光応答性タンパク質の機能転換が明らかにする柔らかな構造機能相関

2015 年度 実績報告書

• 研究領域: 理論と実験の協奏による柔らかな分子系の機能の科学
• 研究課題/領域番号: 25104009
• 研究機関: 名古屋工業大学
• 研究代表者: 神取 秀樹 名古屋工業大学, 工学(系)研究科(研究院), 教授 (70202033)
• 研究分担者: 須藤 雄気 岡山大学, 医歯(薬)学総合研究科, 教授 (10452202)
• 研究期間 (年度): 2013-06-28 – 2018-03-31
• キーワード: 機能転換 / アミノ酸置換 / ロドプシン / イオンポンプ / フラビンタンパク質

研究実績の概要

多くの生体分子は共通の構造をもとに多彩な機能を演出しており、例えばロドプシンは共通の構造構築から光センサー、ポンプ、チャネル機能が発現する。進化の中で最適化された固有の機能は固有の構造によるものと考えられがちであるが、私たちはメカニズムを研究する中でロドプシンの機能を転換することにも成功してきた。このような機能転換の達成はタンパク質の構造と機能が柔軟に共役していることを示唆する。本研究課題において我々は、機能の創造をテーマとしてロドプシンやフラビンタンパク質など光応答性タンパク質を対象とした研究を行っている。平成２７年度は以下の成果が得られた。
新たな機能をもった分子を自然界から見出す代表的な例として、我々が3年前に発見した光駆動ナトリウムポンプを挙げることができる。今年度、結晶構造を決定し、輸送モデルを提唱することができた。Nature誌にArticleとして掲載した本論文中では、構造解析だけに留まらず、光駆動カリウムポンプの創成にも成功している。カリウムポンプの創成は、イオン選択性フィルターが細胞質側表面に存在することを明らかにする過程で実現したのであるが、その研究をさらに推進した結果、より大きなルビジウムやセシウムイオンをポンプするタンパク質の創成にも成功した。セシウムイオンを光によって輸送できるシステムは世の中に存在しなかったため、放射性セシウム回収につながる基盤技術の開発として注目され、多くの新聞で報道された。
光駆動プロトン・ナトリウム・クロライドポンプの間の機能転換についても、限られた変異導入により3通りの機能転換に成功した。一方、残る3通りは実現せず、非対称な機能転換がタンパク質の進化と関係する可能性を論文発表することができた。
フラビンタンパク質研究においては2種類のDNA光回復酵素の機能転換を試みた結果、同様に機能転換は非対称になることがわかった。

現在までの達成度 (区分)

1: 当初の計画以上に進展している

理由

Nature誌に発表した論文中では、構造決定だけに留まらず、機能解析と合わせた輸送モデルの提案、光遺伝学応用の達成に加えて、光駆動カリウムポンプの創成を実現した。本領域で私たちが目指しているのは、新しい機能をもったタンパク質を自然から見つけ出す一方、アミノ酸の変異を用いて新たなタンパク質の機能を創成することであるが、光駆動ナトリウムポンプの発見（Nature Commun. 2013）は前者の、光駆動カリウムポンプの創成（Nature 2015）は後者のハイライトと言うことができる。この方向の研究をさらに進めて実現した光駆動セシウムポンプの創成は、放射性セシウムの回収という全くことなる発想からの応用につながる研究として評価されており、当初の計画以上の成果と言うことができる。
光駆動ナトリウムポンプについては、領域内の共同研究も活発に行っており、実際に理研の田原グループとの共同研究論文を発表することができた。

今後の研究の推進方策

計画は順調に進んでおり、この方向での研究を進める。特に、最も中心的な研究課題である光駆動イオンポンプやDNA光回復酵素の機能転換を期間の前半で達成することができたため、今後はメカニズムを解明したいと考えている。また国内、国際的な共同研究や連携も重要であり、積極的に進めたい。

研究成果

• [雑誌論文] Single hydrogen bond donation from flavin N5 to proximal asparagine ensures FAD reduction in DNA photolyase (2016)
  • 著者名/発表者名: I M. Mahaputra Wijaya, T. Domratcheva, T. Iwata, E. D. Getzoff, H. Kandori
  • 雑誌名: J. Am. Chem. Soc. 巻: 138 ページ: 4368-4376
  • DOI: 10.1021/jacs.5b10533
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Asymmetric functional conversion of eubacterial light-driven ion pumps (2016)
  • 著者名/発表者名: K. Inoue, Y. Nomura, H. Kandori
  • 雑誌名: J. Biol. Chem. 巻: in press ページ: in press
  • DOI: jbc.M116.716498
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural changes of the active center during the photoactivation of Xenopus (6-4) photolyase (2016)
  • 著者名/発表者名: D. Yamada, J. Yamamoto, Y. Zhang, T. Iwata, K. Hitomi, E. D. Getzoff, S. Iwai, H. Kandori
  • 雑誌名: Biochemistry 巻: 55 ページ: 715-723
  • DOI: 10.1021/acs.biochem.5b01111
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Light-induced structural changes during early photo-intermediates of the eubacterial Cl− pump Fulvimarina rhodopsin observed by FTIR difference spectroscopy (2016)
  • 著者名/発表者名: F. H. M. Koua, H. Kandori
  • 雑誌名: FRC Advances 巻: 不明 ページ: 不明
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Mutant of a light-driven sodium ion pump can transport cesium ions (2016)
  • 著者名/発表者名: M. Konno, Y. Kato, H. E. Kato, K. Inoue, O. Nureki, H. Kandori
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. Lett. 巻: 7 ページ: 51-55
  • DOI: 10.1021/acs.jpclett.5b02385
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 光駆動ナトリウムポンプのメカニズム (2016)
  • 著者名/発表者名: 吉住 玲、神取秀樹
  • 雑誌名: バイオサイエンスとインダストリー(B&I) 巻: 不明 ページ: 74 , 37-39
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 「光遺伝学 (オプトジェネティクス)」の特集によせて (2016)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 雑誌名: 日本レーザー医学会誌 巻: 不明 ページ: 36, 450
