骨髄異形成症候群に検出した11q23転座切断点の単離

1995 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 07670256
• 研究機関: 京都府立医科大学
• 研究代表者: 嘉数 直樹 京都府立医科大学, 医学部, 助手 (20264757)
• 研究分担者: 稲澤 譲治 京都府立医科大学, 医学部, 講師 (30193551)
• キーワード: 骨髄異形成症候群 / 11q23 / 転座切断点

研究概要

染色体転座(11;22)(q23;q11)を有する骨髄異形成症候群(Myelodysplastic syndrome:MDS)の11q23転座切断点(MDS11q23切断点)を解析した。
我々は、谷上・中村らによって、この11q23領域にmapされた既知の27個のコスミッドクローンを用いて配列地図を作製した。この過程で、MDS11q23切断点がMLL遺伝子座よりもセントロメア側にあり、両切断点間には少なくとも5つの異なるクローンが存在することを明らかにした。そして、このことからMDS11q23切断点にはMLL遺伝子とは異なる新たな造血器腫瘍の発生に関わる遺伝子の存在することを明らかにした。MDS11q23切断点に最近傍の2つのコスミッドクローンCI11-420と556をプローブとしてCEPHYACライブラリーをスクリーニングし、3種類のYACクローンを同定した。このうち2種類のYACクローンが、MDS11q23切断点を含むことをFISH法によって示した。これらのYACクローンからそれぞれコスミッドライブラリーを作製し、計154個の11q23.1領域特異的クローンを得た。この中に、MDS11q23切断点を含むクローンが存在すると考えられ、このクローンを同定する作業に移った。154個のクローンについて、prophase FISH ordering systemとstretched DNA FISH法を組み合わせた高解像度ordering systemによって、詳細な配列を決定した。そして、最終的には21個のクローンからなるcontigmapを作製した。このcontigmap上でMDS11q23切断点が40kbの距離にある2つのクローン、cosmid23とcosmid54の間に位置することを明らかにした。さらに、この2クローン間に位置し、MDS11q23切断点を含むと考えられるcosmid51を同定した。

研究成果

• [文献書誌] Inazawa,J.et al.: "PTPN13,a Fas-associated protein tyrosine phosphatase located on the long arm of Chromosome 4" Genomics. 31. 240-242 (1996)
• [文献書誌] Mitani,K.et al.: "Cloning of several species of MLL/MEN chimeric cDNA in myeloid leukemia with t(11;19)(q23;p13.1)" Blood. 85. 2017-2024 (1995)
• [文献書誌] Inagaki,N.et al.: "Reconstitution of IKATP:requirement of both a member of the inward rectifier family of ion" Science. 260. 1166-1170 (1995)
• [文献書誌] Ariyama,T.et al.: "Clonal origin of Philadelphia chromosome(Ph)-negative cells with trisomy 8 appearing during" Cancer Genet Cytogenet. 81. 20-23 (1995)
• [文献書誌] Ariyama,T.et al.: "High-resolution cytogenetic map of the short arm of chromosome 1 with newly isolated 411 cosmid markers by" Genomics. 25. 114-123 (1995)
• [文献書誌] Ariyama,T.et al.: "Precise ordering of 26 cosmids markers on 3p21.3-p23 by multicolor fluorescence in situ hybridization on prophase" Cytogent Cell Genet. 70. 129-133 (1995)
• [文献書誌] 嘉数直樹・稲澤譲治・阿部達生: "血液・腫瘍科 特集 MDSの病態と診断" 科学評論社, (1995)
• [文献書誌] 嘉数直樹・稲澤譲治: "メディカル用語ライブラリー・癌(垣添忠生、関谷剛男・編)" 羊土社, (1996)