1995 年度実績報告書

ゲノム解析に伴う大量知識情報処理の研究(総括班)

研究課題

研究課題/領域番号	04261102
研究機関	京都大学
研究代表者	金久實京都大学, 化学研究所, 教授 (70183275)
研究分担者	磯野克己神戸大学, 理学部, 教授 (70011640) 米澤明憲東京大学, 理学系研究科, 教授 (00133116) 美宅成樹東京農工大学, 工学部, 教授 (10107542) 高木利久東京大学, 医科学研究所, 教授 (30110836) 松原謙一大阪大学, 細胞生体工学センター, 教授 (20037394)
キーワード	ゲノム解析 / 配列解析 / 蛋白質・核酸の構造と機能 / データベース / ネットワーク
研究概要	重点領域研究「ゲノム情報」総括班では、6月22日と3月12日に総括班会議を開催し、本領域最終年度の研究計画の取りまとめと調整、研究成果の評価を行った。これまで5年間定期的に行ってきた公開行事を継続し、まず第5図ゲノム情報チュートリアルを7月5〜8日に神戸市三田で開催した。今年は「ゲノムと医学」と題したチュートリアルで、ゲノム情報と医学との接点を求め、また例年通り班員・班友による研究成果発表会を行った。第6回ゲノム情報ワークショップは12月11〜12日にパシフィコ横浜会議センターで開催し、招待講演5件、口頭発表9件、ポスター発表29件、ワークステーション発表12件、それに企業展示11件が行われた。参加者は275名であった。第18回日本分子生物学会年会では本領域関連のシンポジウム「情報生物学の展開」が12月6日に名古屋で開かれ、その際マッキントッシュを自由端末として年会参加者に提供した。第33回日本生物物理学会年会では例年通り「ゲノム情報」のセッションが、9月24日に北海道で行われた。ゲノムネットデータベースサービスは世界70ヵ国以上から月間40万件も利用されるようになり、その利用法を図書として出版する予定である。その他、本領域研究の内容を紹介する単行本や学会誌特集の企画・執筆も行った。基礎研究については来年度に成果とりまとめを行う予定である。ゲノム情報ニュースは年4回発行し、それぞれ約2000人に配布した。

研究成果
(8件)

すべてその他

すべて文献書誌 (8件)

[文献書誌] Ogata,H.,Akiyama,Y.,Kanehisa,M.: "A genetic algorithm based molecular modeling technique for RNA stem-loop structures." Nucleic Acids Res.23. 419-426 (1995)
[文献書誌] Tomii,K.,Kanehisa,M.: "Analysis of amino acid indices and mutation matrices for sequence comparison and structure prediction of proteins." Protein Eng.(in press). (1996)
[文献書誌] 高木利久: "演澤データベースのゲノム情報処理への応用" 人工知能学会誌. 10. 17-23 (1995)
[文献書誌] Mitaku,S.他: "Interaction stabilizing tertiary structure of bacteriorhodopsin studied by denaturation experiments." Proteins. 22. 350-362 (1995)
[文献書誌] Suwa,M.,Hirokawa,T.,Mitaku,S.: "A continuum theory for the prediction of lateral and rotational positioning of α-helices in membrane proteins:Bacteriorhodopsin." Proteins. 22. 363-377 (1995)
[文献書誌] Nakaya,A.,Yamamoto,K.,and Yonezawa,A.: "RNA secondary structure prediction using highly parallel computers." CABIOS. 11. 685-692 (1995)
[文献書誌] Hagiya,M.,Miyano,S.,Nakai,K.,Suyama,A.,Yokomori,T.,Takagi,T.: "Proceedings of Genome Informatics Workshop 1995" Universal Academy Press,Inc., 179 (1995)
[文献書誌] 美宅成樹、金久實: "ヒトゲノム計画と知識情報処理" 倍風館, 215 (1995)

1995 年度 実績報告書

ゲノム解析に伴う大量知識情報処理の研究(総括班)

研究代表者

金久 實 京都大学, 化学研究所, 教授 (70183275)

研究成果

[文献書誌] Ogata,H.,Akiyama,Y.,Kanehisa,M.: "A genetic algorithm based molecular modeling technique for RNA stem-loop structures." Nucleic Acids Res.23. 419-426 (1995)

[文献書誌] Tomii,K.,Kanehisa,M.: "Analysis of amino acid indices and mutation matrices for sequence comparison and structure prediction of proteins." Protein Eng.(in press). (1996)

[文献書誌] 高木利久: "演澤データベースのゲノム情報処理への応用" 人工知能学会誌. 10. 17-23 (1995)

[文献書誌] Mitaku,S.他: "Interaction stabilizing tertiary structure of bacteriorhodopsin studied by denaturation experiments." Proteins. 22. 350-362 (1995)

[文献書誌] Suwa,M.,Hirokawa,T.,Mitaku,S.: "A continuum theory for the prediction of lateral and rotational positioning of α-helices in membrane proteins:Bacteriorhodopsin." Proteins. 22. 363-377 (1995)

[文献書誌] Nakaya,A.,Yamamoto,K.,and Yonezawa,A.: "RNA secondary structure prediction using highly parallel computers." CABIOS. 11. 685-692 (1995)

[文献書誌] Hagiya,M.,Miyano,S.,Nakai,K.,Suyama,A.,Yokomori,T.,Takagi,T.: "Proceedings of Genome Informatics Workshop 1995" Universal Academy Press,Inc., 179 (1995)

[文献書誌] 美宅成樹、金久實: "ヒトゲノム計画と知識情報処理" 倍風館, 215 (1995)

1995 年度実績報告書

金久實京都大学, 化学研究所, 教授 (70183275)