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Kinetic analysis of H+-Na+ selectivity in a light-driven Na+-pumping rhodopsin (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kato , K. Inoue, H. Kandori
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. Lett. 巻: 6 ページ: 5111-5115
  • DOI: 10.1021/acs.jpclett.5b02371
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] A new group of eubacterial light-driven retinal-binding proton pumps with an unusual cytoplasmic proton donor (2015)
  • 著者名/発表者名: A. Harris, M. Ljumovic, A. N. Bondar, Y. Shibata, S. Ito, K. Inoue, H. Kandori, L. S. Brown
  • 雑誌名: Biochim. Biophys. Acta 巻: 1847 ページ: 1518-1529
  • DOI: 10.1016/j.bbabio.2015.08.003
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural role of two histidines in the (6-4) photolyase reaction (2015)
  • 著者名/発表者名: D. Yamada , T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, T. Todo, S. Iwai, E. D. Getzoff, H. Kandori
  • 雑誌名: Biophys. Physicobiol. 巻: 不明 ページ: 不明
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ultrafast photoreaction dynamics of a light-driven sodium-ion-pumping retinal protein from Krokinobacter eikastus revealed by femtosecond time-resolved absorption spectroscopy (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Tahara, S. Takeuchi, R. Abe-Yoshizumi, K. Inoue, H. Ohtani, H. Kandori, T. Tahara
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. Lett. 巻: 6 ページ: 4481-4486
  • DOI: 10.1021/acs.jpclett.5b01994
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 100 fs photo-isomerization with vibrational coherences but low quantum yield in Anabaena Sensory Rhodopsin (2015)
  • 著者名/発表者名: A. Cheminal, J. Léonard, S. Y. Kim, K. H. Jung, H. Kandori, S. Haacke
  • 雑誌名: Phys. Chem. Chem. Phys. 巻: 17 ページ: 25429-25439
  • DOI: 10.1039/c5cp04353k
  • 査読あり / 国際共著 / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Specific interactions between alkali metal cations and the KcsA channel studied using ATR-FTIR spectroscopy (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Furutani*, H. Shimizu, Y. Asai, S. Oiki*, H. Kandori
  • 雑誌名: Biophys. Physicobiol 巻: unknown ページ: unknown
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] The role of the NDQ motif in sodium-pumping rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Inoue , M. Konno, R. Abe-Yoshizumi, H. Kandori
  • 雑誌名: Angew. Chem. Int. Ed. 巻: 54 ページ: 11536-11539
  • DOI: 10.1002/anie.201504549
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Structural basis for Na+ transport mechanism by a light-driven Na+ pump (2015)
  • 著者名/発表者名: H. E. Kato, K. Inoue, R. Abe-Yoshizumi, Y. Kato, H. Ono, M. Konno, S. Hososhima, T. Ishizuka, M. R. Hoque, H. Kunitomo, J. Ito, S. Yoshizawa, K. Yamashita, M. Takemoto, T. Nishizawa, R. Taniguchi, K. Kogure, A. D. Maturana, Y. Iino, H. Yawo, R. Ishitani, H. Kandori*, O. Nureki
  • 雑誌名: Nature 巻: 521 ページ: 48-53
  • DOI: 10.1038/nature14322
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] base between primate green- and red-sensitive pigments: New insight into color tuning mechanism (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Katayama , T. Okitsu, H. Imai, A. Wada, H. Kandori
  • 雑誌名: J. Phys. Chem. Lett. 巻: 6 ページ: 1130-1133
  • DOI: 10.1021/acs.jpclett.5b00291
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] 光受容タンパク質によるエネルギー変換機構 (2015)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 雑誌名: 生物物理 55 巻: 不明 ページ: 291-298
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Ion-pumping microbial rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 雑誌名: Front. Mol. Biosci. 52 巻: 不明 ページ: 1-11
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] FTIR study of primate color visual pigments (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Katayama , H. Kandori
