| 研究課題/領域番号 |
06276104
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| 研究機関 | 横浜市立大学 |
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研究代表者 |
西村 善文 横浜市立大学大学, 大学院・総合理学研究科, 教授 (70107390)
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| 研究分担者 |
山崎 俊夫 大阪大学, 蛋白質研究所, 助手 (60273710)
石井 俊輔 理化学研究所, 分子遺伝学研究室, 主任研究員 (00124785)
神藤 平三郎 東京薬科大学, 薬学部, 助教授 (80138966)
白木原 康雄 国立遺伝学研究所, 遺伝情報研究センター, 助教授 (20150287)
箱嶋 敏雄 奈良先端大学院大学, バイオサイエンス科, 教授 (00164773)
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| キーワード | 蛋白質 / DNA / 転写因子 / NMR / X線結晶 / 高次構造 / 構造生物学 / 分子認識 |
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| 研究概要 |
本研究班は「蛋白質高次構造のDNAシグナル認識における役割」を担当し、次のような成果を上げることができた。(1)Myb蛋白質のDNA結合ドメインのダイナミクスをNMRにより解析した結果、3個のリピート構造R1,R2,R3のうち、1番熱的に不安定なR2がマイクロ秒からミリ秒の程度で主鎖のコンホメーションが揺らいでいた。R2の疎水的なコアの内部に存在するギャップを埋めるようにミュータントを作製したらミュータントではR2は熱的に安定化しコンホメーションの揺らぎも抑えられたが特異的なDNA結合能と転写活性化能は低下した。R2に存在していた疎水性コアのギャップはDNAに結合するときのR2のコンホメーション変化のために必要であることがわかった。(2)大腸菌のリン酸転移情報伝達因子に関与するArcBのC末ドメインの立体構造をX線結晶によって解析した。全体として腎臓の形をしており6本のαヘリックスから成りその内4本はヘリックスバンドルを形成していた。(3)DNAの複製の終結に関与するタンパク質Tusと終結点のDNAのTerとの複合体の立体構造をX線結晶によって解析した。解析の結果なぜ複製が特異的なDNAで終結するのかの分子機構が議論できた。(4)大腸菌の2成分系制御系で有名な浸透圧応答調節因子OmpRのDNA結合ドメインの立体構造をX線結晶によって解析した。DNA結合モチーフとしてターンが非常に長いヘリックス・ターン・ヘリックス変異体モチーフであることがわかった。(5)Mybタンパク質が転写のコアクチベータであるCBPと結合することがわかった。
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