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2015 年度 実績報告書

ヘテロクロマチンの構造と機能の理解

計画研究

研究領域動的クロマチン構造と機能
研究課題/領域番号 25116004
研究機関北海道大学

研究代表者

小布施 力史  北海道大学, 先端生命科学研究科(研究院), 教授 (00273855)

研究期間 (年度) 2013-06-28 – 2018-03-31
キーワードゲノム / エピゲノム / クロマチン / プロテオーム / 転写
研究実績の概要

SUZBPs3種類のそれぞれの因子を欠失変異を作製し、SUZ12との相互作用に必要なドメインや配列をバキュロウイルス発現系を用いて同定した。その結果、SUZBPsはそれぞれの比較的短いアミノ酸配列(数十aa)がSUZ12との結合に必要なこと、互いに全く配列の相同性はないことが明らかとなった。一方、SUZ12については、SUZBPsが結合する領域は共通していた。これにより、多様な複合体を形成しているものと考えられる。
GAZ1の免疫沈降から複製開始複合体が検出されることから、GAZ1が複製開始複合体とG9aとのアダプターとしての役割をしていると考えられた。4種類のGAZについてドメイン解析を行い、4種類すべてのGAZのC末端にある特徴的な共通領域がG9a複合体との結合に必要であることを明らかにした。しかしながら、複製開始複合体との相互作用にはGAZ1は必要なかった。
公募班の佐渡敬教授との共同で、HBiX1あるいはSMCHD1のノックアウトマウスからMEF採取し、HBiX1、SMCHD1自身やヒストン修飾に対する影響をChIP-seqにより、転写に対する影響をRNA-seqにより解析した。多くの遺伝子の発現が上昇したが、その程度はまちまちであった。興味深いことに、HBiX1あるいはSMCHD1のノックアウトマウスから得たMEFでは、H3K9me3やH3K27me3の分布に変化があった。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

PRC2複合体のバリエーションを生み出す分子メカニズムはSUZ12をプラットフォームとした複合体形成にあることを突き止め、論文として公表準備が整った。また、G9aの分子構築についても知見が蓄積しつつある。さらに、マウスを用いたアリル特異的なChIP-seq解析やRNA-seq解析を確立し、不活性X染色体のようなモノアレリック制御を受ける染色体領域の分子動態を明らかにする手段が整った。

今後の研究の推進方策

SUZ12を基盤とするPRC2の多様性を生み出す仕組みが、試験再構成系でほぼ明らかとなった。今後、この多様性がPRC2コア複合体に及ぼす影響を、活性や複合体形成に着目して明らかにすると共に、それぞれの細胞内での機能を明らかにしたい。また、G9a複合体の多様性を生み出すメカニズムとして、当初想定していたGAZのアダプターとしての機能を十分表現することができなかった。今後、アダプター説も考慮しつつ、特異性を生み出す仕組みとしてもう一度機能を再検討する。

  • 研究成果

    (28件)

すべて 2016 2015 その他

すべて 雑誌論文 (7件) (うち査読あり 7件、 オープンアクセス 7件) 学会発表 (17件) (うち国際学会 2件、 招待講演 3件) 備考 (4件)

  • [雑誌論文] Histone H3K36 trimethylation is essential for multiple silencing mechanisms in fission yeast.2016

    • 著者名/発表者名
      Suzuki S., Kato H., Suzuki Y., Chikashige Y., Hiraoka Y., Kimura H., Nagao K., Obuse C., Takahata S., Murakami Y.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res.

      巻: 印刷中 ページ: 印刷中

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Retinoblastoma-binding Protein 4-regulated Classical Nuclear Transport Is Involved in Cellular Senescence.2015

    • 著者名/発表者名
      Tsujii A., Miyamoto Y., Moriyama T., Tsuchiya Y., Obuse C., Mizuguchi K., Oka M., Yoneda Y.
    • 雑誌名

      J Biol Chem.

      巻: 290 ページ: 29375-29388

    • DOI

      10.1074/jbc.M115.681908.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] LRRC59 Regulates Trafficking of Nucleic Acid-Sensing TLRs from the Endoplasmic Reticulum via Association with UNC93B1.2015

    • 著者名/発表者名
      Tatematsu M., Funami K., Ishii N., Seya T., Obuse C., Matsumoto M.
    • 雑誌名

      J Immunol.

