RAPDを用いたイネ量的形質遺伝解析法の開発

1995 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 05454040
• 研究機関: 京都大学
• 研究代表者: 谷坂 隆俊 京都大学, 農学部, 助教授 (80026591)
• 研究分担者: 井上 博茂 京都大学, 農学部, 助手 (40260616) ; 中崎 鉄也 京都大学, 農学部, 助手 (60217693) ; 奥本 裕 京都大学, 農学部, 講師 (90152438)
• キーワード: イネ / 量的形質 / 突然変異 / RAPD / 遺伝子分析

研究概要

ガンマ線、化学薬品および突然変異誘発遺伝子(mutator)によって誘発された50の出穂期、稈長および粒型突然変異系統のゲノムDNAを、植物体の葉身からCTAB法によって抽出したのち、DNA合成装置(平成5年度本補助金により購入)によって合成した約100種類のプライマー、並びに約100種類の既製のプライマー(オペロン社製)を用いて、PCRを実施し、増幅DNA部位多型(RAPD)が原品種と突然変異系統間に存在するか否かを調査した。その結果、約半数の出穂期および稈長突然変異系統が原品種との間に明らかなRAPD部位をもつこと、またRAPD部位は1プライマー当たり約10^<-2>の確率で検出しうることが明らかになった。しかし、その他の出穂期、稈長および粒型突然変異系統に関しては明瞭なRAPD部位が観察されず、他種類のプライマーを用いる必要があると考えられた。また、原品種と突然変異系統間のRAPD多型出現頻度は、原品種と近縁品種(日本品種)間より著しく低く、突然変異系統は互いに(原品種を含めて)極めて酷似した遺伝的背景をもつことが実証された。次いで、原品種との間にRAPD多型が観察された突然変異系統と原品種間の交雑F_2を用いて、突然変異遺伝子とRAPD部位との関係を調査した。その結果、3突然変異系統に関して、突然変異遺伝子とRAPD部位とが共分離することが明らかになったが、その他の系統に関しては共分離が認められなかった。以上の結果と、同一材料に関して行った制限酵素断片長多型(RFLP)分析の結果から、イネ量的形質の遺伝解析にはRFLP法よりRAPD法を用いる方が明らかに効率的であること、しかし、RAPD法を育種の実践に移すためにはより多くのバンドを検出しうるPCR法の開発が必要であることが結論された。

研究成果

• [文献書誌] Arzate Fernandez, A. M.: "Development of Diploid and triploid hybrids between Lilium Longiflorum and L. Concolar by ovary slice culture" Plant Breeding. 115(in press). (1996)
• [文献書誌] Okumoto, Y.: "Photoperiod insensitivity gene essntial to the varieties grown in the northern limit region of paddy rice (Oryza sativa L.) cultivation" Euphytica. 86(in press). (1996)
• [文献書誌] Ichitani,K.: "Heading-time genes controlling the photoperiod insensitivity of a rice variety Norin 20" Rice Genetics. 3(in press). (1996)
• [文献書誌] Okumoto, Y.: "Effects of three heading-timn gene loci., Se-1, E1 and Ef-1, on the varietal difference of japonica-type rice" Rice Genetics. 3(in press). (1996)
• [文献書誌] Tanisaki, T.: "Gene anaiysis of induced mutations in rice" Gamma Field Symposia. 34(in press). (1996)
• [文献書誌] 寺石政義: "RLGS(Restriction Landmark Genomic Scanning method)によるイネmutator特異的DNAスポットの探索" 近畿作育研究. 41(印刷中). (1996)