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1993 年度 研究成果報告書概要

DNAによる金属錯体のキラリティー認識と生理活性

研究課題

研究課題/領域番号 03403009
研究種目

一般研究(A)

配分区分補助金
研究分野 無機・錯塩・放射化学
研究機関東京大学

研究代表者

黒田 玲子  東京大学, 教養学部, 教授 (90186552)

研究分担者 杉山 亨  東京大学, 教養学部, 助手 (40242036)
松下 信之  東京大学, 教養学部, 助手 (80219427)
研究期間 (年度) 1991 – 1993
キーワードDNA / キラリティー / 金属錯体 / 分子認識 / 誘起CD
研究概要

我々は水溶性ポルフィリンが、通常の水素結合形成能がないにもかかわらずDNAの塩基配列を認識することを生化学的実験から見いだした。誘起CD・吸収スペクトルを併合し、CDスペクトルをガウス曲線に分解することで、複雑なDNA-ポルフィリンの系で半定量的に結合モードと塩基配列の選択性が解析できるようになった。
ポルフィリンの高い塩基配列認識に、第2の機能部位が寄与しているか、または、正の電荷分布が寄与しているかを調べるため、変異原物質Glu-P-1やesterをポルフィリンから延ばした側鎖の先に付けた化合物、あるいは、4-N-methylpyridiniumyl基が1個、tolyl基で置換された化合物を合成し、DNAとの相互作用を調べた。その結果、すべてのポルフィリンは同じ高い塩基配列選択性を示し、認識にはポルフィリン核が重要で、かつ、+3の電荷で十分であることが明かとなった。
また、ポルフィリンのfree base体とDNAとの複合体の分子力場計算を行なった。安定性はside on model(minor groove)>major groove model〜face on model(minor groove)の順で、Coulomb energyよりはnon-bond energyが差に効いていることが示された。
一方、キラルな銅錯体[Cu(o-phen)(X-pro)]Cl・nH_2O(X=D or L,o-phen=1,10-phenanthroline,pro=proline)を合成した。DNA切断活性はD-体の方がL-体よりも約10%活性が高い。錯体のキラリティーがDNAのキラリティーを認識し、異なった生理活性を示したと考えられる。錯体の単結晶X線構造解析を行なった。
キラリティーを鉄の近傍に固定するためにキラルなヒスチジンを第2の機能部位としイミダゾール環が配位するようにデザインしたポルフィリン鉄錯体の合成も行なった。最終化合物の一歩手前まできており、今後、DNAによるキラリティー認識を検討したい。

  • 研究成果

    (26件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (26件)

