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1998 年度 実績報告書

硫酸化グリコサミノグリカン糖鎖の普遍的シークエンシング法の開発

研究課題

研究課題/領域番号 09558082
研究機関神戸薬科大学

研究代表者

菅原 一幸  神戸薬科大学, 薬学部, 教授 (60154449)

研究分担者 吉田 圭一  生化学工業株式会社, 東京研究所, 主席研究員
木下 亜希子  神戸薬科大学, 薬学部, 助手 (30289037)
山田 修平  神戸薬科大学, 薬学部, 助手 (70240017)
北川 裕之  神戸薬科大学, 薬学部, 講師 (40221915)
キーワードヘパリン / ヘパリナーゼ / コンドロイチナーゼC / デルマタン硫酸 / 硫酸化オリゴ糖 / マンノサミン / C2-エピメリゼーション / NMR
研究概要

(1) ヘパリンをバクテリアのエリミナーゼで分解して得た不飽和二糖が、アルカリ性水溶液中で、非酵素的に のC2-エピメリゼーションによってマンノサミンに変化することを見い出した。
(2) ブタ小腸由来のヘパリンオリゴ糖標品中にデルマタン硫酸由来の硫酸化四糖と六糖を見い出し、-3GalNAc(4,6-disulfated)βl-4IdoAα1-という珍しい二糖単位を含む、新規の配列を見い出した。
(3) ブタ小腸由来のヘパリンをヘパリナーゼで消化して断片化して得た硫酸化八糖の構造をプロトンNMRで解析することによって決定した。その結果、硫酸化パターンとプロトンのケミカルシフト値の間に密接な関係があることを見い出した。
(4) バクテリア由来のコンドロイチナーゼCはコンドロイチン硫酸やデルマタン硫酸の構造解析の重要なツールとなることが期待される。バクテリア由来のコンドロイチナーゼCを、当研究室でプロテオグリカンも糖とタンパク質との結合領域から単離した様々な硫酸化Glycoserineに作用させることによって、結合領域に対する基質特異性を明らかにした。
(5) すでに当研究室で構造を決定した標識硫酸化オリゴ糖をモデル化合物として2-aminobenzamideで蛍光標識し、標識誘導体をまずバクテリア由来のコンドロイチンナーゼ、ヘパリチナーゼ、スルファターゼなどを用いて消化し、消化物のHPLC分析、ゲル電気泳動分析によりシークエンシングを実施し、酵素消化、HPLC、電気泳動の至適条件を決定することが出来た。

  • 研究成果

    (5件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (5件)

  • [文献書誌] 山田 修平: "Conversion of N-sulfated glucosamine to N-sulfated mannosamine in an unsaturated heparin deiaccharide by non-enzymatic,base-catalyzad C-2 epimerization during enzymatic" Carbohyd.Res.309(3). 261-268 (1998)

  • [文献書誌] 山田 修平: "Structural determination of sulfated tetra-and hexasaccharides containing a rare disaccharide sequence,-3GalNAc(4,6-disulfated)β1-4IdoAα1-,isolated from porcineintestinal dermatan sulfate" Eur.J.Biochem.258(2). 775-783 (1998)

  • [文献書誌] 山田 修平: "Structural studies of the octasaccharides derived from the low sulfated region of porcine intestinal heparin:construction of the 1H-NMR data based of heparin oligosaccharides and systematic investigation of the effects of saccharide sequences on proton resonances" Biochemistry. 38(2). 838-847 (1999)

  • [文献書誌] 木下 亜希子: "Microanalysis of glycosaminoglycan-derived oligosaccharides labeled with the fluorophore 2-aminobenzamide by high-performance liquid chromatography:Application to disaccharide composition analysis and exo-sequencing of oligosaccharides" Anal.Biochem.(印刷中). (1999)

  • [文献書誌] 津田 博美: "Substrate specificity studies of flavobacterium chondroitinase C and heparitinases towards the glycosaminoglycan-protein linkage region:Use of a sensitive analytical method developed by chromophore labeling of linkage glycoserines using dimethylaminoazobenzenesulfonyl chloride" Eur.J.Biochem.(印刷中). (1999)

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公開日: 1999-12-11   更新日: 2016-04-21  

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