  • 雑誌名: BIOPHYSICS 巻: 不明 ページ: 11, 61-66
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Light-driven ion-translocating rhodopsins in marine bacteria (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Inoue , Y. Kato, H. Kandori
  • 雑誌名: Trends Microbiol. 23 巻: 不明 ページ: 91-98
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [雑誌論文] Infrared spectroscopic studies on the V-ATPase (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori*, Y. Furutani, T. Murata
  • 雑誌名: Biochim. Biophys. Acta 1847 巻: 不明 ページ: 134-141
  • DOI: unknown
  • 査読あり / 謝辞記載あり
• [学会発表] Unique hydrogen bonding structure of cation binding site in light-driven sodium pumping rhodopsin (2016)
  • 著者名/発表者名: S. Ito, S. Sugita, R. Abe-Yoshizumi, K. Inoue, T. Iwata, M. Iwaki, H. Kandori
  • 学会等名: 日本化学会第96春季年会
  • 発表場所: 京田辺
  • 年月日: 2016-03-24 – 2016-03-27
• [学会発表] Structure, function and application of novel bacterial rhodopsins (2016)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: 7th OCARINA International Symposium
  • 発表場所: Osaka
  • 年月日: 2016-03-17 – 2016-03-18
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 光駆動ナトリウムポンプのH+‐Na+選択性の過渡吸収測定による解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 加藤善隆、井上圭一、神取秀樹
  • 学会等名: 日本生物物理学会中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2016-02-29 – 2016-02-29
• [学会発表] フラビンタンパク質の光電子移動 (2016)
  • 著者名/発表者名: 上田のぞみ、小野友紀子、岩田達也、岩城雅代、神取秀樹
  • 学会等名: 日本生物物理学会中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2016-02-29 – 2016-02-29
• [学会発表] DNA光修復能を持つDNA酵素の赤外分光解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 倉橋雄飛, 岩田達也, 神取秀樹
  • 学会等名: 日本生物物理学会 中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2016-02-29 – 2016-02-29
• [学会発表] 真正細菌のクロライドポンプ、プロトンポンプの機能転換および光反応の解析 (2016)
  • 著者名/発表者名: 野村祐梨香、井上圭一、神取秀樹
  • 学会等名: 日本生物物理学会中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2016-02-29 – 2016-02-29
• [学会発表] 海洋性細菌Nonlabens dokdonesis DSW-6のもつロドプシン (2016)
  • 著者名/発表者名: 橋本優一、吉住 玲、神取秀樹
  • 学会等名: 日本生物物理学会中部支部講演会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2016-02-29 – 2016-02-29
• [学会発表] 光で陽イオンを運ぶ (2016)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 学会等名: 茨城大学大学院理工学研究科ミニシンポジウム「量子生命科学を切り拓く」
  • 発表場所: 水戸
  • 年月日: 2016-02-22 – 2016-02-22
  • 招待講演
• [学会発表] 光で陽イオンを運ぶ (2016)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 学会等名: 理化学研究所「分子システム研究」研究報告会
  • 発表場所: 和光
  • 年月日: 2016-02-03 – 2016-02-03
  • 招待講演
• [学会発表] Mechanism of active ion-transport by light (2016)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: Gordon Research Conference on "Photosensory Receptors & Signal Transduction”
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-24 – 2016-01-29
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Engineering potassium and cesium pumping rhodopsin from KR2 (2016)
  • 著者名/発表者名: M. Konno, Y. Kato, H. E. Kato, K. Inoue, O. Nureki, H. Kandori
  • 学会等名: Gordon Research Conference on "Photosensory Receptors & Signal Transduction”
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-24 – 2016-01-29
  • 国際学会
• [学会発表] Specific hydrogen bonding network of Na+ binding site in light-driven Na+ pumping rhodopsin (2016)
  • 著者名/発表者名: S. Ito, S. Sugita, R. Abe-Yoshizumi, T. Iwata, K. Inoue, M. Iwaki, H. Kandori
  • 学会等名: Gordon Research Conference on "Photosensory Receptors & Signal Transduction”
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-24 – 2016-01-29
  • 国際学会
• [学会発表] Optical activation of G-protein by microbial rhodopsin chimera (2016)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, T. Yamashita, R. Abe-Yoshizumi, M. Tanaka, K. Inoue, K. Sasaki, Y. Shichida, H.
