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ジェフリーズによって開発されたDNAを利用した個人識別法は法医鑑識に新しい可能性を拓いた。さらに、DNAの一部分を選択的に増幅するPCRを用いた方法により、微量な試料の分析も可能になってきた。ただ、通常のPCRでは数+ngから数ng程度のDNAは必要とされている。我々はHLAクラスII領域のDNA多型を検出する方法の開発や法医学領域への応用について検討を進めてきた。本研究では塩基配列の直接解読によるHLAクラスII型の型判定を実施することを目指している。平成4年度の研究では、まず血痕などの体液斑や変性した組織などの法医資料からPCRによるDNAの増幅が可能な不純物の少ないDNA抽出条件やPCRの条件の設定にまず力を注いだ。従来は有機溶媒による抽出が一般的であるが、PCRの際に用いられるTag DNAポリメラーゼを阻害する物質(例えば血痕ではヘマチンが主体と考えられている)の混入が避けられない。最近はBSAをPCRバッファーに入れることで不純物の作用を抑制することが試みられているが、本研究ではこのBSAの添加量の検討を行い、効果的な条件を検討した。また、微量の資料ではDNA抽出の際に器具への非特異的吸着があるため、抽出時にサケ精子DNAを添加することで回収率を大幅に改善することができた。このため微量の法医資料でもDNAの増幅を安定して行えるようになった。現在、この増幅したDNAにつきシーケンサーによる塩基配列の決定法の確立を進めている。
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