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テトラメチルピリジルポリフィリン(TMPyP)は、カチオン性のメチルピリジル基を持つため水溶性を示し、また静電的引力によりDNA2重らせんのグルーブ(溝)に結合することができる。一方、疎水性を示すポリフィリン骨格は平面状であり、DNAの塩基間に挿入結合(インターカレーション)することもできる。このようにTMPyPはDNAに対して親和性を示すが、これまでRNA2重らせんやDNA-RNAハイブリッド核酸に対する結合性はまったく研究されてこなかった。ポリフィリン錯体は核酸を酸化的に切断する能力があるため、RNAに対する結合性を解明できれば有効な抗ウイルス剤や抗腫瘍剤を開発するのに極めて重要な知見を与えると考えられる。そこで本研究ではこれらRNA鎖を含む2重らせん核酸とTMPyPとの結合性を調べた。RNA2重らせんとしてポリ(rA)・ポリ(rU)・ポリ(rG)・ポリ(rC)・ポリ(rI)・ポリ(rC)の3種類を、DNA-RNAハイブリッドとしてポリ(rA)・ポリ(dT)・ポリ(rG)・ポリ(dC)・ポリ(rI)・ポリ(dC)の3種類を用いた。これら核酸とTMPyPとの結合にともなう可視吸収と紫外部円二色性スペクトルを測定し、その変化から結合反応を解析した。また、結合にともなって誘起されるTMPyPの可視部円二色性スペクトルを測定し、TMPyPの結合様式を判定した。その結果、TMPyPはRNA2重らせんのグループに結合し、かつTMPyP同志が核酸上で積み重なっている(スタッキング結合)こと、DNA-RNAハイブリッドに対してはインターカレーションすることがわかった。
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