FISH法を用いた実験動物のゲノム解析技術の開発と比較ゲノム地図の作製

1995 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 07680926
• 研究種目: 一般研究(C)
• 研究機関: 放射線医学総合研究所
• 研究代表者: 松田 洋一 放射線医学総合研究所, 第2研究グループ, 主任研究官 (70165835)
• キーワード: FISH / 遺伝子マッピング / 染色体地図 / R-バンディング / DNAクローン / マウス / ラット / シリアンハムスター

研究概要

ヒト染色体マッピングに広く用いられているダイレクトR-バンディングFISH法をマウス、ラットおよびシリアンハムスター染色体に応用し、これらの動物種のDNAクローンを用いた精度の高い染色体マッピング法を確立した。各種ともに良好な染色体バンド上に鮮明なシグナルが得られ、哺乳類実験動物においてもFISH法による迅速かつ高精度の染色体マッピングが可能となった。この方法は、遺伝的連鎖地図が未だ十分に作製されていない実験動物には特に有効である。FISH法を用いた実験動物の染色体マッピングは非常に効率よく進めることが可能で、これまでにマウスでは、cDNAで0.5kb,ゲノミックDNAで2.5kbまでマッピングすることが出来た。マウスcDNAを用いれば、ラット及びシリアンハムスター染色体上にマウス遺伝子ホモローグを直接マッピングすることは非常に容易であり、これまでにラット染色体上に26個、シリアンハムスター染色体上に5個のマウス遺伝子ホモローグをマッピングした。また、ヒトcDNAプローブを用いて実験動物の染色体上にヒトの遺伝子ホモローグを直接マッピングすることも可能であり、迅速なヒト-実験動物間の比較遺伝子マッピングを行うことが出来る。その場合のマッピング効率は比較的高く、今までのところ最低1.6kbのヒトcDNAクローンがFISH法によってマウス染色体上にマッピングされている。

研究成果

• [文献書誌] Matsuda, Y. and Chapman, V. M.: "Application of fluorescence in situ hybridization in genome analysis of the mouse." Electrophoresis. 16. 261-272 (1995)
• [文献書誌] Yen,C. -H., Matsuda, Y. et al.: "A genomic clone containing a telomere array maps near the centromere of mouse Chrmosome6." Mammalian Genome. 6. 96-102 (1955)
• [文献書誌] Shimokawa, N., Matsuda, Y. and Yamaguchi,M.: "Genomic cloning and chromosomal assignment of rat regucalcin gene." Molecular and Cellular Biochemistry. 151. 57-163 (1995)
• [文献書誌] Harada, Y. -N., Matsuda, Y., Shiomi, N. and Shiomi, T.: "Complementary DNA sequence and chromosomal localization of xpg, the mouse counterpart of human repair gene XPG/ERCC5." Genomics. 28. 57-65 (1995)
• [文献書誌] lnoue, S., Orimo, A., Matsuda,Y.,et al.: "Chromosomal mappings of human and mouse genes for estrogen-responsive finger protein (efp), a member of RING finger family." Genomics. 25. 581-583 (1995)
• [文献書誌] Kaul, S.c., Wadhwa, R., Matsuda,Y. et al.: "Mouse and human chromosomal assignments of mortalin, a novel member of the murine hsp70 family of proteins." FEBS Letters. 361. 269-272 (1995)
• [文献書誌] 松田洋一: "染色体のin situハイブリダイゼーション,「組織培養の技術 第3版」" 朝倉書店(印刷中),