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1998 年度 研究成果報告書概要

固体高分解能NMRによるリン脂質膜中イオンチャネルペプチドの立体構造解析

研究課題

研究課題/領域番号 09640612
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 物理化学
研究機関姫路工業大学

研究代表者

内藤 晶  姫路工業大学, 理学部, 助教授 (80172245)

研究分担者 辻 暁  姫路工業大学, 理学部, 助手 (60227387)
研究期間 (年度) 1997 – 1998
キーワードイオンチャネル / エンケファリン / メリチン / 原子間距離 / 固体高分解能NMR / 三次元構造 / リン脂質二重膜 / 磁場配向膜
研究概要

本研究では固体高分解能NMRの手法を用いて膜結合イオンチャネルペプチドの三次元構造および配向の決定を行う新しい方法論の確立を目的として研究を遂行し、以下の結果を得た。
(1)オピオイドペプチドであるLeu-エンケファリン結晶の三次元区像を精密原子間距離情報を基に決定することを試みた。6種類の精密原子間距離を精密に測定し、この距離情報をペプチド各残基のねじり角に変換した。この時、化学シフトなど方価から得られた二次構造情報を制限条件に加えることにより、ねじれ角の範囲を限定することが可能となり、最終的にユニークな分子の三次元構造を構築することが可能となった。
(2)3アミノ酸残基からなるぺプチドN-Pro-Gly-Phe試料においてCーN原子間距離を精密に求め、分子内原子間距離および分子間距離を3-スピン系の取り扱いを行うことで、それぞれを独立に決定すると共に分子内と分子間ベクトルのなす角度を求めることに成功した。
(3)ハチ毒の主成分であるメリチンとリン脂質であるDMPCの混合膜を調製し、磁場中で膜分断と融合を起こした結果、この二重膜は膜面を磁場に平行に向けて自発的に磁場配向をすることが判明した。この磁場配向膜中のメリチンの^<13>C化学シフト値を解析した結果、メリチンはαーヘリックスを形成しており、このヘリックスは膜貫通状態であることが判明した。さらにこのヘリクッスは膜面に垂直な対称軸のまわりで回転している動的な状態である事が明らかになった。
(4)以上2年間の研究によって膜結合分子の三次元構造や膜に対する配向を決定するシルテムが完成した。今後の展開は分子量の大きなイオンチャネルペプチドやイオンチャネル蛋白質における膜結合構造の決定に、これらの方法をいかに適用していくかを明らかにすることである。

  • 研究成果

    (32件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (32件)

  • [文献書誌] A. Gil: "A^<13>CNMR Study on the Conformation and Dynamical Properties of a Cereal Strorage Protein, C-Hordein, and Its Model Peptides"Biopolymers. 41. 589-300 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S. Nakatsuji: "Preparation and prorerties of 2-(o-halophenyl)-a-nitonyl nitroxides"Mol. Cryst. Liq. Cryst.. 306. 279-284 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S. Yamaguchi: "Stability of C-Terminal-Helical Domain of Bacteriorhodopsin Protruding from the Membrane Surface as Studied by High-resolution Solid-state ^<13>CNMR"J. Biochem. (Tokyo). 123. 78-86 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H. Saito: "Conformation and Dynamics of Membrane Proteins and Biologically Active Peptides as Studied by High-resolution Solid-state ^<13>CNMR"J. Mol. Structure. 441. 137-148 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A. Naito: "Backbone Dynamics of Polycrystalline Peptides Studied by Measurements of ^<15>NNMR Lineshpes and ^<13>C Transverse Relaxation Times"J. Mol. Structure. 441. 231-242 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A. K. Dioumaev: "Existence of a Proton Transfer Chain in Bacteriorhodopsin : Participation of Glu-194 in the Release of Protons to the Extracellular Surface"Biochemistry. 37. 2496-2506 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M. Kamihira: "A High-resolution Solid-state ^<13>C and ^<15>NMNR Study on Crystalline Leu-and Met-enkephalins : Distinction lf Polymorohs, Backbone Dynamics and Local Conformational Rearrangements Induced by Dehydration or Freezing Motions of Bound Solvent Molecules"J. Phys. Chem. B. 102. 2826-2834 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H. Saito: "Empirical versus Nonempirical Evaluation of Secondary Structure of Fibrous and Membrane Proteins by Solid-state NMR : A Practical Approach"Annu. Rep. NMR Spectrosc.. 36. 79-121 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A. Naito: "Dipolar Interaction and Interatomic Distances"Physical and Theoretical Chemistry. 84. 22-49 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] H. Saito: "Polysaccharides and Biological Systems"Physical and Theoretical Chemistry. 84. 891-921 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] T. Iwasa: "^<19>F-NMR and UV-Vis Absorption Spectroscopic Studies of Fluorinated Octopus Rhodopsin and Its Photoproducts"J. Phys. Chem. A.. 102. 5602-5610 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S. Nakatsuji: "2-(2'-Halophenyl)-a-nitronyl nitroxides"New J. Chem.. 102. 275-280 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] K. Nishimura: "Determination of the Three-Dimensional Structre of Crystalline Leu-Enkephalin Dihydrate Based on Accurately Determined Six Sets of Interatomic Distances from ^<13>C-REDOR NMR and the Conformation-Dependent ^<13>C Chemical Shifts"J. Phys. Chem. B.. 102. 7476-7483 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] M. Tanio: "Evidence of Local Conformational Fluctuations and Changes in Bacteriorhodopsin, Dependent on Lipids, Detergents and Tremeric Structure, as Studied by^<13>CNMR"Biochim. Biophys. Acta. 1375. 84-92 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] S. Tuzi: "Location of a cation-binding site in the loop between helices F and G of bacteriorhodopsin as studied by ^<13>CNMR"Biophys.J.. 76. 1523-1531 (1999)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A. Naito: "Conformation and bynamics of melittin bound to magnetically oriented lipid vilayers by solid-state ^<31>P and ^<13>CNMR spectroscopy"Biophys. J.. (in press). (2000)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] A. Gil: "A ィイD113ィエD1C NMR Study on the Conformation and Dynamical Properties of a Cereal Storage Protein, C-Hordein, and Its Model Peptides"Biopolymers. 41. 289-300 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S. Nakatsuji: "Preparation and properties of 2-(o-halophenyl)-a-nitonyl nitroxides"Mol. Cryst. Liq. Cryst.. 306. 279-284 (1997)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S. Yamaguchi: "Stability of C-Terminal -Helical Domain of Bacteriorhodopsin Protruding from the Membrane Surface as Studied by High-resolution Solid-state ィイD113ィエD1C NMR"J. Biochem. (Tokyo). 123. 78-86 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H. Saito: "Conformation and Dynamics of Membrane Proteins and Biologically Active Peptides as Studied by High -resolution Solid-state ィイD113ィエD1C NMR"J. Mol. Structure. 441. 137-148 (1998)

