研究概要 |
dl遺伝子座は,イネの雌蕊と葉の中肋の形成を制御している.本研究はポジショナルクローニング法により,この遺伝子を単離することを目的としている. まず,この遺伝子座にもっとも近いマーカーを探索することを試みた.染色体地図とRFLP地図を比較し,dl遺伝子座に近いRFLPマーカーを選択した.dl座の変異体とインディカ(Kasarath)とのF_2よりゲノムDNAを単離し,7つのRFLPマーカーについてそれぞれサザンブロット解析を行い,dl座との組換え率頻度を検討した.その結果,dl座との組換え率は遠いもので8.8%であったが,3つのマーカーは,150個体を解析してdl遺伝子座との組換えを示さず,この遺伝子座にもっとも近いことが判明した.このうちの一つをプローブとして,BACライブラリーをスクリーニングし,5つのクローンを得た.このクローンをNotIで切断した後,パルスフィールド電気泳動で解析し,コンティグを作製した.このコンティグの両端のDNAをTAIL PCR法で増幅し,これをプローブとして,BACライブラリーをスクリーニングした.この遺伝子歩行により得れたBACクローンをもとに,コンティグを作製した.現在までに約400kbをカバーするBACコティングを作製している.今後,これらのコティングをもとにdl遺伝子座にもっとも近い領域を決定し,DL遺伝子を単離することを計画している.
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