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1998 年度 研究成果報告書概要

C.elegansゲノムプロジェクトが産出する全ガレクチン遺伝子の機能的解析

研究課題

研究課題/領域番号 09680630
研究種目

基盤研究(C)

配分区分補助金
応募区分一般
研究分野 機能生物化学
研究機関帝京大学

研究代表者

平林 淳  帝京大学, 薬学部, 講師 (40156691)

研究期間 (年度) 1997 – 1998
キーワードC.elegans / ガレクチン / 生物進化 / 分子進化 / レクチン / ガラクトース / ゲノムプロジェクト
研究概要

本研究では、既知ガレクチン(32kDa、16kDa)と類似した11種のガレクチン候補遺伝子をゲノムライブラリーから抽出し、系統的な機能解析を通しガレクチン家系の分子進化やガラクトース認識が線虫で果たす役割について考察した。手順として、1)RT-PCRによる発現量の見積もりとESTデータベースの解析、2)cDNAクローニングによるエキソン・イントロン境界領域、および読み枠アミノ酸配列の決定、3)大腸菌発現系の構築と組み換えタンパク質LEC-1-10の調製、4)LEC-1-11の生化学的諸性質の検証、5)糖結合活性の解析、6)内在生レセプターの検索を行った。その結果、先に単離した32kDaガレクチン(LEC-1)と同様、直列反復型の分子構築様式をしたガレクチンが5つ(LEC-1-5)、プロト型で先のl6kDaガレクチン(LEC-6)とは若干様相の異なるガレクチンが5つ(LEC-7-11)存在することが判明した。ただし、lec-7に関しては目下のところ成熟タンパク質の発現は確認できていない(第1イントロンのスプライシングの際、終止コドンが出現)。これら2つのグループは相互の類似性が高い(>40%)ことから近縁のサブファミリーを形成する。中でもLEC-1-3間のアミノ酸配列の一致は70%にも及ぶ。しかし、LEC-3はEST解析によると胚のみで発現しており、そのためmixed stageの虫から調製したRNAを用いたRT-PCRでは発現量がきわめて低い。さらに、LEC-3は糖結合に関わるとされる2本のβストランド(S4/S5)間に12アミノ酸からなる余剰ループの挿入があるなど、他のガレクチンにはない特徴をもつ。LEC-4,5は類似性は低い(約40%)が、ともに第1ドメインS2/Flストランド間に接着モチーフとして知られる「Arg-Gly-Asp」配列をもつ。LEC-8,10,11はさらにユニークで、C-末端に40-80アミノ酸からなる余分なテールをもち、しかも金属キレートカラムに強く結合する。このように線虫ガレクチン家系が単に増幅の一途をたどるのではなく、様々な性質をもったタンパク質に機能分化している様子が観察された。

  • 研究成果

    (15件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (15件)

  • [文献書誌] Oka, T et al.: "Idontification and cloning of rat galutin-2 : Expression is prcdominuntly in epithelial cells of the stomech." Arch. Biochem. Biophys.361. 195-201 (1998)

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      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hirabayashi, J.et al: "Novel galactose-binding proteins in Annelida : Characterization of 29-KDa tandum-repent-type lectins from the earthworm Lumbricns tenestris." J.Biol. Chem.273. 14450-14460 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Arata, Y.et al.: "The structure of the 32-kDa gulectin gene of the nematodl Caehorhabd elegans." J.Biol. Chem.272. 26s69-26677 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hirabayashi, J.: "Galeitins from the nematode Caenorhabditis elegans and the genome project." Trends Glycosci. Glycotcchnol.9. 113-122 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Arata, Y.et al.: "The two lection domains of the tardem-repeat 32-kDa golectin of the nematode caenorhabditis elegans have drtterent binding properties." J.Biochem. (Tokyo). 121. 1002-1009 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Akimoto, Y.et al: "Histochemistry and Cytochemistry of endogenous lectins" Gnstav Fischcr, Jeha, 92 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Hirabayashi, J.& Kasai K.: "Evolution of animal lutins" Springer, Berlin, 44 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(和文)」より
  • [文献書誌] Oka, T., Murakami, S., Arata, Y., Hirabayashi, J., Kasai, K., Wada, Y., Futai, M.: ""Identification and cloning of rat galectin-2 : Expression is predominantly in epithelial cells of the stomach"" Arch.Biochem.Biophys.361. 195-201 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Hirabayashi, J., Dutta, S.K., and Kasai, K.: ""Novel galactose-binding proteins in Annelida : characterization of 29-kDa tandem-repeat-type lectins from the earthworm Lumbricus terrestris"" J.Biol.Chem.273. 14450-14460 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Hirabayashi, J., and Kasai, K.: ""Identification of Glycoprotein Receptors for 16-kDa Galectin from the Nematodes Caenorhabditis elegans and Ascris suum"" XIXth International Carbohydrate Symposium (San Diego, USA ; 8/9-14,1998) Abstract CO021 (Oral presentation).

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Akimoto, Y., Imai, Y., Hirabayashi, J., Kasai, K., and Hirano, H.: ""Histochemistry and cytochemistry of endogenous animal lectins" (Review)" in Progress in Histochemistry and Cytochemistry (Gustav Fischer, Jena). Vol.33 (1). (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Hirabayashi, J., and K.Kasai: ""Evolution of animal lectins" (Review)" in Progress in Molecular and Subcellular Biology Springer, Berlin, Vol.19 : Molecular Evolution : Evidence for Monophyly of Metazoa (Muller, W.E.G.ed.) (Springer, Berin). 45-88 (1998)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Arata, Y., Hirabayashi, J., and Kasai, K.: ""The structure of the 32-kDa galectin gene of the nematode Caenorhabditis elegans"" J.Biol.Chem.272. 26669-26677 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Hirabayashi, J., Arata, Y., and Kasai, K.: ""Galectins from the nematode Caenorhabditis elegans and the genome project"" Trends Glycosci.Glycotechnol.9. 113-122 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より
  • [文献書誌] Arata, Y., Hirabayashi, J., and Kasai, K.: ""The two lectin domains of the tandem-repeat 32-kDa galectin of the nematode Caenorhabditis elegans have different binding properties.studies with recombinant protein"" J.Biochem. (Tokyo). 121. 1002-1009 (1997)

    • 説明
      「研究成果報告書概要(欧文)」より

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公開日: 1999-12-08  

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