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  • [文献書誌] A. Naito: "Backbone Dynamics of Polycrystalline Peptides Studied by Measurements of ィイD115ィエD1N NMR Lineshpes and ィイD113ィエD1C Transverse Relaxation Times"J. Mol. Structure. 441. 231-242 (1998)

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  • [文献書誌] A. K. Dioumaev: "Existence of a Proton Transfer Chain in Bacteriorhodopsin : Participation of Glu-194 in the Release of Protons to the Extracellular Surface"Biochemistry. 37. 2496-2506 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M. Kamihira: "A High-resolution Solid-state ィイD113ィエD1C and ィイD115ィエD1N NMR Study on Crystalline Leu- and Met-enkephalins : Distinction of Polymorphs, Backbone Dynamics and Local Conformational Rearrangements Induced by Dehydration or Freezing Motions of Bound Solvent Molecules"J. Phys. Chem. B.. 102. 2826-2834 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H. Saito: "Empirical versus Nonempirical Evaluation of Secondary Structure of Fibrous and Membrane Proteins by Solid-state NMR : A Practical Approach"Annu. Rep. NMR Spectrosc.. 36. 79-121 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] A. Naito: "Dipolar Interaction and Interatomic Distances"Physical and Theoretical Chemistry. 84. 22-49 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] H. Saito: "Polysaccharides and Biological Systems"Physical and Theoretical Chemistry. 84. 891-921 (1998)

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  • [文献書誌] T. Iwasa: "ィイD119ィエD1F-NMR and UV-Vis Absorption Spectroscopic Studies of Fluorinated Octopus Rhodopsin and Its Photoproducts"J. Phys. Chem. A.. 102. 5602-5610 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] S. Nakatsuji: "2-(2'-Halophenyl)-a-nitronyl nitroxides"New J. Chem.. 275-280 (1998)

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  • [文献書誌] K. Nishimura: "Determination of the Three-Dimensional Structure of Crystalline Leu-Enkephalin Dihydrate Based on Accurately Determined Six Sets of Interatomic Distances from ィイD113ィエD1C-REDOR NMR and the Conformation -Dependent ィイD113ィエD1C Chemical Shifts"J. Phys. Chem. B. 102. 7476-7483 (1998)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] M. Tanio: "Evidence of Local Conformational Fluctuations and Changes in Bacteriorhodopsin, Dependent on Lipids, Detergents and Trimeric Structure, as Studied by ィイD113ィエD1C NMR"Biochem. Biophys. Acta. 1375. 84-92 (1998)

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  • [文献書誌] S. Tuzi: "Location of a cation-binding site in the loop between helices F and G of bacteriorhodopsin as studied by ィイD113ィエD1C NMR"Biophys. J.. 76. 1523-1531 (1999)

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  • [文献書誌] A. Naito: "Conformation and dynamics of melittin bound to magnetically oriented lipid bilayers by solid-state ィイD131ィエD1P and ィイD113ィエD1C NMR spectroscopy"Biophys. J.. (in press). (2000)

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      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 2001-10-23  

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