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1999 年度 研究成果報告書概要

疾患モデルラットの原因遺伝子同定のためのゲノム解析システムの開発

研究課題

研究課題/領域番号 09558105
研究種目

基盤研究(B)

配分区分補助金
応募区分展開研究
研究分野 実験動物学
研究機関京都大学

研究代表者

芹川 忠夫  京都大学, 医学研究科, 教授 (30025655)

研究分担者 北田 一博  京都大学, 医学研究科, 助手 (70263093)
江島 洋介  広島県立保険福祉短期大学, 放射線技術学科, 教授 (50127057)
研究期間 (年度) 1997 – 1999
キーワードラット / 遺伝的連鎖地図 / 比較遺伝子地図 / 疾患モデル / ミュータント / ゲノム / てんかん / リンパ節形成不全
研究概要

ラットは、ヒトの健康と疾患の生物的・遺伝学的基盤を理解する上で多くの利便性がある。また、他の動物種にない特異な疾患モデルラットがある。我々はヒト疾患モデルラットにおける遺伝解析と原因遺伝子同定を容易にするため、この研究プロジェクトにおいて、ラット遺伝的地図とラット・マウス・ヒト比較遺伝子地図を改善した。作製した統合ラット地図は、5682の重複マーカーからなり、2028cMの遺伝的長さをもつ。最近、ラットのRHマップに基づくラット・マウス・ヒトの全ゲノム比較地図が報告された。我々はマウスの遺伝的連鎖地図を基にした比較地図の第4版を作成して、マウスゲノム上の1195cM(75%)においてラットとマウス間の相同ゲノム領域が明らかになっているとことを明らかにした。加えて、ミュータントマウスとラットにおける原因遺伝子をポジショナルクローニングによって以下のように同定した。1)マウスのalymphoplasia突然変異は、全身のリンパ節とバイエル板を欠損、脾臓と胸腺の構築異常、免疫不全を特徴とする。我々は、Nf-kb-in-ducing kinase(NIK)遺伝子においてアミノ酸置換を起こす点突然変異があることを見つけ、野生型NIK遺伝子を導入すると、すべての病態が回復されることを確認した。2)トレモアラットは、欠神様発作と中枢神経系の海綿状空胞形成などが主な特徴である。原因遺伝子の存在推定領域にゲノム欠失があり、その欠失ゲノムにaspartoacylase遺伝子が存在することを見つけた。結果的に、spartoacylaseが欠損し、脳内にはN-acetyl-L-aspartate(NAA)の異常な蓄積を認めた。さらに、NAAを正常なラットの脳室内に注入するとトレモアラットと類似の欠神様発作が生じることを示した。

  • 研究成果

    (65件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (65件)

  • [文献書誌] Yokoi,N.: "Pdx1, a homeodomain transcription factor required for pancreas development, maps to rat chromosome 12"Exp Anim.. 46(4). 323-324 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Nabika,T.: "Comparative mapping of novel simple sequence repeat markers in ahypertension-related region on tar chromosome 1"Mamm Genome. 8(3). 215-217 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Serikawa,T.: "Rat Chromosome 3"Rat Genome. 3(1). 46-54 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Kondo,Y.: "Application of mouse microsatellite markers to rat genomemapping"Transplant Proc.. 27. 1766-1767 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yokoi,N.: "A non-MHC locus essential for autoimmune type 1 diabetes in theKomeda diabetes-prone rat"J Clin Invest. 199(8). 2015-2021 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ejima,Y.: "Phenotypic correction of ataxia-telangiectasia cellular defect by exogenously introduced human or mouse subchromosomal fragments"Somat Cell Mol Genet. 23. 341-351 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 江島洋介: "放射線感受性とゲノム安定性に関係するヒト疾患遺伝子(ATM,BLM,WRN)."実験医学. 16. 51-56 (1997)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 江島洋介: "末梢血管拡張性アタキシアの原因遺伝子と老化"実験医学. 15. 226-230 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Serikawa,T.: "A comparative genetic map of rat, mouse and human genomes"Exp Anim.. 47(1). 1-9 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Andoh,Y.: "Correlation between genetic and cytogenetic maps of the rat"Mamm Genome. 9(4). 287-293 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Cui,Z.: "Extension of conserved regions in the rat and mouse genomes by chromosomal assignments orat genes"Exp Anim.. 47(2). 83-88 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yokoi,N.: "A rat-mouse-human comparative gene map"Rat Genome. 4(2). 84-97 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yamada,S.: "Linkage mapping of the Bra, Brb and Brg genes for rat protein phoshatase 2A 55 kDa B-regulatory subunit isotypes"Jpn J Cancer Res. 89. 1014-1019 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Murayama,S.: "A genetic locus susceptible to the overt proteinuria in BUF/Mna rat"Mamm Genome. 9. 886-888 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ejima,Y.: "Mutations of the ATM gene detected in Japanese ataxia-telangiectasia patients: possible preponderance of the two founder mutations 4621del165 and 7883del5"Hum Genet. 102. 403-408 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Okuda,T.: "The effects of static magnetic fields and X-rays on instability of microsatellite repetitive sequences"J Radiat Res. 39. 279-284 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 江島洋介: "チェックポイント制御と癌化におけるATM遺伝子の役割.細胞周期の新しい展開-チェックポイント制御と癌"野島博編.羊土社. 126-139 (1998)

