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1998 年度 実績報告書

単一分子鎖の折り畳みによるナノ秩序構造の自己創出

研究課題

研究課題/領域番号 10044073
研究種目

国際学術研究

応募区分共同研究
研究機関京都大学

研究代表者

吉川 研一  京都大学, 大学院・理学研究科, 教授 (80110823)

研究分担者 LINDEMAN B.O  ルンド大学, 物理化学科, 教授
KABANOV V.A.  モスクワ大学, 化学学部, 教授
VASILEVSKAYA バレンチナ  ロシア科学アカデミー, ネスメヤノフ有機素子化合物研究所, 上級研究員
KHOKHLOV A.R  ロシア科学アカデミー, ネスメヤノフ有機素子化合物研究所, 教授
熊沢 紀之  茨城大学, 工学部, 助教授 (70137256)
キーワード長鎖DNA / コイル-グロビュール転移 / 単分子観察 / 蛍光顕微鏡 / 単分子凝縮 / ミセル / 界面活性剤 / 折り畳み転移
研究概要

今年度は「単一高分子鎖の折り畳みによるナノ秩序構造の自己創出」の課題で国際共同研究を行い進展があったので、そのうちの主要な業績を報告する。
本研究グループは、長鎖DNA分子のコイル-グロビュール転移の特性やグロビュール微細構造の安定性について実験と理論の両面から明らかにし、その高次構造制御の方法論の確立を目的として研究を行った。そして今回、陽イオン界面活性剤であるCTABと複合体を形成した長鎖DNA分子を蛍光顕微鏡法を用いて単一鎖観察し、DNA-CTAB複合体は、アルコール濃度の増加に伴い、グロビュール(凝縮状態)からコイル(伸長状態)を経て再びグロビュールとなる、リエントラントな転移を示すことを発見した。中程度のアルコール濃度でDNAがコイル状態として存在することから、この環境はDNAにとって良溶媒であると示唆される。一方、アルコール濃度が低いとき、および高いときの双方において、グロビュール状DNAが現れることから、この環境は複合体に対して貧溶媒であると考えられる。しかしながら、高アルコール濃度において生成されたグロビュール状態のDNAは予想に反して可溶性であった。すなわち、DNA-CTAB複合体にとって後者の環境というのは、可溶性から考えると良溶媒であり、高分子高次構造の点から見ると貧溶媒であると言える。この複合体の持つそのような独特な性質は、界面活性剤がグロビュール状DNA全体を被覆し、かつ凝縮状態のDNAの表面エネルギーを低くするという、ミセル形成の効果に起因すると考えられる。CTAB非存在下のアルコールによる高次構造変化と、異なるアルコール濃度における複合体のCDおよびUV分光法による観察に関する実験からも、この結論を支持する結果が得られている。

  • 研究成果

    (6件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (6件)

  • [文献書誌] H.Noguchi: "Morphological Variation in a Collapsed Single Homopolymer" J.Chem.Phys.109. 5070-5077 (1998)

  • [文献書誌] M.Ueda: "Electrophoresis of Long DNA Molecules in Linear Polyacrylamide Solutions" Biophys.Chem.71. 113-123 (1998)

  • [文献書誌] Y.Ichiba: "Single Chain Observation on Collapse Transition in Giant DNA Induced by Negatively-Charged Polymer" Biochem.Biophys.Res.Commun.242. 441-445 (1998)

  • [文献書誌] S.G.Starodoubtsev: "Conformational Transition of Large Duplex T4 DNA Embedded in Polly(acrylamide)Gel" Langmuir. 14. 214-217 (1998)

  • [文献書誌] D.Umeno: "Temperature-directed Compaction of Single DNA Molecule Grafted with Poly(N-isopropylacrylamide)" Nucleic Acids Symposium Serise. 39. 175-176 (1998)

  • [文献書誌] S.Kidaki: "Folding and unfolding of a giant duplex-DNA ina mixed solution with polycations,polyanions and crowding neutral polymers" Biophys.Chem.109. 133-143 (1998)

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公開日: 1999-12-13   更新日: 2016-04-21  

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