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Dofタンパク質は、最近、植物のDNA結合タンパク質に見いだされた新しいファミリーであり、Znフィンガーを一つだけ形成するユニークなDNA結合ドメイン(Dofドメイン)を有する。このDofタンパク質のターゲットプロモーター上には、しばしば結合部位が複数見られることから、Dofタンパク質は相互作用を行うのではないかと考え検討した。トウモロコシのDof1は最初にクローン化されたDofタンパク質であるが、Dof1を用いて検討したところ、Dof1はタンパク質-タンパク質相互作用を介してDNA上で複合体を形成することが明らかとなった。Dof1の欠失変異タンパク質を用いた実験から、この相互作用はDofドメインを介していると判断された。一方で、トウモロコシのもう一つのDofタンパク質、Dof2は、転写促進活性を有さず、Dof1による転写促進をin vivoで阻害することを明らかにした。Dof2も、Dof1と相互作用するかどうか検討したところ、Dof2はDof1と相互作用し、DNA上で複合体を形成することが明らかとなった。また、Dof1、Dof2ともにトウモロコシのHMG1タンパク質とDofドメインを介して相互作用することを見いだした。また、in vovoでの転写促進効果から、光合成遺伝子であるC4PEPC遺伝子を含む幾つかの遺伝子をDof1のターゲット遺伝子として同定したが、これらの遺伝子プロモーター上にはいずれも複数のDof1結合部位が存在することを明らかにした。以上のことから、Dofタンパク質は、複数の結合部位が近傍に存在しているDNA上で複雑な複合体を形成して転写制御に関与している事が示唆された。
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