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  • [文献書誌] 江島洋介: "ATM(毛細血管拡張性失調症病因遺伝子)"現代医療. 30. 1882-1887 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] 江島洋介: "ヒトにおけるチェックポイント制御と癌"実験医学. 16. 1184-1188 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Nakane,Y.: "Evaluation of up-date rat-mouse-human comparative map"Rat Genome. 5. 48-60 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yokoi,N.: "Screening of mouse SSLP markers applicable to rat genetic studies"Rat Genome. 5. 61-67 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Sato,H.: "Assignment of the Madcam1 gene to rat chromosome 7q11.2-q12 by fluorescence in situ hybridization, somatic cell hybrids and linkage analysis"Cytogenet Cell Cenet. 86. 223-224 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Shinkura,R.: "Alymphoplasia is caused by a point mutation in the mouse gene encoding Nf-kB-inducing kinase"Nature Genet. 22. 74-77 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Serikawa,T.: "Rat genetic map and a rat/mouse/human comparative gene map"Transplant Proc.. 31. 1537-1540 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Oyabu,A.: "Genetic mapping of the thymoma susceptible locus, Tsr1, in BUF.Mna rats"J Natl Cancer Inst. 91(3). 279-282 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Tachibana,A.: "The FANCA gene in Japanese Fanconi anemia: Reports of eight novel mutations and analysis of sequence variability"Hum Mutat. 13. 237-244 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yaguchi,H.: "Effects of high-density extremely low frequency magnetic field on sister chromatid exchanges in mouse m5S cells"Mutat Res. 440. 189-194 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ohnishi,T.: "Low-dose-rate gamma-radiation attenuates tumor suppressor p53 response"Radiation Res. 151. 368-372 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yokoi,N.: "Genetic mapping of the rat mutation creeping and evaluation of its positional candidate gene reelin"Mamm Genome. 11. 111-114 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Mashimo,T.: "Mapping of four simple sequence repeat(SSR) markers on rat chromosome 4"Hypertens Res. 23(1). 144-147 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Akimitsu,T.: "Epileptic seizures induced by N-acetyl-L-aspartate(NAA) in rats: in vivo and in vitro studies"Brain Res. (in press).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Kitada,K.: "Accumulation of N-Acetyl-L-aspartate in the brain of the tremor rat, a mutant exhibiting absence-like seizure and spongiform degeneration in the central nervous system"J Neurochem. 74. 2512-2519 (2000)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Kitada,K.: "An integrated rat genome map based on genetic and cytogenetic data"Exp Anim.. 49. 119-126 (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ejima,Y.: "Aberrant splicing of the ATM gene associated with the shortening of intronic mononucleotide tract in human colon tumor cell lines: A novel mutation target of microsatellite instability"Int J Cancer. (in press).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Ejima,Y.: "Determination of the genotype of a panel of human tumor cell lines for the human homologues of yeast cell cycle checkpoint control genes: identification of cell carrying homoallelic missense base substitutions"Somat Cell Mol Genet. (in press).

