1999 年度実績報告書

DNA精密分子認識機構の解明についての共同研究

研究課題

研究課題/領域番号	10044134
研究種目	基盤研究(B)
研究機関	東京医科歯科大学
研究代表者	杉山弘東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 教授 (50183843)
研究分担者	伊藤茂東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 助手 (70143609) 杉本昭子東京医科歯科大学, 生体材料工学研究所, 助手 (60143608)
キーワード	抗がん剤 / 抗生物質 / 塩基配列特異性 / DNAアルキル化 / グルーブバインダー / 分子認識
研究概要	ディスタマイシン存在下のデュオカルマンの協同的アルキル化の機構を明らかにするため、イリノイ大学において磁気共鳴スペクトルを用いて複合体の構造を解析した。また、東京医科歯科大学において、ケイ光スペクトル、熱量測定などの分光学的手法を駆使して速度論を中心に解析を行なった。さらにデュオカルマイシンによるアルキル化の塩基配列選択性の制御をする目的で様々なグルーブバインダー存在下の反応を解析した。デュオカルマイシンによる協同的アルキル化はパートナーである分子のDNA副溝内での水素結合によって支配されているので、東京医科歯科大学において種々の水素結合を改変したアルキル化分子を化学合成して、アルキル化の配列選択性を解析し、その分子認識について体系化を試みた。

[文献書誌] Zhang, Q-M.; Sugiyama, H.; Miyabe, I.; Matuda, S.; Kino, K.; Saito, I.; Yonei, S.: "Replication in vitro and Cleavage by Restriction Endonuclease of 5-Formyluracil-and 5-Hydroxymethyluracil-Containing Oligonucleotides."Int. J. Radiat. Biol.. 75. 59-65 (1999)
[文献書誌] Tao, Z.-F.; Fujiwara, T.; Saito, I.; Sugiyama, H.: "Rational Design of Sequence-Specific DNA Alkylating Agents Based on Duocarmycin A and Pyrrole-Imidazole Hairpin Polyamides."J. Am. Chem. Soc.. 121. 4961-4967 (1999)
[文献書誌] Kawai, K.; Saito, I.; Kawashima, E.; Ishido, Y.; Sugiyama, H.: "Intrastrand 2'β Hydrogen Abstraction of 5'-Adjacent Deoxyguanosine by Deoxyuridin-5-yl in Z-form DNA."Tetrahedron Letters. 40. 2589-2592 (1999)
[文献書誌] Kawai, K.; Saito, I.; Sugiyama, H.: "Photochemical Halogen-Exchange Reaction of 5-lodouracil-Containing Oligonucleotides."Tetrahedron Letters. 40. 5721-5724 (1999)
[文献書誌] Fujiwara, T.; Tao, Z-F.; Ozeki, Y.; Saito, I.; Wang, A.H.-J.; Lee, M.; Sugiyama,H.: "Modulation of Sequence Specificity of Duocarmycin-Dependent DNA Alkylation by Pyrrole-Imidazole Triamides."J. Am. Chem. Soc.. 121. 7706-7707 (1999)
[文献書誌] Yang, X.-L.; Hubbard IV, R. B.; Lee, M.; Tao, Z.-F.; Sugiyama, H.; Wang, H.-J.: "Imidazole-imidazole pair as a minor groove recognition motif for T:G mismatched base pairs."Nucleic Acids Res.. 27. 4183-4190 (1999)