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2004 年度 実績報告書

細菌べん毛の自己構築とスイッチ機構

研究課題

研究課題/領域番号 04F04171
研究機関大阪大学

研究代表者

難波 啓一  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 教授

研究分担者 ROLAND DECENKOLBE  大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 外国人特別研究員
キーワード1分子計測(SMD) / 電子顕微鏡 / ナノバイオ / ナノマシン / 分子モーター
研究概要

細菌の運動器官であるべん毛は、20数種類の蛋白質から構成される生体超分子で、回転モータである基部体、らせん繊維型プロペラとして働くフィラメント、そしてそれらを連結してユニバーサルジョイントとして働くフックと、おおまかに3つの部分からなる。べん毛フィラメントはフラジェリンが非共有結合でらせん状に重合したチューブ構造で、極低温電子顕微鏡像の画像解析による構造解析法の長年にわたる工夫によってその原子モデルの構築に成功し、2003年8月のNatureに発表した。
フックの構造はフィラメントに比べて短く、電子顕微鏡だけによる高分解能構造解析が困難であったため、その直線型チューブ構造についての低温電子顕微鏡像の画像解析法による低分解能立体像と、サブユニット蛋白質FlgEフラグメントのX線結晶構造解析法による原子モデルを組み合わせ、擬似原子モデルを構築することに成功した。されに、曲がったフックの原子モデルを構築し、この原子モデルをもとにした計算機による分子動力学シミュレーションにより、ドメイン間の相互作用表面で一定数の水素結合やファンデアワールス接触点を保ちつつ、結合相手の原子を順次替えることで相互に滑りを起こし、各素繊維の約30%にもおよぶ伸縮により、ユニバーサルジョイント機能を実現していることが明らかになった。(Samatey et al. Nature 2004)
Roland DEGENKOLBE研究員は、基部体の蛋白質であるFliMとFliN、そしてべん毛蛋白質輸送装置の基幹サブユニットであるFlilとFliHが形成する複合体について、電子顕微鏡とX線回折法を組み合わせた超分子立体構造解析手法によるその全体構造の解析をめざして、大腸菌による大量発現系を用いた蛋白質試料の調整法、精製法の工夫をし、それを確立した。結晶化とX線結晶構造解析、そして電子顕微鏡による立体構造解析をめざした研究作業を、段階的に着実に進めているところである。

  • 研究成果

    (9件)

すべて 2004 その他

すべて 雑誌論文 (8件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Stabilization of flagellar filaments by HAP2 capping.2004

    • 著者名/発表者名
      Dioszeghy, Z., et al.
    • 雑誌名

      FEBS 28479

      ページ: 1-5

  • [雑誌論文] Self-assembly and type III protein export of the bacterial flagellum.2004

    • 著者名/発表者名
      Minamino, T., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Microbiology and Biotechnology 7

      ページ: 5-17

  • [雑誌論文] in vitro Characterization of FlgB, FlgC, FlgF, FlgG, FliE, Flagellar Basal Body proteins of Salmonella.2004

    • 著者名/発表者名
      Hamano, Y., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology 339

      ページ: 423-435

  • [雑誌論文] Structure and Domain Organization of Salmonella Flik, a Hook-Length Contorol Protein, in Solution.2004

    • 著者名/発表者名
      Minamino, T., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology 341

      ページ: 491-502

  • [雑誌論文] Structural and Functional Analysis of the C-terminal Cytoplasmic Domain of FlhA, an Integral Membrane Component of the Type III Flagellar Protein Export Apparatus in Salmonella.2004

    • 著者名/発表者名
      Hamano, Y., et al.
    • 雑誌名

      Journal of Molecular Biology 343

      ページ: 457-466

  • [雑誌論文] Structure of the bacterial flagellar hook and implication for the molecular universal joint mechanism.2004

    • 著者名/発表者名
      Samatey, F.A., et al.
    • 雑誌名

      Nature 431

      ページ: 1062-1068

  • [雑誌論文] Crystallization of a core fragment of the flagellar hook protein, FlgE.2004

    • 著者名/発表者名
      Samatey, F.A., et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D 60

      ページ: 2078-2080

  • [雑誌論文] Crystallographic analysis of the circadian clock protein KaiB form the thermophilic cyanobacterium Themosynechococus elongates BP-1.2004

    • 著者名/発表者名
      Iwase, R., et al.
    • 雑誌名

      Acta Crystallographica Section D 60

      ページ: 727-729

  • [図書] Spring8 Research Frontiers 2005

    • 著者名/発表者名
      Kshimoto, A., et al.
    • 出版者
      (財)高輝度光科学研究センター(in press)

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公開日: 2006-07-12   更新日: 2016-04-21  

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