1997 年度実績報告書

細菌ゲノムのアイデンティティーを規定する利己的な遺伝子

研究課題

研究課題/領域番号	09272207
研究機関	東京大学
研究代表者	小林一三東京大学, 医科学研究所, 助教授 (30126057)
キーワード	制限酵素 / メチル化酵素 / プラスミド / 相同組換え / 大腸菌 / バクテリオファージ / 減数分裂 / 性
研究概要	1) (染色体上の制限修飾系遺伝子の競争排除における利己的な宿主殺し。) 染色体上にあるPaeR7制限修飾系遺伝子が、相同な遺伝子による置き換えに対して、宿主殺しによって抵抗すること、これが宿主の相同組換え経路によって影響されることを示した。まれなトランスダクタントのうちには、制限修飾遺伝子を含む大きな領域が重複し、そのうち一つの制限修飾遺伝子だけがドナーとの相同組み換えによって置き換えられたと考えられるものがあった。 (宿主側の組換え修復) PaeR7制限修飾遺伝子を持つプラスミドを不和合プラスミドで排除したときに、宿主殺しが起きること、それが宿主のrec遺伝子型に依存することを示した。 EcoRI制限修飾遺伝子を複製が温度感受性であるプラスミドに連結し、EcoRI遺伝子喪失後の細胞の応答を追跡した。SOS応答の誘発が示された。大腸菌のRecBCD経路の相同組換え遺伝子群が、制限修飾系の宿主殺しに対抗することを示した。また、カイ配列を認識できないrecC^変異体でも、対抗が見られた。recBC変異株では、増殖の阻害が著しく、フィラメント中の核が消失していった。切断された染色体が蓄積し、それらはさらに分解した。 3)(カイ配列のクラスター) カイ配列の認識に欠損を持つRecBCD(recC^*1004)変異体でもカイ活性を示す大腸菌の染色体断片の中の一つは、カイ配列とその類似配列を多数もっているrep遺伝子内の断片であった。この断片は、高い組換え活性を示した。大腸菌のゲノムのデータベースから、同じようなカイ配列のクラスターを探索した。そのほとんどは、遺伝子のコーディング領域にあった。その多くは膜タンパクであった。

研究成果

(13件)

すべてその他

すべて文献書誌 (13件)

[文献書誌] Handa,N: "χ^*,χ-related11-mer partially active in an E.coli recχ^* strain." Genes to Cells. 2(8). 525-536 (1997)
[文献書誌] Kusano,K.: "A new type of illegitimate recombination is dependent on restriction and homologous interaction." J.Bacteriol.179(17). 5380-5390 (1997)
[文献書誌] Handa,N: "Clustering of c sequence in Escherichia coli genome." Microb.Comp.Genomics. 2(4). 287-298 (1997)
[文献書誌] Kobayashi,I.: "Homologous recombination for human gene therapy." Proceedings of the third worldwide internet conference"Molecular and Cellular Biology of Gene Therapy". CD-ROM publication. (1997)
[文献書誌] Takahashi-Kobayashi,K.: "Genetic Recombination through Double-strand Break Repair:Shift from Two-progeny Mode to One-progeny Mode bv Heterologous Inserts." Genetics. 146. 9-26 (1997)
[文献書誌] Naito,Y: "Selfish restriction modification genes:Resistance of a resident RM plasmid to displacement by an incompatible plasmid mediated by host killing." Biol.Chem.(in press).
[文献書誌] Fujitani,Y.: "Mismatch-stimulated destruction of intermediates as an explanation for map expantion in genetic recombination." J.Theor.Biol.(in press).
[文献書誌] 半田直史: "「利己的な遺伝子」にプログラムされる死." 遺伝. 52. 61-67 (1998)
[文献書誌] 半田直史: "死をプログラムする利己的遺伝子" 最新医学. 52. 67-74 (1997)
[文献書誌] 半田直史: "死をプログラムする細菌の遺伝子" Bioclinica. 12. 352-355 (1997)
[文献書誌] 半田直史: "相同組換えの機序と遺伝子治療への応用" 治療学. 31. 21-24 (1997)
[文献書誌] Kusano-Fujita,A.: "Gene Therapy Vector Protocols Handbook.In:Kmiec,E.B.,ed." Humana Press,Totowa,NJ,USA(in press),
[文献書誌] 内藤康宏: "遺伝子治療開発研究ハンドブック.相同組換え法による遺伝子導入" エヌ・ティー・エス(刊行中),

1997 年度 実績報告書

細菌ゲノムのアイデンティティーを規定する利己的な遺伝子

研究代表者

小林 一三 東京大学, 医科学研究所, 助教授 (30126057)

研究成果

[文献書誌] Handa,N: "χ^*,χ-related11-mer partially active in an E.coli recχ^* strain." Genes to Cells. 2(8). 525-536 (1997)

[文献書誌] Kusano,K.: "A new type of illegitimate recombination is dependent on restriction and homologous interaction." J.Bacteriol.179(17). 5380-5390 (1997)

[文献書誌] Handa,N: "Clustering of c sequence in Escherichia coli genome." Microb.Comp.Genomics. 2(4). 287-298 (1997)

[文献書誌] Kobayashi,I.: "Homologous recombination for human gene therapy." Proceedings of the third worldwide internet conference"Molecular and Cellular Biology of Gene Therapy". CD-ROM publication. (1997)

[文献書誌] Takahashi-Kobayashi,K.: "Genetic Recombination through Double-strand Break Repair:Shift from Two-progeny Mode to One-progeny Mode bv Heterologous Inserts." Genetics. 146. 9-26 (1997)

[文献書誌] Naito,Y: "Selfish restriction modification genes:Resistance of a resident RM plasmid to displacement by an incompatible plasmid mediated by host killing." Biol.Chem.(in press).

[文献書誌] Fujitani,Y.: "Mismatch-stimulated destruction of intermediates as an explanation for map expantion in genetic recombination." J.Theor.Biol.(in press).

[文献書誌] 半田直史: "「利己的な遺伝子」にプログラムされる死." 遺伝. 52. 61-67 (1998)

[文献書誌] 半田直史: "死をプログラムする利己的遺伝子" 最新医学. 52. 67-74 (1997)

[文献書誌] 半田直史: "死をプログラムする細菌の遺伝子" Bioclinica. 12. 352-355 (1997)

[文献書誌] 半田直史: "相同組換えの機序と遺伝子治療への応用" 治療学. 31. 21-24 (1997)

[文献書誌] Kusano-Fujita,A.: "Gene Therapy Vector Protocols Handbook.In:Kmiec,E.B.,ed." Humana Press,Totowa,NJ,USA(in press),

[文献書誌] 内藤康宏: "遺伝子治療開発研究ハンドブック.相同組換え法による遺伝子導入" エヌ・ティー・エス(刊行中),

1997 年度実績報告書

小林一三東京大学, 医科学研究所, 助教授 (30126057)

[文献書誌] Handa,N: "χ^,χ-related11-mer partially active in an E.coli recχ^ strain." Genes to Cells. 2(8). 525-536 (1997)