      巻: 195 ページ: 4933-4942

    • DOI

      10.4049/jimmunol.1501305.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Distribution of histone H4 modifications as revealed by a panel of specific monoclonal antibodies.2015

    • 著者名/発表者名
      Hayashi-Takanaka Y., Maehara K., Harada A., Umehara T., Yokoyama S., Obuse C., Ohkawa Y., Nozaki N., Kimura H.
    • 雑誌名

      Chromosome Res.

      巻: 23 ページ: 753-766

    • DOI

      10.1007/s10577-015-9486-4.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Functional characterization of importin α8 as a classical nuclear localization signal receptor.2015

    • 著者名/発表者名
      Kimoto C., Moriyama T., Tsujii A., Igarashi Y., Obuse C., Miyamoto Y., Oka M., Yoneda Y.
    • 雑誌名

      Biochim Biophys Acta.

      巻: 1853 ページ: 2676-2683

    • DOI

      10.1016/j.bbamcr.2015.07.017.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] HJURP is involved in the expansion of centromeric chromatin.2015

    • 著者名/発表者名
      Perpelescu M., Hori T., Toyoda A., Misu S., Monma N., Ikeo K., Obuse C., Fujiyama A., Fukagawa T.
    • 雑誌名

      Mol Biol Cell.

      巻: 26 ページ: 2742-2754

    • DOI

      10.1091/mbc.E15-02-0094.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [雑誌論文] Identification and characterization of a nuclear localization signal of TRIM28 that overlaps with the HP1 box.2015

    • 著者名/発表者名
      Moriyama T., Sangel P., Yamaguchi H., Obuse C., Miyamoto Y., Oka M., Yoneda Y.
    • 雑誌名

      Biochem Biophys Res Commun.

      巻: 462 ページ: 201-207

    • DOI

      10.1016/j.bbrc.2015.04.108.

    • 査読あり / オープンアクセス
  • [学会発表] SCAIはRif1の機能を調節することによって二本鎖切断損傷の相同組換え修復を促進する2015

    • 著者名/発表者名
      磯部 真也、大久保 義真、石本 祥平、長尾 恒治、小布施 力史
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
    • 招待講演
  • [学会発表] “CTD-code of RNA polymeraseⅡ regulates dynamics of IncRNA for RNAi-dependent heterochromatin formation “2015

    • 著者名/発表者名
      Takuya Kajitani, Hiroaki Kato, Yutaka Suzuki, Yuji Chikashige, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Chikashi Obuse, Koji Nagao, Damien Hermand, Yota Murakami
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] 新規核局在化シグナル受容体importin α8の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      宮本 洋一、盛山 哲嗣、木本 千裕、辻井 聡、五十嵐 芳暢、小布施 力史、岡 正啓、米田 悦啓
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] ヒトPRC2 (Polycomb Repressive Complex 2) 複合体構成因子の解析2015

    • 著者名/発表者名
      石本 祥平、蛯名 峰子、柴田 幸子、山口 康祐、磯部 真也、大久保 義真、長尾 恒治、小布施 力史
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] Ras-PI3Kの時空間制御を介したエンドサイトーシス調節因子の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      堀内 浩水、藤岡 容一朗、佐藤 絢、ネパール プラバ、西出 真也、南保 明日香、小布施 力史、大場 雄介
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] 新規53BP1結合タンパク質SCAIは、Rif1に阻害的に働くことで相同組換え修復を促進する2015

    • 著者名/発表者名
      磯部 真也、大久保 義真、石本 祥平、長尾 恒治、野崎 直仁、木村 宏、小布施 力史
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] ヒト複製開始複合体結合タンパク質LRWD1/ORCBP1の機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      大久保 義真、山口 真弘、関 丘、野澤 竜介、磯部 真也、石本 祥平、長尾 恒治、小布施 力史
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] MutSαはクロマチンリモデリング因子やヒストンシャペロンを呼びこむことでミスマッチ塩基周辺のヌクレオソーム排除を促進する2015

    • 著者名/発表者名
      照井 利輝、滝 佳菜恵、長尾 恒治、田中 誠司、久保田 弓子、中川 拓郎、滝澤 温彦、小布施 力史、升方 久夫、高橋 達郎
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] Mcm8-9複合体の生化学的機能解析2015

    • 著者名/発表者名
      金原 良樹、西村 浩平、You Zhiying、正井 久雄、Alessandro Costa、長尾 恒治、小布施 力史、鐘巻 将人
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-04
  • [学会発表] 核内輸送因子Importin αとヒストン結合タンパクRBBP4の非典型的結合とその生理的意義2015

