [学会発表] Dynamics of protein folding studied by single molecule fluorescence measurements at microsecond resolution2016

    • 著者名/発表者名
      Satoshi Takahashi, Masataka Saito, Kiyoto Kamagata and Hiroyuki OIkawa
    • 学会等名
      Recent Advances in Molecular Spectroscopy: Fundamentals and Applications in Materials and Biolgy 2016
    • 発表場所
      インド・ハイデラバード
    • 年月日
      2016-03-02 – 2016-03-04
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Rapid sample flow strategy for the ultrafast tracking of single molecule fluorescence time series2015

    • 著者名/発表者名
      Satsohi Takahashi and Hiroyuki Oikawa
    • 学会等名
      PACIFICHEM 2015
    • 発表場所
      米国・ハワイ
    • 年月日
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Complex folding transition of the B domain of protein A investigated by the high-speed measurement of single-molecule FRET time series2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Oikawa, Kiyoto Kamagata, Munehito Arai and Satsohi Takahashi
    • 学会等名
      PACIFICHEM 2015
    • 発表場所
      米国・ハワイ
    • 年月日
      2015-12-15 – 2015-12-20
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Dynamiccs of protein folding studied by single molecule fluorescence time series measurements at microsecond resolution2015

    • 著者名/発表者名
      Satsohi Takahashi, Masataka Saito, Kiyoto Kamagata and Hiroyuki Oikawa
    • 学会等名
      39th Annual ASB Conference
    • 発表場所
      オーストラリア・アーミデール
    • 年月日
      2015-11-22 – 2015-11-25
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] ユビキチンの折り畳みダイナミクスの一分子蛍光分光測定2015

    • 著者名/発表者名
      齊藤雅嵩, Chen Eric H.-L., Chen Po-Ting, Chen Rita P.-Y., 鎌形清人, 小井川浩之, 高橋聡
    • 学会等名
      第9回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京都大田区・東京工業大学
    • 年月日
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [学会発表] マイクロ秒分解一分子FRET測定よるタンパク質折り畳みダイナミクスの追跡2015

    • 著者名/発表者名
      小井川浩之, 新井宗仁, 深澤宏仁, 横田浩章, 井出徹, 高橋聡
    • 学会等名
      第9回分子科学討論会
    • 発表場所
      東京都大田区・東京工業大学
    • 年月日
      2015-09-16 – 2015-09-19
  • [学会発表] 一分子蛍光観測法によるがん抑制蛋白質p53のスライディング運動の解明2015

    • 著者名/発表者名
      村田崇人、伊藤優志、五十嵐千裕、Dwiky Subekti Rendra Graha、高橋聡、鎌形清人
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      石川県金沢市・金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [学会発表] 一分子蛍光分光法によって観測されたユビキチンの変性状態の不均一性2015

    • 著者名/発表者名
      齊藤雅嵩、Chen Eric H.-L., Chen Po-Ting, Chen Rita P.-Y., 鎌形清人, 小井川浩之, 高橋聡
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      石川県金沢市・金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [学会発表] DNA結合蛋白質の単分子蛍光観察のためのDNA整列技術の開発2015

    • 著者名/発表者名
      五十嵐千裕、村田崇人、高橋聡、鎌形清人
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      石川県金沢市・金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [学会発表] Observation of the Search Dynamics of p53 Mutants for the Target DNA Sequence by Single-molecule Fluorescence Microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Yuji Itoh, Agato Murata, Seiji Sakamoto, Kei Nanatani, Takehiko Wada, Satoshi Takahashi, and Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      石川県金沢市・金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [学会発表] Tracking microsecond single-molecule FRET dynamics on the fast protein folding by the line-confocal microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Hiroyuki Oikawa, Munehito Arai, Atsuhito Fukasawa, Hiroaki Yokota , Toru Ide , Satoshi Takahashi
    • 学会等名
      第53回日本生物物理学会年会
    • 発表場所
      石川県金沢市・金沢大学
    • 年月日
      2015-09-13 – 2015-09-15
  • [学会発表] 一分子蛍光観測法によるがん抑制蛋白質p53のスライディング運動の解明2015

    • 著者名/発表者名
      村田崇人・伊藤優志・五十嵐千裕・高橋聡・鎌形清人
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      徳島県徳島市・あわぎんホール
    • 年月日
      2015-06-24 – 2015-06-26
  • [学会発表] 一分子蛍光顕微鏡によるp53変異体の標的配列探索ダイナミクスの観察2015

    • 著者名/発表者名
      伊藤優志・村田崇人・坂本清志・七谷圭・和田健彦・高橋聡・鎌形清人
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      徳島県徳島市・あわぎんホール
    • 年月日
      2015-06-24 – 2015-06-26
  • [学会発表] Investigation of the Role of Intrinsically Disordered Region in p53 Using Single Molecule Fluorescence Microscopy2015

    • 著者名/発表者名
      Dwiky Rendra Graha Subekti, Agato Murata, Chihiro Igarashi, Yuji Ito, Satoshi Takahashi, and Kiyoto Kamagata
    • 学会等名
      第16回日本蛋白質科学会年会
    • 発表場所
      徳島県徳島市・あわぎんホール
    • 年月日
      2015-06-24 – 2015-06-26
  • [学会発表] 一分子蛍光分光法によるタンパク質のフォールディング研究2015

    • 著者名/発表者名
      高橋聡
    • 学会等名
      機能物性融合科学研究会シリーズ2ソフトダイナミクス
    • 発表場所
      千葉県柏市・東京大学物性研究所
    • 年月日
      2015-04-02 – 2015-04-03
    • 招待講演

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公開日: 2017-01-06  

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