1994 年度実績報告書

PCRダイレクトシーケンス法の改良および絶滅種を含む哺乳類進化の分子系統学的解析:ミトコンドリアDNAおよび核内リボソームDNAの遺伝的分化

研究課題

研究課題/領域番号	06273201
研究機関	北海道大学
研究代表者	増田隆一北海道大学, 理学部, 助手 (80192748)
キーワード	PCR / DNAシーケンス / 絶滅種 / 哺乳類 / 進化 / 分子系統 / ミトコンドリアDNA / 種間関係
研究概要	本年度の研究成果は以下の通りである。 1.DNA抽出法およびPCR法を改良・簡略化し、PCRダイレクトシーケンス法の改善化をはかった結果、明瞭なシーケンスデータをより迅速に得ることができるようになった。 2.ネコ科におけるイリオモテヤマネコの進化遺伝学的位置を探究するため、mtDNAの12SrRNA遺伝子およびチトクロームb遺伝子の部分領域について塩基配列を決定し比較解析した結果、イリオモテヤマネコはアジアに広く分布するベンガルヤマネコに極めて近縁であることが明らかになった。塩基置換から推定した両ヤマネコの分岐年代は約20万年前と推定され、これは琉球列島がアジア大陸から分離した地質学的年代とほぼ一致した。 3.日本産を中心とするイタチ科11種においてチトクロームb遺伝子領域の塩基配列を決定し、その系統種間関係を考慮することができた。その中でも、従来、同種(亜種)または別種と議論されてきたニホンイタチとシベリアイタチの間の遺伝的分化が各々の種内変異よりも大きいことが明らかになった。 4.ニホンジカにおける12SrRNA遺伝子およびチトクロームb遺伝子の部分領域ならびにD-loop全塩基配列を決定し、日本列島におけるニホンジカの進化を詳細に考察した。 5.シベリア永久凍土層から発掘された絶滅種マンモス組織(^<14>C年代測定により約9600年前のものと推定)からのDNA抽出とPCR増幅に成功し、チトクロームb、12SrRNAおよび16SrRNAの各遺伝子領域について塩基配列を決定することができた。現在、他のマンモス標本の分析も行いながら現生アジアゾウおよびアフリカゾウと比較し、マンモスの系統進化学的位置の解析を進めている。

研究成果

(6件)

すべてその他

すべて文献書誌 (6件)

[文献書誌] Ryuichi Masuda: "Molecular phylogenetic status of the lriomote cat Felis iriomotensis,inferred from mitochondrial DNA sequence analysis." Zoological Science. 11. 597-604 (1994)
[文献書誌] Ryuichi Masuda: "Amolecular phylogeny of the family Mustelidae(Mammalia,Carnivora),based on comparison of mitochondrial cytochrome b nucleotide sequences." Zoological Science. 11. 605-612 (1994)
[文献書誌] Ryuichi Masuda: "Nucleotide sequence variation of cytochrome b genes in three species of weasels Mustela itatsi,Mustela sibirica,and Mustela nivalis,detected by improved PCR product-direct sequencing technique." Journal of the Mammalogical Society of Japan. 19. 33-43 (1994)
[文献書誌] Jose V.Lopez: "Numt,a recent transfer and tandem amplification of mitochondrial DNA to the nuclear genome of the domestic cat." Journal of Molecular Evolution. 39. 174-190 (1994)
[文献書誌] 増田隆一: "食肉類におけるミトコンドリアDNAの塩基配列解析:PCR法の活用と分子系統への応用-イリオモテヤマネコおよびイタチ科を中心にして-" 哺乳類科学. 34. 81-89 (1994)
[文献書誌] Junko Nagata: "Nucleotide sequences of the cytochrome b and the 12SrRNA genes in the Japanese sika deer(in press)." Journal of the Mammalogical Society of Japan. 20. (1995)

1994 年度 実績報告書

PCRダイレクトシーケンス法の改良および絶滅種を含む哺乳類進化の分子系統学的解析:ミトコンドリアDNAおよび核内リボソームDNAの遺伝的分化

研究代表者

増田 隆一 北海道大学, 理学部, 助手 (80192748)

研究成果

[文献書誌] Ryuichi Masuda: "Molecular phylogenetic status of the lriomote cat Felis iriomotensis,inferred from mitochondrial DNA sequence analysis." Zoological Science. 11. 597-604 (1994)

[文献書誌] Ryuichi Masuda: "Amolecular phylogeny of the family Mustelidae(Mammalia,Carnivora),based on comparison of mitochondrial cytochrome b nucleotide sequences." Zoological Science. 11. 605-612 (1994)

[文献書誌] Ryuichi Masuda: "Nucleotide sequence variation of cytochrome b genes in three species of weasels Mustela itatsi,Mustela sibirica,and Mustela nivalis,detected by improved PCR product-direct sequencing technique." Journal of the Mammalogical Society of Japan. 19. 33-43 (1994)

[文献書誌] Jose V.Lopez: "Numt,a recent transfer and tandem amplification of mitochondrial DNA to the nuclear genome of the domestic cat." Journal of Molecular Evolution. 39. 174-190 (1994)

[文献書誌] 増田隆一: "食肉類におけるミトコンドリアDNAの塩基配列解析:PCR法の活用と分子系統への応用-イリオモテヤマネコおよびイタチ科を中心にして-" 哺乳類科学. 34. 81-89 (1994)

[文献書誌] Junko Nagata: "Nucleotide sequences of the cytochrome b and the 12SrRNA genes in the Japanese sika deer(in press)." Journal of the Mammalogical Society of Japan. 20. (1995)

1994 年度実績報告書

増田隆一北海道大学, 理学部, 助手 (80192748)