  • 学会等名: Gordon Research Conference on "Photosensory Receptors & Signal Transduction”
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-24 – 2016-01-29
  • 国際学会
• [学会発表] Chloride binding site of monkey green studied by light-induced difference FTIR spectroscopy (2016)
  • 著者名/発表者名: S. Nakamura, K. Katayama, M. Iwaki, H. Imai, H. Kandori
  • 学会等名: Gordon Research Conference on "Photosensory Receptors & Signal Transduction
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-24 – 2016-01-29
  • 国際学会
• [学会発表] Engineering potassium and cesium pumping rhodopsin from KR2 (2016)
  • 著者名/発表者名: M. Konno, Y. Kato, H. E. Kato, K. Inoue, O. Nureki, H. Kandori
  • 学会等名: Gordon Research Seminar on "Photosensory Receptors & Signal Transduction"
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-23 – 2016-01-24
  • 国際学会
• [学会発表] ATR-FTIR Spectroscopy Reveal the Specific Hydrogen Bonding Network of Na+ binding site in Na+ Pumping Rhodopsin (2016)
  • 著者名/発表者名: S. Ito, S. Sugita, R. Abe-Yoshizumi, T. Iwata, K. Inoue, M. Iwaki, H. Kandori
  • 学会等名: Gordon Research Seminar on "Photosensory Receptors & Signal Transduction"
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-23 – 2016-01-24
  • 国際学会
• [学会発表] Optical activation of G-protein by microbial rhodopsin chimera (2016)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, T. Yamashita, R. Abe-Yoshizumi, M. Tanaka, K. Inoue, K. Sasaki, Y. Shichida, H.
  • 学会等名: Gordon Research Seminar on "Photosensory Receptors & Signal Transduction"
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-23 – 2016-01-24
  • 国際学会
• [学会発表] Chloride binding site of monkey green studied by light-induced difference FTIR spectroscopy (2016)
  • 著者名/発表者名: S. Nakamura, K. Katayama, M. Iwaki, H. Imai, H. Kandori
  • 学会等名: Gordon Research Seminar on "Photosensory Receptors & Signal Transduction"
  • 発表場所: Galveston, U.S.A.
  • 年月日: 2016-01-23 – 2016-01-24
  • 国際学会
• [学会発表] 光受容タンパク質の光物性と機能 (2016)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 学会等名: 物性談話会
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2016-01-12 – 2016-01-12
  • 招待講演
• [学会発表] DTGロドプシンの光駆動イオン輸送とそのメカニズムの研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 井上圭一、芝田洋平、鈴木悠斗、伊藤奨太、Leonid S. Brown、神取秀樹
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会第41回討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-12-21 – 2015-12-23
• [学会発表] 真正細菌イオンポンプ型ロドプシンの機能転換とその光反応の解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野村祐梨香、井上圭一、神取秀樹
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会第41回討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-12-21 – 2015-12-23
• [学会発表] 海洋性細菌Nonlabens dokdonesis DSW-6が持つ2種類の光駆動イオンポンプ (2015)
  • 著者名/発表者名: 橋本優一、吉住 玲、神取秀樹
  • 学会等名: 日本生体エネルギー研究会第41回討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-12-21 – 2015-12-23
• [学会発表] Cation-pumping rhodopsin as optogenetic and environmental tools (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
  • 発表場所: Honolulu, U.S.A.
  • 年月日: 2015-12-15 – 2015-12-20
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] FTIR spectroscopy of animal and microbial rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
  • 発表場所: Honolulu, U.S.A.
  • 年月日: 2015-12-15 – 2015-12-20
  • 国際学会
• [学会発表] Spectroscopic and structural studies on the sodium transporting mechanism of sodium pump rhodopsin (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Inoue, H. E. Kato, Y. Kato, R. Abe-Yoshizumi, O. Nureki, H. Kandori
  • 学会等名: The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
  • 発表場所: Honolulu, U.S.A.
  • 年月日: 2015-12-15 – 2015-12-20
  • 国際学会
• [学会発表] The machinery of new eubacterial light-driven pumps: sodium and chloride pump rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Inoue, Y. Kato, A. Mori, R. Abe-Yoshizumi, H. Kandori
  • 学会等名: The 2015 International Chemical Congress of Pacific Basin Societies (PACIFICHEM 2015)
  • 発表場所: Honolulu, U.S.A.
