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2009 年度 実績報告書

RNAの選択的化学修飾を目指した官能基転移能を持つ人工核酸の開発

研究課題

研究課題/領域番号 08J05090
研究機関九州大学

研究代表者

鬼塚 和光  九州大学, 大学院・薬学研究院, 特別研究員(DC1)

キーワードRNA / 機能性核酸 / 部位特異的 / グアニン選択的 / ピレン / 遷移金属 / 活性化 / ラベル化
研究概要

本研究では、RNAの部位特異的修飾を目指し、官能基を転移する機能性核酸の開発を行った。これまでに、ジカルボニルユニットをもつ官能基を用いることで、中性条件下でシトシンに対して、また、アルカリ性条件下でグアニンに対して選択的な修飾に成功していた。このグアニン選択的な反応は、わずか10分で80%以上もの収率で進行し、この反応生成物の構造をNMR、MSなどにて詳細に調査したところ、グアニンの2位アミノ基と反応していることを解明した。さらに、2-アミノプリンやヒポキサンチンを用いた比較実験により、この反応性の著しい増加はグアニンのエノレート構造によるものであることが分かった。この知見を基に、本年度では、中性条件でグアニンを修飾することを目指し研究を行った。
この目標に対する試みとして、遷移金属カチオンの利用を考えた。Ni^<2+>やCo^<2+>などの遷移金属カチオンはグアニンのN7位に配位し、それに伴い、N1位のpKaを低下させることが知られている。実際に、Ni^<2+>やCo^<2+>存在下、pH7.4にて反応を行ったところ、アルカリ性での活性化と同様、グアニンに対する著しい反応性の向上を確認した。さらに、グアニン誘導体である8-オキソグアニン、デアザグアニンと比較することで、この反応の促進が金属のN7への配位に依存することを明確にした。
次に、RNAラベル化技術への展開を志向し、ピレン転移性官能基の合成・評価を行った。この官能基は、シトシンに対しては進行しなかったが、アルカリ性条件下、グアニンに対して著しい選択性・反応性をもって進行した。現在、さらなる展開としてこの官能基転移反応とクリックケミストリーを合わせた技術の開発に取り組んでおり、ポジティブな結果が得られている。

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2010 2009

すべて 雑誌論文 (4件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件)

  • [雑誌論文] A new usage of functionalized oligodeoxynucleotide probe for site-specific modification of a guanine base within RNA2010

    • 著者名/発表者名
      Kazumitsu Onizuka, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Res. 38

      ページ: 1760-1766

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Site-specific covalent modification of RNA guided by functionality-transfer oligodeoxynucleotides2009

    • 著者名/発表者名
      Kazumitsu Onizuka, et al.
    • 雑誌名

      Bioconjugate Chem. 20

      ページ: 799-803

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A new odorless procedure for the synthesis of 2-deoxy-6-thioguanosine and its incorporation into oligodeoxynucleotides2009

    • 著者名/発表者名
      Kazumitsu Onizuka, et al.
    • 雑誌名

      Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids 28

      ページ: 752-760

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Site-specific modification of RNA by functionality-transfer ODN probes2009

    • 著者名/発表者名
      Kazumitsu Onizuka, et al.
    • 雑誌名

      Nucleic Acids Symp.Ser. 53

      ページ: 67-68

  • [学会発表] Site-selective chemical modification of mRNA and its effects on Polymerization and translation2009

    • 著者名/発表者名
      Kazumitsu Onizuka, et al.
    • 学会等名
      Joint symposium of the 5^<th> annual meeting of the oligonucleotide therapeutics society and the 19^<th> antisense symposium
    • 発表場所
      福岡
    • 年月日
      20091103-20091106
  • [学会発表] Site-specific modification of RNA by functionality-transfer ODN probes2009

    • 著者名/発表者名
      Kazumitsu Onizuka, et al.
    • 学会等名
      The 6^<th> international symposium on nucleic acids chemistry
    • 発表場所
      高山(岐阜)
    • 年月日
      20090927-20091001
  • [学会発表] RNAの部位特異的修飾能をもつ官能基転移性ODNプローブの開発2009

    • 著者名/発表者名
      鬼塚和光, 等
    • 学会等名
      日本ケミカルバイオロジー学会、第4回年会
    • 発表場所
      神戸
    • 年月日
      20090518-20090519

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公開日: 2011-06-16   更新日: 2016-04-21  

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