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本報告書で扱う新規蛋白質は、動原体領域に由来するアルファサテライト含有genomic DNAに結合する性質を有し、その発現パターンは精巣特異的である。したがってこの蛋白質は減数分裂過程における染色体分配に関与している可能性がある。当該年度においては、この仮想的動原体蛋白質の全アミノ酸配列を明らかにするため、この蛋白質をコードする遺伝子の転写産物cDNAを完全長で単離することを試みた。
いわゆるlong distance PCRを援用してRACE法によるcDNAクローニングをおこない、3.2kbにおよぶcDNAを回収した。RNAブロットハイブリダイゼーションから推定されるmRNAサイズは3.4kbなので、ほぼ完全長のcDNAが単離されたと判断している。
部分的に解読した塩基配列からは、この蛋白質産物がグルタミン酸に富むことが予想された。しかしながら、cDNA中にはGC含量の高い繰り返し配列が存在したため、その領域をこえてジデオキシ法による塩基配列解析を進めることができなかった。cDNAの完全な塩基配列は現在解析中である。
また、今回新たに得られた5′側cDNAをプローブとしてRNAブロット分析をおこなったところ、従来から観察されていたmRNA以外に、より短いRNA分子種が検出された。同一遺伝子からのalternative transcriptか、あるいは類縁遺伝子由来の転写産物なのかは不明である。
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