  • 年月日: 2015-12-15 – 2015-12-20
  • 国際学会
• [学会発表] Na+ pumping rhodopsins; a potential tool of optogenetics (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Tsunoda, H. Kandori
  • 学会等名: The 7th international symposium optogenetics 2015, Neural circuit and neuromodulation”
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-12-04 – 2015-12-05
  • 国際学会
• [学会発表] Toward optogenetics applications: microbial rhodopsin chimera (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, T. Yamashita, R. Abe-Yoshizumi, M. Tanaka, K. Inoue, K. Sasaki, Y. Shichida, H.
  • 学会等名: The 7th international symposium optogenetics 2015, Neural circuit and neuromodulation”
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-12-04 – 2015-12-05
  • 国際学会
• [学会発表] KR2のNa+結合サイトに見られる特異な水素結合構造 (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤奨太、杉田 真也、吉住 玲、井上 圭一、岩田 達也、岩城 雅代、神取 秀樹
  • 学会等名: 新学術領域研究「柔らかな分子系」第 4回全体合宿会議
  • 発表場所: 北九州
  • 年月日: 2015-11-24 – 2015-11-26
• [学会発表] サル青感受性視物質のレチナール結合サイトの赤外分光による構造解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野中祐貴, 片山耕大, 筒井圭, 今井啓雄, 神取秀樹
  • 学会等名: 新学術領域研究「柔らかな分子系」第 4回全体合宿会議
  • 発表場所: 北九州
  • 年月日: 2015-11-24 – 2015-11-26
• [学会発表] ATP依存的なシロイヌナズナクリプトクロム1の光反応 (2015)
  • 著者名/発表者名: 三國克紘, 山田大智, 岩田達也, 人見研一, Elizabeth D. Getzoff, 神取秀樹
  • 学会等名: 新学術領域研究「柔らかな分子系」第 4回全体合宿会議
  • 発表場所: 北九州
  • 年月日: 2015-11-24 – 2015-11-26
• [学会発表] 「光といのち」の研究展開 (2015)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 学会等名: 第３回テニュアトラック教員による創発型シンポジウム 分野融合研究への展望
  • 発表場所: 名古屋
  • 年月日: 2015-11-20 – 2015-11-20
  • 招待講演
• [学会発表] Na+ポンプ型ロドプシンKR2のH+‐Na+選択性 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤善隆、井上圭一、吉住玲、神取秀樹
  • 学会等名: 新学術領域研究「柔らかな分子系」第11回ワークショップ「光駆動ナトリウムポンプからタンパク質の柔らかさと機能のつながりを考える」
  • 発表場所: 犬山
  • 年月日: 2015-10-28 – 2015-10-29
• [学会発表] KR2 における Na+ 結合サイトの水素結合環境解析」 (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤奨太、杉田 真也、吉住 玲、井上 圭一、岩田 達也、岩城 雅代、神取 秀樹
  • 学会等名: 新学術領域研究「柔らかな分子系」第11回ワークショップ「光駆動ナトリウムポンプからタンパク質の柔らかさと機能のつながりを考える
  • 発表場所: 犬山
  • 年月日: 2015-10-28 – 2015-10-29
• [学会発表] Spectroscopic study of light-driven sodium-pumping rhodopsin (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: 5th Asian Spectroscopy Conference
  • 発表場所: Sydney, Australia
  • 年月日: 2015-09-29 – 2015-10-02
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] 光駆動ナトリウムポンプの速度論的研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤善隆、井上圭一、吉住玲、神取秀樹
  • 学会等名: 第9回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-09-16 – 2015-09-19
• [学会発表] (6-4)光回復酵素の低温におけるDNA修復中間体の赤外分光測定 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山田大智、山元淳平、張 宇、岩田達也、人見研一、E. D. Getzoff、岩井成憲、神取秀樹
  • 学会等名: 第9回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-09-16 – 2015-09-19
• [学会発表] タンパク質中で見られるチロシンの特異な水素結合状態の赤外分光解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤奨太、杉田 真也、吉住 玲、井上 圭一、岩田 達也、岩城 雅代、神取 秀樹
  • 学会等名: 第8回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-09-16 – 2015-09-19
• [学会発表] 全反射赤外分光法で見るサル緑感受性視物質の陰イオン結合 (2015)
  • 著者名/発表者名: 中村駿太、片山耕大、岩城雅代、今井啓雄、神取秀樹
  • 学会等名: 第9回分子科学討論会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-09-16 – 2015-09-19
• [学会発表] What do H+ pumps transport? (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan, Symposium “Proton permeation mechanism across membrane”
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
  • 招待講演
• [学会発表] Metal binding to the voltage-gated proton channel VSOP studied by ATR-FTIR (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Iwaki, K. Takeshita, Y. Okamura, A. Nakagawa, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Electrophysiology of Na+ pumping rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Tsunoda, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Analysis of the hydrogen-bonding envirinment around the chromophore of photoactive yellow protein by FTIR spectroscopy (2015)
  • 著者名/発表者名: T. Iwata, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Role of Asn112 for transport activity by a light-driven sodium ion pump (2015)