    • 著者名/発表者名
      辻井 聡、宮本 洋一、盛山 哲嗣、土屋 裕子、小布施 力史、水口 賢司、岡 正啓、米田 悦啓
    • 学会等名
      BMB2015(第38回日本分子生物学会年会 第88回日本生化学会大会 合同大会)
    • 発表場所
      神戸ポートアイランド(兵庫県・神戸市)
    • 年月日
      2015-12-01 – 2015-12-01
  • [学会発表] “From Histone Code to Higher Order Chromatin Structure on Inactive X Chromosome“2015

    • 著者名/発表者名
      Chikashi Obuse, Koji Nagao, Shin-Ya Isobe, Yoshi-Nobu Okubo, Ryo-suke Nozawa, Takashi Sado, Hiroshi Kimura
    • 学会等名
      第40回内藤コンファレンス
    • 発表場所
      ガトーキングダム(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2015-09-15 – 2015-09-18
    • 招待講演
  • [学会発表] “Evolutionary conserved chromatin states of the inactive X chromosome between human and mouse“2015

    • 著者名/発表者名
      Koji Nagao, Sachiko Shibata, Ryu-suke Nozawa, Hiroshi Kimura, Takashi Sado, Chikashi Obuse
    • 学会等名
      第40回内藤コンファレンス
    • 発表場所
      ガトーキングダム(北海道・札幌市)
    • 年月日
      2015-09-15 – 2015-09-18
  • [学会発表] “DNA Double Strand Breaks Repair Pathway Is Controlled by Differential Phosphorylation of 53BP1“2015

    • 著者名/発表者名
      Shin-Ya Isobe, Yoshi-Nobu Ohkubo, Koji Nagao, Naohito Nozaki, Hiroshi Kimura, and Chikashi Obuse
    • 学会等名
      International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function
    • 発表場所
      淡路夢舞台(兵庫県・淡路市)
    • 年月日
      2015-08-23 – 2015-08-26
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] “Two Nup133-homologs Separately Function at the Cytoplasmic or Nuclear Side in Nuclear Pore Complex in Schizosaccharomyces Pombe“2015

    • 著者名/発表者名
      Haruhiko Asakawa, Hui-Ju Yang, Tomoko Kojidani, Chizuru Ohtsuiki, Hiroko Osakada, Koji Nagao, Chikashi Obuse, Yasushi Hiraoka, Tokuko Haraguchi
    • 学会等名
      International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function
    • 発表場所
      淡路夢舞台(兵庫県・淡路市)
    • 年月日
      2015-08-23 – 2015-08-26
  • [学会発表] “Function of ORC-binding protein ORCBP1 in Human Cells“2015

    • 著者名/発表者名
      YoshiNobu Ohkubo, Masahiro Yamaguchi, Takashi Seki, Ryu-suke Nozawa, Shinya Isobe, Syohei Ishimoto, Koji Nagao, Chikashi Obuse
    • 学会等名
      International Symposium on Chromatin Structure, Dynamics, and Function
    • 発表場所
      淡路夢舞台(兵庫県・淡路市)
    • 年月日
      2015-08-23 – 2015-08-26
  • [学会発表] “DNA repair pathway is controlled by differential phosphorylation of 53BP1“2015

    • 著者名/発表者名
      S.-Y. Isobe, K. Nagao, Y. -N. Ohkubo, H. Kimura, C. Obuse
    • 学会等名
      24th Wilhelm Bernhard Workshop on the Cell Nucleus,
    • 発表場所
      ウイーン(オーストリア)
    • 年月日
      2015-08-17 – 2015-08-22
    • 国際学会
  • [学会発表] HP1とポリコーム複合体2(PRC2)との連携とヘテロクロマチンの機能構2015

    • 著者名/発表者名
      小布施 力史
    • 学会等名
      第9回日本エピジェネティクス研究会年会
    • 発表場所
      学術総合センター一橋講堂(東京都・千代田区)
    • 年月日
      2015-05-25 – 2015-05-26
  • [備考] 北海道大学 大学院先端生命科学研究院 分子細胞生物学研究室

    • URL

      http://altair.sci.hokudai.ac.jp/infgen/

  • [備考] researchmap

    • URL

      http://researchmap.jp/obuse/

  • [備考] 研究紹介

    • URL

      http://www.lfsci.hokudai.ac.jp/labs/infgen/nsmb2013/

  • [備考] 論文プレリリース

    • URL

      http://www.hokudai.ac.jp/news/130401_pr_sci.pdf

URL: 

公開日: 2017-01-06  

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