ヒトHLA遺伝子群の全領域の遺伝子構成とゲノム動態の解明

1995 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 06044201
• 研究機関: 東海大学
• 研究代表者: 猪子 英俊 東海大学, 医学部, 教授 (10101932)
• 研究分担者: TROWSDALE Jo Imperial Cancer Research Fund Human Immu, 主任研究員 ; 安藤 麻子 東海大学, 医学部, 講師 (40101935)
• キーワード: HLA / 塩基配列解析 / コスミドクローン / 遺伝子構成 / 多型性 / コスミドコンティグ / ホモロジー解析 / ショットガン法

研究概要

HLA-DP領域よりセントロメア側の領域については、常染色体劣性の嚢胞性腎炎の発症に関与する可能性の高いHKE6遺伝子、及びRING1、HKE4を含むコスミドクローン(42kb)のほぼ全塩基配列をショットガン法によって決定した。その結果、cDNAクローンとの塩基配列の比較から、RING1は、5エキソン、HKE4は、7エキソン、HKE6は、8エキソンから構成されていることが明らかになった。現在、研究分担者のJ.Trowsdaleと共同して、この領域の新遺伝子の探索を行っているが、これらの3遺伝子以外の領域は、Alu配列が密に存在することが明らかになった。一方、HLAクラスII-III領域間については、マウスのint-3遺伝子のヒトホモログ遺伝子であるINT3の5'上流領域にみいだされたCTG繰り返し配列とINT3遺伝子の多型性を日本人健常者及びINT3遺伝子がその発症に関与している可能性がある耳下腺腫の患者について検討したところ、CTG繰り返し配列には5種類の多型性が存在したが、耳下腺腫患者の腫瘍組織では繰り返し配列数の増加は認められなかった。さらに、INT3遺伝子とその周辺領域について、ジェノミックサザンハイブリダイゼーションによって観察される欠失や転座などの異常は、現在までのところ認められていない。また、HLA-B,-C遺伝子付近は、ベーチェット病と尋常性乾癬の両疾患の原因遺伝子がマップされる領域であるが、この領域付近をカバーするコスミドクローン5個の計150kbの塩基配列を決定した。その結果、既存の遺伝子とのホモロジー解析やエキソン検索プログラムを用いた解析、並びにノザンハイブリダイゼーションから、この領域には少なくとも5個の新発現遺伝子が存在することが明らかになった。現在これらの新遺伝子のcDNAクローンの分離と両疾患における変異を解析している。

研究成果

• [文献書誌] Nagata T.et al.: "Physical mapping of the retinoid X receptor βgene in mouse and man." Immunogenetics. 41. 74-82 (1995)
• [文献書誌] Fukagawa T.et al.: "A boundary of long-range G+C% mosaic domains in the human MHC locus : Pseudoautosomal boundarylike sequence exists near the boundary." Genomics. 25. 184-191 (1995)
• [文献書誌] Altmann DM,et al.: "The T cell response of HLA-DR transgenic mice to myelin basic protein and other antigens in the presence and absence of human CD4." J.Exp.Med.181. 867-875 (1995)
• [文献書誌] Mizuki N.et al.: "Microsatteilite polymorphism between the TNF and HLA-B genes in Behcet's disease." Hum.Immunol.43. 129-135 (1995)
• [文献書誌] Shiina T.et al.: "Residual b-cell function and HLA-A24 in insulin-dependent diabetes mellitus : markers of glycemic control and subsequent development of diabetic retinopathy." Immunogenetics. 42. 213-216 (1995)
• [文献書誌] Nakanishi K.et al.: "Residual β-cell function and HLA-A24 in insulin-dependent diabetes mellitus : markers of glycemic control and subsequent development of diabetic retinopathy." Diabetes. 44. 1334-1339 (1995)
• [文献書誌] Naruse T.K.et al.: "Advances in HLA typing,Proceedings of the 11th Japan HLA Workshop" Official Journal of Japanese Society for Histocompatibility and Immnogenetics, 65-72 (1995)
• [文献書誌] Onishi H.et al.: "Advances in HLA typing,Proceedings of the 11th Japan HLA Workshop" Official Journal of Jananese Society for Histocompatibility and Immnogenetics, 73-95 (1995)
• [文献書誌] 井原征二、他: "バイテクノロジー概論" 朝倉書店, 44-62 (1995)
• [文献書誌] 猪子英俊: "タンパク質化学9" 広川書店, 337-344 (1995)
• [文献書誌] 安藤麻子、他: "Bio Science用語ライブラリー免疫" 羊土社, 62-64 (1995)
• [文献書誌] 大城戸宗男、他: "第24回日本医学学会総会 総会会誌II" 名古屋大学出版会, 398-399 (1995)