  • 著者名/発表者名: R. Abe-Yoshizumi, K. Inoue, H. E. Kato, O. Nureki, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Engineering K+ pumping rhodopsin from KR2 (2015)
  • 著者名/発表者名: M. Konno, K. Inoue, H. E. Kato, O. Nureki, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Isotope labeled DNA substrate revealed FADH• reduction on CPD photolyase triggered conformational changes on 3’ side of DNA binding pocket. (2015)
  • 著者名/発表者名: I M. M. Wijaya, T. Iwata, J. Yamamoto, K. Hitomi, S. Iwai, E. D. Getzoff, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Ion uptake mechanism of a light-driven Na+-H+ pump, KR2 (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kato, K. Inoue, R. Abe-Yoshizumi, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Functional conversion of CPD and (6-4) photolyases by mutation (2015)
  • 著者名/発表者名: D. Yamada, H. M. Dokainish, T. Iwata, J. Yamamoto, T. Ishikawa, T. Todo, S. Iwai, E. D. Getzoff, A. Kitao, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Low-temperature FTIR study of sodium pumping rhodopsin (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Ito, S. Sugita, R. Abe-Yoshizumi, K. Inoue, T. Iwata, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Construction of chimeric proteins for optical control of Gs-protein activity (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Yoshida, K. Inoue, T. Yamashita, R. Abe-Yoshizumi, M. Tanaka, K. Sasaki, Y. Shichida, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Elucidation of signal transduction mechanism of Aer (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Oka, T. Iwata, M. Iwaki, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] A new proton pump rhodopsin without a conserved proton donor (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Suzuki, K. Inoue, Y. Shibata, L. S. Brown, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Single-molecule FRET studies on the light-induced structural changes of the sensory (2015)
  • 著者名/発表者名: R. Nishimura, K. Inoue, J. Yagasaki, K. Kawamoto, Y. Sudo, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Role of Y265 in blue-sensitive visual pigment (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Nonaka, K. Katayama, K. Tsutsui, H. Imai, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] FTIR study of the Arabidopsis cryptochrome1 photoreaction (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Mikuni, D. Yamada, T. Iwata, K. Hitomi, E. D. Getzoff, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Photochemical reactions of FMN in the mutant LOV proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: N. Ueda, Y. Ono, T. Iwata, M. Iwaki, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Structural analysis of DNAzyme that functions as photorepair of UV-damaged DNA (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kurahashi, T. Iwata, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Analysis of isotopic labeling of BLUF domain using MALDI-TOF-MS (2015)
  • 著者名/発表者名: T. Nagai, T. Iwata, S. Ito, M. Iseki, M. Watanabe, S. Kitagawa, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Anion effect to monkey green studied by light-induced difference FTIR spectroscopy (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Nakamura, K. Katayama, H. Imai, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Functional conversion of eubacterial pump rhodopsins and the investigation of the photoreactions (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Nomura, K. Inoue, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] Expression of microbial rhodopsins in Nonlabens dokdonesis DSW-6 (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Hashimoto, R. Abe-Yoshizumi, H. Kandori
  • 学会等名: The 53rd Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan
  • 発表場所: Kanazawa, Japan
  • 年月日: 2015-09-13 – 2015-09-15
