| 研究課題/領域番号 |
02F00503
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| 研究機関 | 岡崎国立共同研究機構 |
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研究代表者 |
村田 紀夫 岡崎国立共同研究機構, 基礎生物学研究所, 教授
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| 研究分担者 |
JOGADHENU Prakash Syama Sundar 岡崎国立共同研究機構, 基礎生物学研究所, 外国人特別研究員
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| キーワード | ストレス誘導性遺伝子 / 遺伝子破壊 / DNAマイクロアレイ / 低温適応 / Synechocystis / RNA結合タンパク質 |
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| 研究概要 |
ラン藻Synechocystis sp. PCC 6803は低温に曝されると、多数の遺伝子の発現を誘導あるいは抑制し、低温環境に適応し生育する。本研究ではそれらの低温誘導性遺伝子のうち、その機能が未同定の遺伝子について破壊株を作製しその表現型を解析することにより、低温条件でのその遺伝子産物の機能と細胞の低温適応能獲得に対する意義を明らかにすることを目的とする。
本年度は、低温誘導性の未知遺伝子10種の個別破壊株を作製した。また、構造が類似しているタンパク質をコードする遺伝子については、多重破壊変異株も作製した。それらの変異株の生育を通常条件と低温条件で比較し、野生株に比べて低温条件で生育速度が著しく低下している株を同定した。その遺伝子の機能を予測するため、通常の培養条件と低温条件でDNAマイクロアレイ解析を行い、発現量に変化が見られる遺伝子群を明らかにした。今後さらに標的遺伝子の数、および多重変異株の組み合わせを増し、低温適応機構の全容の解明を試みる。
ラン藻では、低温条件下で低分子のRNA結合タンパク質(Rbp)の遺伝子の発現が顕著に誘導され、低温条件でのRNAの高次構造および翻訳活性の保持に必要であると推定されている。しかしながら、Rbpの特定の標的RNA分子種はこれまで明らかにされていない。そこで、タグを付加したRbpをラン藻細胞内で過剰発現させ、Rbpとともに精製されるRNAと全RNAとをDNAマイクロアレイで比較することにより、Rbpの標的RNAを同定するべく準備を行っている。
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