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2016 年度 実績報告書

tRNAリボソームプロファイリングの開発と応用

計画研究

研究領域新生鎖の生物学
研究課題/領域番号 26116004
研究機関国立研究開発法人理化学研究所

研究代表者

田中 元雅  国立研究開発法人理化学研究所, 脳科学総合研究センター, チームリーダー (40321781)

研究期間 (年度) 2014-07-10 – 2019-03-31
キーワード新生鎖 / tRNA / 翻訳
研究実績の概要

本年度は、様々な環境ストレス存在下での出芽酵母の翻訳阻害メカニズムの解明を目指した研究をさらに進めた。特に、tRNAの修飾に関わると考えられるオルガネラや遺伝子に関する欠損酵母株などを用いた解析を行い、それによって翻訳阻害の表現型や翻訳モードがどのように変化するかをリボソームプロファイリング法などから検討した。その結果、tRNA修飾がmRNA翻訳に与える影響に関して、翻訳阻害に関する新たな分子メカニズムに関する知見を得た。一方で、翻訳における揺らぎ仮説を実験的に検証するための技術開発を様々な角度から検討した。哺乳動物細胞に関しては、リボソームプロファイリングのための各種ライブラリー作成、バイオインフォマティックスツールの開発にさらに改良を加え、網羅的な配列データに対して様々な深いレベルでの統計解析を行うための実験系を確立させ、それによって神経細胞に存在する特異的な翻訳モードを明らかにした。また、新生ポリペプチド鎖の蛍光イメージング手法の開発に関して神経細胞などを用いて検討し、ゲノミクスによる解析との相関を調べる実験系の構築を進めた。また、国際共同研究において、真核生物の新生鎖一分子に対して力学計測を行うために必要とされる翻訳因子試料やmRNAの作成および力学計測のための実験機器の調整を行った。その結果、真核生物のmRNA翻訳を実時間で追跡することができる光ピンセット一分子力学計測系を構築した。

現在までの達成度 (区分)
現在までの達成度 (区分)

2: おおむね順調に進展している

理由

様々な細胞を用いてmRNA翻訳に関する網羅的解析手法を確立し、かつデータ解析のためのバイオインフォマッティクスのツール群もこれまでに独自に開発してきており、今後の研究のさらなる発展が期待できる、また、真核生物の新生鎖の構造を調べるための一分子力学計測に関する国際共同研究も順調に進んでいるため。

今後の研究の推進方策

今後は、これまでに開発してきた翻訳解析手法をさらに発展させ、ストレス条件下での翻訳制御機構の分子メカニズムをさらに詳しく調べる。また、様々なストレス下の酵母を用いて、揺らぎ仮説に関するリボソームプロファイリングを行い、細胞内ストレスと揺らぎ仮説やtRNA修飾、tRNAコドン選択などの相関解明も目指す。哺乳動物細胞での翻訳解析についても、局所翻訳の解析を精神障害や神経変性に関わる疾患モデルマウスおよび培養神経細胞を用いて調べ、翻訳異常の全容解明を目指す。また、神経細胞を用いた新生鎖のイメージング技術の開発や新生鎖に対する一分子力学計測実験も引き続き鋭意、進めていく。

  • 研究成果

    (6件)

すべて 2016 その他

すべて 国際共同研究 (1件) 学会発表 (4件) (うち国際学会 2件、 招待講演 4件) 学会・シンポジウム開催 (1件)

  • [国際共同研究] カリフォルニア大学バークレー校(米国)

    • 国名
      米国
    • 外国機関名
      カリフォルニア大学バークレー校
  • [学会発表] Genome-Wide Translation Profiling by Ribosome-Bound RNA Capture2016

    • 著者名/発表者名
      Motomasa Tanaka
    • 学会等名
      第39回日本分子生物学会
    • 発表場所
      パシフィコ横浜・横浜市
    • 年月日
      2016-11-30 – 2016-12-02
    • 招待講演
  • [学会発表] リボソーム内tRNAの解析による 環境ストレス細胞プロファイリング2016

    • 著者名/発表者名
      田中元雅
    • 学会等名
      第89回日本生化学大会
    • 発表場所
      東北大学・仙台市
    • 年月日
      2016-09-25 – 2016-09-27
    • 招待講演
  • [学会発表] TDP-43/DISC1 Aggregation Impairs Local Dendrite Translation and Mental Function in FTLD2016

    • 著者名/発表者名
      Motomasa Tanaka
    • 学会等名
      Nascent Chain Biology Meeting
    • 発表場所
      富士レークホテル・ 山梨県南都留郡
    • 年月日
      2016-09-01 – 2016-09-03
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会発表] Ribosome-bound RNA Profiling for Translation Control Studies in Yeast2016

    • 著者名/発表者名
      Motomasa Tanaka
    • 学会等名
      RNA2016 satellite-symposium
    • 発表場所
      京都大学・京都市
    • 年月日
      2016-06-27 – 2016-06-27
    • 国際学会 / 招待講演
  • [学会・シンポジウム開催] Nascent Chain Biology Meeting2016

    • 発表場所
      富士レークホテル
    • 年月日
      2016-09-01 – 2016-09-03

URL: 

公開日: 2018-01-16  

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