• [学会発表] イエロープロテインの発色団を取り囲む水素結合環境 (2015)
  • 著者名/発表者名: 岩田達也、神取秀樹
  • 学会等名: 第9回バイオ関連化学シンポジウム
  • 発表場所: 熊本
  • 年月日: 2015-09-10 – 2015-09-12
• [学会発表] Photochemistry and photobiology in light and life research (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: Annual Meeting on Photochemistry 2015, Symposium on Photo-Biology, “Photo-Biology: Sensing Light and Manipulation with Light”
  • 発表場所: Osaka, Japan
  • 年月日: 2015-09-09 – 2015-09-09
  • 招待講演
• [学会発表] 光駆動型イオン透過性ロドプシンの構造活性相関 (2015)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 学会等名: 生理学研究所「生体シグナルダイナミクス」研究会
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-09-03 – 2015-09-03
  • 招待講演
• [学会発表] Molecular mechanism of ion-pumping microbial rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: 10th EBSA European Biophysics Congress
  • 発表場所: Dresden, Germany
  • 年月日: 2015-07-18 – 2015-07-22
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Mechanisms of two different function on KR2 (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kato, K. Inoue, R. Abe-Yoshizumi, Y. Hashimoto, H. Kandori
  • 学会等名: 10th EBSA European Biophysics Congress
  • 発表場所: Dresden, Germany
  • 年月日: 2015-07-18 – 2015-07-22
  • 国際学会
• [学会発表] Asymmetrical functional conversion of (6-4) photolyase and CPD photolyase (2015)
  • 著者名/発表者名: D. Yamada, T. Iwata, J. Yamamoto, T. Ishikawa, E. D. Getzoff, T. Todo, S. Iwai, H. Kandori
  • 学会等名: 10th EBSA European Biophysics Congress
  • 発表場所: Dresden, Germany
  • 年月日: 2015-07-18 – 2015-07-22
  • 国際学会
• [学会発表] ”Soft” structure-function relationship revealed by functional conversion of photoreceptive proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: KAKENHI International Symposium on "Studying the Function of Soft Molecular Systems"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-07-09 – 2015-07-11
  • 国際学会
• [学会発表] Study on the sodium transport mechanism of sodium pump rhodopsin (2015)
  • 著者名/発表者名: K. Inoue, Y. Kato, R. Abe-Yoshizumi, H. Kandori
  • 学会等名: KAKENHI International Symposium on "Studying the Function of Soft Molecular Systems"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-07-09 – 2015-07-11
  • 国際学会
• [学会発表] Kinetic analysis of the ion-uptake mechanism in light-driven Na+ pump, KR2 (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kato, K. Inoue, R. Abe-Yoshizumi, H. Kandori
  • 学会等名: KAKENHI International Symposium on "Studying the Function of Soft Molecular Systems"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-07-09 – 2015-07-11
  • 国際学会
• [学会発表] FTIR study of the K and M intermediates in light-driven sodium pumping rhodopsin (2015)
  • 著者名/発表者名: S. Ito, S. Sugita, R. Abe-Yoshizumi, K. Inoue, T. Iwata, M. Sheves, H. Kandori
  • 学会等名: KAKENHI International Symposium on "Studying the Function of Soft Molecular Systems"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-07-09 – 2015-07-11
  • 国際学会
• [学会発表] Spectroscopic study on a new proton pump rhodopsin without a typical proton donor" (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Suzuki, K. Inoue, Y. Shibata, L. S. Brown, H. Kandori
  • 学会等名: KAKENHI International Symposium on "Studying the Function of Soft Molecular Systems"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-07-09 – 2015-07-11
  • 国際学会
• [学会発表] Functional conversion of eubacterial H+ and Cl- pump rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Nomura, K. Inoue, H. Kandori
  • 学会等名: KAKENHI International Symposium on "Studying the Function of Soft Molecular Systems"
  • 発表場所: Tokyo, Japan
  • 年月日: 2015-07-09 – 2015-07-11
  • 国際学会
• [学会発表] Molecular mechanism of ion-pumping microbial rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 学会等名: 2015 International Symposium on Marine Genomics
  • 発表場所: Seoul, Korea
  • 年月日: 2015-06-22 – 2015-06-24
  • 国際学会 / 招待講演
• [学会発表] Functional conversion between photolyases by mutation (2015)
