1991 年度実績報告書

DNAセンシングシステムの開発

研究課題

研究課題/領域番号	03205022
研究機関	東京大学
研究代表者	軽部征夫東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (50089827)
研究分担者	鈴木正康東京大学, 先端科学技術研究センター, 助手 (70226554) 民谷栄一東京大学, 先端科学技術研究センター, 助教授 (60179893)
キーワード	遺伝子検出 / 蛍光偏光解消 / ハイブリダイゼ-ション / DNAプロ-ブ / PCR / DNA診断
研究概要	本研究ではまず蛍光偏光解消を応用したDNAの検知システムについて検討した。すなわち、蛍光物質を標識したプロ-ブDNAとハイブリダイズした後の蛍光物質は、回転運動などの運動モ-ドが大きく異なる。したがって偏光解消度を指標としてハイブリダイズしたDNAの量を推定することが可能と考えられた。まずハイブリダイゼ-ションの過程でどのように偏光度が変化していくかを調べた。その結果、偏光解消は時間とともに増加していき、しだい定常値に達することがわかった。この変化はハイブリダイゼ-ションの進行度を示している。いま、タ-ゲットとなるDNAとして、pBR322プラスミドDNAを540bp断片中の3個あるいは6個のシトシンをチミンに変化させた試料を用いて、これにプロ-ブDNAを作用させ、ハイブリダイゼ-ションの時間経過を調べた。その結果、ミスマッチの塩基数が増加することにつれ、蛍光解消度の増加率が小さいことが明かになった。 PCR増幅反応は、超微量のDNAを検出するきわめて有効な方法である。そこで蛍光偏光解消法をPCR増幅反応に適用した。まず、16merのオリゴマ-にFITCを標識したDNAプロ-ブを合成し、タ-ゲットDNAとしてpUC119プラスミドを用い、遺伝病の診断を考え、200bpから1kbpまでの範囲を選んだ。PCR増幅回数を5回より30回まで5回おきに測定したところ、5回以降蛍光偏光異方度が上昇していることが判った。これは、FITCで標識されたDNAプロ-ブがPCR増幅反応の進行にともなって、16merから目的の長さの2本鎖DNAへと伸長し、FITCの動的挙動が変化したことを示すと考えられた。またPCR増幅の初期の段階でより迅速に、タ-ゲットDNAの存在を確認できることも示された。さらに測定温度を高くすると偏光異方度が下がることもわかった。これは、溶液の粘度変化が反映しているものと考えられた。

研究成果
(8件)

すべてその他

すべて文献書誌 (8件)

[文献書誌] T.Herning,E.Tamiya,S.Kobayashi,I.Karube: "Specific liguid DNA hybridization kinetics measured by fluorescence polarization" Anal.Chim.Acta. 244. 207-213 (1991)
[文献書誌] M.Tsuruoka,E.Tamiya,I.Karube: "Fluorescence polarization immunoassay employing immobilized antibody" Biosensors&Bioelectronics. 6. 501-505 (1991)
[文献書誌] S.M.Lel,M.Suzuki,E.Tamiya,I.Karube: "Anovel microbial sensor for the determination of toxic compounds utilizing recombinant DNA technology and Bioluminescence" Chemistry Express. 6. 415-418 (1991)
[文献書誌] A.Seki,E.Tamiya,I.Karube: "Amplification immunoassay for the determination of HBs" Appl.Biochem.Biotech.27. 259-265 (1991)
[文献書誌] S.M.Lee,M.Suzuki,E.Tamiya,I.Karube: "Microbial detection of toxic compounds utilizing recombinant DNA technology and Bioluminesconce" Anal.Chim.Acta. 244. 201-206 (1991)
[文献書誌] H.Endo,M.Suzuki,K.Sode,E.Tamiya,I.Karube: "Rapid determination of plasmed‐carrying yeast cells by using an image sensor system" Biotechnol.Bioeng.,. 38. 1331-1336 (1991)
[文献書誌] 軽部征夫: "バイオのはなし" 日本実業出版社, 241 (1991)
[文献書誌] 軽部征夫: "バイオエレクトロニクスの未来" NTT出版, 226 (1992)

1991 年度 実績報告書

DNAセンシングシステムの開発

研究代表者

軽部 征夫 東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (50089827)

研究成果

[文献書誌] T.Herning,E.Tamiya,S.Kobayashi,I.Karube: "Specific liguid DNA hybridization kinetics measured by fluorescence polarization" Anal.Chim.Acta. 244. 207-213 (1991)

[文献書誌] M.Tsuruoka,E.Tamiya,I.Karube: "Fluorescence polarization immunoassay employing immobilized antibody" Biosensors&Bioelectronics. 6. 501-505 (1991)

[文献書誌] S.M.Lel,M.Suzuki,E.Tamiya,I.Karube: "Anovel microbial sensor for the determination of toxic compounds utilizing recombinant DNA technology and Bioluminescence" Chemistry Express. 6. 415-418 (1991)

[文献書誌] A.Seki,E.Tamiya,I.Karube: "Amplification immunoassay for the determination of HBs" Appl.Biochem.Biotech.27. 259-265 (1991)

[文献書誌] S.M.Lee,M.Suzuki,E.Tamiya,I.Karube: "Microbial detection of toxic compounds utilizing recombinant DNA technology and Bioluminesconce" Anal.Chim.Acta. 244. 201-206 (1991)

[文献書誌] H.Endo,M.Suzuki,K.Sode,E.Tamiya,I.Karube: "Rapid determination of plasmed‐carrying yeast cells by using an image sensor system" Biotechnol.Bioeng.,. 38. 1331-1336 (1991)

[文献書誌] 軽部 征夫: "バイオのはなし" 日本実業出版社, 241 (1991)

[文献書誌] 軽部 征夫: "バイオエレクトロニクスの未来" NTT出版, 226 (1992)

1991 年度実績報告書

軽部征夫東京大学, 先端科学技術研究センター, 教授 (50089827)

[文献書誌] 軽部征夫: "バイオのはなし" 日本実業出版社, 241 (1991)

[文献書誌] 軽部征夫: "バイオエレクトロニクスの未来" NTT出版, 226 (1992)