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Yokoi, N.: "Pdx1, a homeodomain transcription factor required for pancreas development, maps to rat chromosome 12."Exp Anim. 46(4). 323-324 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Nabika, T.: "Comparative mapping of novel simple sequence repeat markers in a hypertension-related region on rat chromosome 1."Mamm Genome. 8(3). 215-217 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Serikawa, T.: "Rat Chromosome 3"Rat Genome. 3(1). 46-54 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Kondo, Y.: "Application of mouse microsatellite markers to rat genome mapping."Transplant Proc. 27. 1766-1767 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yokoi, N.: "A non-MHC locus essential for autoimmune type 1 diabetes in the Komeda diabetes-prone rat."J Clin Invest. 100(8). 2015-2021 (1997)

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  • [文献書誌] Ejima, Y.: "Phenotypic correction of ataxia-telangiectasia cellular defect by exogenously introduced human or mouse subchromosomal fragments."Somat Cell Mol Genet. 23. 341-351 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Serikawa, T.: "A comparative genetic map of rat, mouse and human genomes."Exp Anim. 47(1). 1-9 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Andoh, Y.: "Correlation between genetic and cytogenetic maps of the rat."Mamm Genome. 9(4). 287-293 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Cui, Z.: "Extension of conserved regions in the rat and mouse genomes by chromosomal assignments of 29 rat genes."Exp Anim. 47(2). 83-88 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yokoi, N.: "A rat-mouse-human comparative gene map."Rat Genome. 4(2). 84-97 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yamada, S.: "Linkage mapping of the Bra, Brb and Brg genes for rat protein phosphatase 2A 55 kDa B-regulatory subunit isotypes."Jpn J Cancer Res. 89. 1014-1019 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Murayama, S.: "A genetic locus susceptible to the overt proteinuria in BUF Mna rat."Mamm Genome. 9. 886-888 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Ejima, Y.: "Mutations of the ATM gene detected in Japanese ataxia-telangiectasia patients : possible preponderance of the two founder mutations 4612del165 and 7883del5."Hum Genet. 102. 403-408 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Okuda, T.: "The effects of static magnetic fields and X-rays on instability of microsatellite repetitive sequences."J Radiat Res. 39. 279-284 (1998)

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  • [文献書誌] Nakane, Y.: "Evaluation of up-dated rat-mouse-human comparative map."Rat Genome. 5. 48-60 (1999)

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  • [文献書誌] Yokoi, N.: "Screening of mouse SSLP markers applicable to rat genetic studies."Rat Genome. 5. 61-67 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Sato, H.: "Assignment of the Madcam1 gene to rat chromosome 7q11.2-q12 by fluorescence in situ hybridization, somatic cell hybrids and linkage analysis."Cytogenet Cell Genet. 86. 223-224 (1999)

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  • [文献書誌] Shinkura, R.: "Alymphoplasia is caused by a point mutation in the mouse gene encoding Nf-kB-inducing kinase."Nature Genet. 22. 74-77 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Serikawa, T.: "Rat genetic map and a rat/mouse/human comparative gene map."Transplant Proc. 31. 1537-1540 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Oyabu, A.: "Genetic mapping of the thymoma susceptible locus, Tsr1, in BUF/Mna rats."J Natl Cancer Inst. 91(3). 279-282 (1999)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Tachibana, A.: "The FANCA gene in Japanese Fanconi anemia : Report s of eight novel mutations and analysis of sequence variability."Hum Mutat. 13. 237-244 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yaguchi, H.: "Effects of high-density extremely low frequency magnetic field on sister chromatid exchanges in mouse m5S cells."Mutat Res. 440. 189-194 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Ohnishi, T.: "Low-dose-rate gamma-radiation attenuates tumor suppressor p53 response."Radiation Res. 151. 368-372 (1999)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Yokoi, N.: "Genetic mapping of the rat mutation creeping and evaluation of its positional candidate gene reelin."Mamm Genome. 11. 111-114 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Mashimo T.: "Mapping of four simple sequence repeat (SSR) markers on rat chromosome 4."Hypertens Res. 23(1). 144-147 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Akimitsu, T.: "Epileptic seizures induced by N-acetyl-L-aspartate (NAA) in rats : in vivo and in vitro studies."Brain Res. (in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Kitada, K.: "Accumulation of N-acetyl-L-aspartate in the brain of the tremor rat, a mutant exhibiting absence-like seizure and spongiform degeneration in the central nervous system."J Neurochem. 74. 2512-2519 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Kitada, K.: "An integrated rat genome map based on genetic and cytogenetic data."Exp Anim. 49. 119-126 (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Ejima, Y.: "Aberrant splicing of the ATM gene associated with the shortening of intronic mononucleotide tract in human colon tumor cell lines : A novelmutation target of microsatellite instability."Int J Cancer. (in press).

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Ejima, Y.: "Determination of the genotype of a panel of human tumor cell lines for the human homologues of yeast cell cycle checkpoint control genes : identification of cell lines carrying homoallelic missense base substitutions."Somat Cell Mol Genet. (in press).

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公開日: 2001-10-23  

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