  • 著者名/発表者名: D. Yamada, T. Iwata, J. Yamamoto, T. Ishikawa, T. Todo, S. Iwai, E. D. Getzoff, H. Kandori
  • 学会等名: The 3rd Awaji International Workshop on "Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications"
  • 発表場所: Awaji Island, Japan
  • 年月日: 2015-06-14 – 2015-06-17
  • 国際学会
• [学会発表] Photochemical reactions of FMN in the mutant LOV proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: N. Ueda, Y. Ono, T. Iwata, M. Iwaki, H. Kandori
  • 学会等名: The 3rd Awaji International Workshop on "Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications"
  • 発表場所: Awaji Island, Japan
  • 年月日: 2015-06-14 – 2015-06-17
  • 国際学会
• [学会発表] Structural analysis of a DNAzyme that repairs UV-induced damaged DNA (2015)
  • 著者名/発表者名: Y. Kurahashi, T. Iwata, H. Kandori
  • 学会等名: The 3rd Awaji International Workshop on "Electron Spin Science & Technology: Biological and Materials Science Oriented Applications"
  • 発表場所: Awaji Island, Japan
  • 年月日: 2015-06-14 – 2015-06-17
  • 国際学会
• [学会発表] ナトリウムポンプ型ロドプシンのNa+輸送におけるNDQ-モチーフの役割についての分光研究 (2015)
  • 著者名/発表者名: 井上圭一、加藤善隆、吉住 玲、神取秀樹
  • 学会等名: 第42回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 高崎
  • 年月日: 2015-06-12 – 2015-06-13
• [学会発表] 部位特異的変異導入による光回復酵素間の機能転換 (2015)
  • 著者名/発表者名: 山田大智、岩田達也、山元淳平、石川智子、藤堂 剛、岩井成憲、E. D. Getzoff、神取秀樹
  • 学会等名: 第42回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 高崎
  • 年月日: 2015-06-12 – 2015-06-13
• [学会発表] 真正細菌光駆動型イオンポンプにおけるCl-ポンプとH+ポンプの機能転換 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野村祐梨香、井上圭一、神取秀樹
  • 学会等名: 第42回生体分子科学討論会
  • 発表場所: 高崎
  • 年月日: 2015-06-12 – 2015-06-13
• [学会発表] 微生物型ロドプシンを用いた三量体Gtタンパク質の光操作 (2015)
  • 著者名/発表者名: 井上圭一、佐々木賢吾、山下高廣、吉田一帆、七田芳則、神取秀樹
  • 学会等名: 第12回GPCR研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-05-15 – 2015-05-16
• [学会発表] 光受容キメラタンパク質によるGタンパク質の光制御 (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉田一帆、井上圭一、山下高廣、吉住玲、田中瑞奈、佐々木賢吾、七田芳則、神取秀樹
  • 学会等名: 第12回GPCR研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-05-15 – 2015-05-16
• [学会発表] 霊長類青感受性視物質の構造解析 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野中祐貴、片山耕大、筒井圭、今井啓雄、神取秀樹
  • 学会等名: 第12回GPCR研究会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2015-05-15 – 2015-05-16
• [学会発表] 生体π空間の制御と新機能 (2015)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 学会等名: 新潟大先端化学セミナー
  • 発表場所: 新潟
  • 年月日: 2015-05-08 – 2015-05-08
  • 招待講演
• [学会発表] 光誘起陽イオンチャネルChRの水素結合環境とプロトン移動を考える (2015)
  • 著者名/発表者名: 伊藤奨太、加藤英明、大石賢実、谷口怜哉、岩田達也、濡木理、神取秀樹
  • 学会等名: 分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-04-20 – 2015-04-21
• [学会発表] 光駆動ナトリウムイオンポンプのイオン取込みと選択性 (2015)
  • 著者名/発表者名: 加藤善隆、井上圭一、吉住 玲、橋本優一、神取秀樹
  • 学会等名: 分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-04-20 – 2015-04-21
• [学会発表] 趣旨説明 (2015)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 学会等名: 分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-04-20 – 2015-04-21
• [学会発表] カリウムイオンをポンプするロドプシンの創成 (2015)
  • 著者名/発表者名: 今野雅恵、井上圭一、加藤英明、濡木 理、神取秀樹
  • 学会等名: 分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-04-20 – 2015-04-21
• [学会発表] H+ポンプ型ロドプシンAR3のH+チャネルへの機能転換 (2015)
  • 著者名/発表者名: 鈴木悠斗、井上圭一、林 重彦、須藤雄気、神取秀樹
  • 学会等名: 分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-04-20 – 2015-04-21
• [学会発表] 真正細菌ロドプシンのナトリウムポンプ、クロライドポンプからプロトンポンプへの機能転換 (2015)
  • 著者名/発表者名: 野村祐梨香、井上圭一、神取秀樹
  • 学会等名: 分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-04-20 – 2015-04-21
• [学会発表] 光駆動ナトリウムポンプKR2のポンプスイッチにおけるAsn112の重要性 (2015)
  • 著者名/発表者名: 吉住 玲、井上圭一、加藤英明、濡木 理、神取秀樹
  • 学会等名: 分子研研究会「膜タンパク質内部のプロトン透過を考える」
  • 発表場所: 岡崎
  • 年月日: 2015-04-20 – 2015-04-21
• [図書] 光異性化と生命現象 (2016)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 総ページ数: 1
  • 出版者: 朝倉書店
• [図書] バクテリオロドプシン (2016)
  • 著者名/発表者名: 神取秀樹
  • 総ページ数: 1
  • 出版者: 朝倉書店
• [図書] Protein-controlled isomerization in rhodopsins (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 総ページ数: 695-713
  • 出版者: Elsevier
• [図書] History and perspectives of light-sensing proteins (2015)
  • 著者名/発表者名: H. Kandori
  • 総ページ数: 3-16
  • 出版者: Elsevier