  • [文献書誌] K.Konishi: "Chiral N-substituted Porphyrins Related to Heme Inactivation Products.First Crystallographic Determination of Absolute Stereochemistry and Correlation with Circular Dichroism." Journal of the American Chemical Society. 115. 1169-1170 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Sequence Specific Interaction of DNA with Water-soluble Porphyrins." Nucleic Acids Symposium Series. 29. 123-124 (1993)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Shinomiya: "Synthesis of Novel DNA Photocleaving Agents with Potential Sequence Specificity." Tetrahedron Letters. 33. 2697-2700 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Chiral Discriminations and Crystal Packing.Two Diastereomeric Compounds Involving Complex Ions of D_3 Symmetry,[Tris(ethylenediamine)cobalt(III)]and[Tris(oxalato)rhodium(III)]." Inorganic Chemistry. 30. 4954-4959 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Analysis of DNA Binding Modes of Porphyrins as Studied by Induced Circular Dichroism Spectroscopy." Chemical Communication. (to be submitted).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Sequence Specific Binding Determined by Restriction Enzyme Inhibition and DNase I Footprinting Studies." Nucleic Acids Research. (to be submitted).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Photocleavage of DNA by the p-Nitrobenzoyl Group Covalently Linked to Proflavine." Biochem.Biophys.Res.Commun.,. 181. 1266-1270 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Structure of New DNA Photocleaving Agents:3,6-Diamino-10-[6-(4-nitrobenzoyloxy)hexyl]acridinium chloride and 9-[6-(4-Nitrobenzoyloxy)hexylamino]acridine Hydrochloride." Acta Cryst.,. C48. 512-515 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S.Kobayashi: "Synthesis of Thiazoe-Based DNA-Targeting Molecules Aiming at Guanine Specificity." Synlett. 59-61 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Origin of Sequence Specific Cleavage of DNA by Bleomycins.Sequence Specificity." Nucleic Acids Symp.Ser.,. 27. 9-10 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M.Orma: "Escherichia-coli DNA Gyrase:Genetic Analysis of gyrA and gyrB Mutations Responsible for Thermosensitive Enzyme Activity." FEBS Letters. 312. 61-65 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T.Kajiwara: "A Dynucleating Bis(dimethylcyclam)Ligand and Its Dinickel(II)and Zinc(II)Complexes with the Face-to-face Ring Arrangement." Inorg.Chem.,. 32. 4990-4991 (1993)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Toru Sugiyama: "Transition-metal binding site of Bleomycin.Significance of the β-Aminoalaninamide Appendage in Regulating Oxygen Activation." Heterocycles. 37. 275-282 (1994)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda: "Chiral Discriminations and Crystal Packing. Two Diastereomeric Compounds Involving Complex Ions of D3 ymmetry, [Tris(ethylenediamine)cobalt(III)] and [Tris(oxalato)rhodium(III)]." Inorg. Chem.30. 4954-4959 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda and M.H.Shinomiya: "Photocleavage of DNA by the p-Nitrobenzoyl Group Covalently Linked to Proflavine" Biochem. Biophys. Res. Commun. 181. 1266-1270 (1991)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda and M.H.Shinomiya: "Structure of New DNA Photocleaving Agents : 3,6-Diamino-10-[6-(4-nitrobenzoyloxy)hexyl] acridinium chloride and 9-[6-(4-Nitrobenzoyloxy) hexylamino]acridine Hydrochloride" Acta Cryst. C48. 512-515 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S.Kobayashi, R.Kuroda, T.Watanabe and M.Otsuka: "Synthesis of Thiazoe-Based DNA-Targeting Molecules Aiming at Guanine Specificity" Synlett. 59-61 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Shinomiya and R.Kuroda: "Syuthesis of Novel DNA Photocleaving Agents with Potential Syquence Specificity" Tetrahedron Lett.33. 2697-2700 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda, M.Shinomiya and M.Otsuka: "Origin of Sequence Specific Cleavage of DNA by Bleomysins" Nucleic Acids Symp. Ser.27. 9-10 (1992)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M.Orma, R.Kuroda and L.M.Fisher: "Echerichia-coli DNA Gyrase : Genetic Analysis of gyrA and gyrB Mutations Responsible for Thermosensitive Enzyme Activity." FEBS Letters. 312. 61-65 (1992)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] K.Konichi, Y.Takahata, T.Aida, S.Inoue and R.Kuroda: "Chiral N-substituted Porphyrins Related to Home Inactivation Products. First Crystallographic Determination of Absolute Stereochemistry and Correlation with Circular Dichroism." J.Am. Chem. Soc.115. 1169-1170 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda, H.Tanaka and S.Watanabe: "Sequence Specific Interaction of DNA with Water-soluble porphyrins." Nucleic Acids Symp. Ser.29. 123-124 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] T.Kajiwara, T.Yamagishi, H.Kida, R.Kuroda and T.Ito: "A Dynucleating Bis(dimethylcyclam) Ligand and Its Dinickel (II) and Zinc (II) Complexes with the Face-to-face Ring Arrangement" Inorg. Chem.32. 4990-4991 (1993)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Toru Sugiyama, Masaji Ohno, Masakatsu Shidasaki, Masami Otsuka, Yukio Sugiura, Susumu Kobayasi, and Kenji Maeda: "Transition-metal binding site of Bleomycin. Significance of the beta-Aminoalaninamide Appendage in Regulating Oxygen Activation" Heterocycles. 37. 275-282 (1994)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda, S.Watanabe and E.Takahashi: "Binding of Porphyrins and Metalloporphyrins to DNA : Sequence Binding Determined by Restriction Enzyme Inhibition and DNase I Footprinting Studies" Nucleic Acids Res.(to be submitted.).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] R.Kuroda and H.Tanaka: "Analysis of DNA Binding Modes of Porphyrins as Studied by Analysis of DNA Binding Modes of Porphyrins as Studied by Induced Circular Dichroism Spectroscopy" J.Chem. Soc. Chem. Commun.(to be submitted.).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 1995-03-27  

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