研究課題/領域番号 |
01480038
|
研究機関 | 鳥取大学 |
研究代表者 |
安室 喜正 鳥取大学, 農学部, 教授 (50026374)
|
研究分担者 |
富田 因則 鳥取大学, 農学部, 助手 (70207611)
中田 昇 鳥取大学, 農学部, 講師 (40032312)
|
キーワード | コムギ族作物 / 染色体特異的DNA / ショットガン法 / Deletion Enrichment Scheme / ドットハイブリダイゼ-ション / サザンハイブリダイゼ-ション / 反復配列 |
研究概要 |
(1)コムギ族作物における染色体特異的DNAマ-カ-を開発するため、ショットガン法によりライムギ自殖系統IR130の全ゲノムBamH1消化DNAおよびDeletion Enrichment Schemeによりライムギ5R染色体添加型コムギGhinese Spring(CS)系統のBamH1消化DNAのpUC19ライブラリ-を作成した。(2)各クロ-ンとコムギおよびライムギの全DNAプロ-ブとのドットハイブリダイゼ-ションによってコムギ、ライムギゲノムにおけるコピ-数を比較し、さらにこれらクロ-ンとCS、IR130およびライムギ1R、2R、3R、5Rおよび6R染色体添加型コムギ系統とのサザンハイブリダイゼ-ションによってライムギ染色体特異的クロ-ンを検索した。(3)IR130のゲノミッククロ-ン419個中、0.2ー3.4Kbpのインサ-ションを持つ20個をドットハイブリダイゼ-ションに用いたところ、4個がライムギに特異的で1個がコムギ特異的であった。(4)そのうちの1個はサザンハイブリダイゼ-ションの結果、ライムギ6R染色体に特異的な590bp前後のスメア-シグナルを示す反復配列であり、また、コピ-数の多い他の2個はコムギ、ライムギに共通したそれぞれ975bp、1375bpの1つのシグナルを示したことから、ある同祖染色体に特異的で異なる反復配列と考えた。(5)一方、ライムギ5R添加コムギのクロ-ン176個中、0.2ー1.0Kbpのインサ-ションを持つ22個をドットハイブリダイゼ-ションに用いたところ、5個がライムギ特異的であり、いずれもコピ-数は少なかった。(6)これらのクロ-ンを用いて、現在インサイチュ-ハイブリダイゼ-ションにより、染色体上の位置を同定する作業を進めている。
|