| 研究課題/領域番号 |
06454664
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| 研究機関 | 名古屋大学 |
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研究代表者 |
郷 通子 名古屋大学, 理学部, 教授 (70037290)
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| 研究分担者 |
由良 敬 名古屋大学, 理学部, 助手 (50252226)
野口 俊之 名古屋大学, 理学部, 助教授 (90172775)
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| キーワード | モジュール / 分子進化 / タンパク質工学 / 立体構造 / エキソンシャッフリング |
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| 研究概要 |
モジュールはタンパク質のコンパクトな構造単位である。モジュールは遺伝子のイントロンと密接な相関を持つ事実から、モジュールはかってエキソンにコードされていたこと、さらにモジュールを組み合わせてタンパク質が進化したことが推定されている。本研究の目的はモジュールを分類し、機能の異なるタンパク質間に共有されるモジュール構造を明らかにすることである。本年度は2年間の計画の初年度であるが、以下の結果を得ることができた。
(1)モジュールの分類法の確立:モジュールの立体構造はモジュール内部の相作用によって決まることを明らかにした。この事実から、モジュールの組み合わせが変わっても、各モジュールの立体構造はほとんど変化しないと考えられる。従って、モジュールの分類は立体構造に基づいて行うのが合理的である。
(2)モジュールの分類:立体構造がデータバンクに登録されているタンパク質から非相同な77個のタンパク質についてモジュールを同定した。得られた950個のモジュールを、その立体構造の比較から66種のグループに分けることができた。
(3)同種類のモジュールが複数のタンパク質に共通に使われていることがわかった。しかも、複数個のモジュールがセットになって、異なるタンパク質に使われている例が2926組中888組も観測された。
(4)一つのタンパク質に同種類のモジュールが複数回使用されているケースが、77タンパク質中29タンパク質で見出された。
以上の結果はタンパク質がモジュールのシャッフリングにより創成・進化した痕跡である、と結論された。
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