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1.イネ栽培種ミトコンドリアDNAの制限酵素断片長多型
イネ栽培種、日本型(4)、インド型(4)及びジャワ型(2)の合計10品種を用いてミトコンドリア遺伝子プローブとのサザンハイブリダイゼーションにより制限酵素断片長多型(RFLP)を解析した。その結果、8種のプローブのうちcoxI、atp6をプローブに用いた場合、生態種によって付加的な断片の出現や消失が認められ、制限酵素xbaIで切断し、rrn18をプローブに用いた場合、一部のインド型品種に0.2kbの欠失が認められた。ジャワ型品種は日本型品種と同一のパターンを示した。
2.イネ属ミトコンドリアDNAの類縁関係と進化
イネ栽培種2種及びイネ属野性種10種、合計22系統を用い、全DNAを制限酵素、Hind III及びEcoR Iで切断後、8種のミトコンドリア遺伝子プローブとのサザンハイブリダイゼーションを行った。得られた制限酵素断片長パターンより共通に存在するDNA断片の割合を求め、平均距離法(UPGMA)により系統間の遺伝距離を求め、クラスタリングを行い系統樹を作成した。その結果、多くの種で種内変異がみられたものの、AAゲノムのO.sativa、O.glaberimma、O.breviligulata及びO.ruffipogonは一つのクラスターを形成した。O.punctata(BB)とO.punctata(BBCC)間やO.punctata(BBCC)とO.minuta(BBCC)間でも多型は認められたが、比較的類似していた。O.officinalis(CC)とO.eichingeri(CC)は互いに類似し、またO.latifolia(CCDD)とO.alta(CCDD)も類似しており、結局O.officinalis複合体のBB、BBCC、CC及びCCDDゲノム種は大きなクラスターを形成した。O.australiensis(EE)はCCDDゲノム種と類似していたが、O.brachyanth(FF)はいずれのクラスターにも入らず、最もO.sativaと遠縁であることが示唆された。
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