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1993 年度 研究成果報告書概要

微生物の16S類似rRNAデータベースによるコンピュータ同定システムの作製

研究課題

研究課題/領域番号 03304017
研究種目

総合研究(A)

配分区分補助金
研究分野 応用微生物学・発酵学
研究機関東京大学

研究代表者

小柳津 広志  東京大学, 大学院・農学生命科学研究科, 助教授 (70177301)

研究分担者 蒲生 卓磨  農林水産省農業生物資源研究所, 部長
中瀬 崇  理化学研究所, ライフサイエンス培養生物部, 部長
斉藤 成也  国立遺伝学研究所, 助教授 (30192587)
山田 雄三  静岡大学, 農学部, 教授 (20013328)
山里 一英  東京大学, 応用微生物研究所, 教授 (40013320)
研究期間 (年度) 1991 – 1993
キーワード16S rRNA / 18S rRNA / 微生物 / 分子系統 / コンピュータ同定システム / 塩基配列
研究概要

この研究は微生物をいかに簡単に同定するか、その手法を確立することを目指したものであり、研究グループは総勢20名からなり、リボソームのスモ-ルサブユニットRNA(SSU rRNA)に着目して結成された。東京大学応用微生物研究所の山里は細菌の非硫黄光合成細菌、Flavobacterium-Cytophaga、東京大学農学部の小柳津は細菌のプロテオバクテリア群、野田産業科学研究所の亀倉は好塩性古細菌、岐阜大医学部の江崎は嫌気性グラム陽性球菌、東京大学海洋研究所の清水、大和田は海洋性のプロテオバクテリア、静岡大学農学部の山田は子のう菌類、京都女子大の高桑は無色硫黄細菌、農林水産省食品総合研究所の森は乳酸菌、発酵研究所の長谷川は放線菌、発酵研究所の横田はアクチノバクテリア全般、東北大学遺伝生態研究センターの服部は低栄養細菌、東京大学応用微生物研究所の杉山は原始的な高等菌類、理化学研究所の中瀬は酵母、同鈴木はアクチノバクテリア、東大農学部の五十嵐は水素資化細菌を担当し、それぞれ膨大なデータを得た。また、国立遺伝学研究所の斉藤は系統樹作製法の開発にあたり、パソコンで簡便に使用できるNJ法のプログラムを作製した。

  • 研究成果

    (4件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (4件)

  • [文献書誌] Oyaizu,H., Matsumoto,S.and Gamou,T.,: "Distribution of rhizobia in leguminous plants surveyed by phylogenetic identification" J.Gen.Appl.Microbiol.39. 339-354 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Oyaizu,H., Matsumoto,S.and Takeda,H.,: "Origin of chlorophetes chloroplasts" J.Gen.Appl.Microbiol.39. 313-319 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Oyaizu, H., Matsuimoto, S.and Gamou, T.: "Distribution of rhizobia in leguminous plants surveyed by phylogenetic identification" J.Gen.Appl.Microbiol.Vol.39. 339-354 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Oyaizu, H., Matsumoto, S.and Takeda, H.: "Origin of chlorophetes chloroplasts" J.Gen.Appl.Microbiol.Vol.39. 313-319 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 1999-03-16  

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