研究課題/領域番号 |
10307011
|
研究種目 |
基盤研究(A)
|
研究機関 | 信州大学 |
研究代表者 |
福島 弘文 信州大学, 医学部, 教授 (70135218)
|
研究分担者 |
劉 春燕 信州大学, 医学部, 助手 (80303460)
太田 正穂 信州大学, 医学部, 講師 (50115333)
|
キーワード | PCR / 蛍光色素 / 制限酵素 / 多型 / DIS80 / DNA / RFLP / 塩基配列 |
研究概要 |
DIS80の塩基配列にEcoRIIのcleavage siteがあるため、この制限酵素を用いたPCR-RFLP法とシークエンス分析からすべてのアリル(日本人集団111名)の分析を行った。その結果11種類の型が検出された。切断パターンで最大フラグメントが小さい方から順に、また48bpのフラグメントが無いものをE1からE5、48bpのフラグメントが出現するものをE6からE10、80bpのフラグメントが出現するものをE11と命名した。ホモの9サンプルのうち2サンプルは24(E4)/24(E8)のpseudohomoタイプであり、その他は18(E3)、24(E4)、27(E3)、28(E4)、31(E4)のホモタイプであった。そのpseudohomoタイプは親子間でも証明され、塩基配列からも明らかにされた。EcoRII以外にMspI、及びAvaIIのcleavage siteが存在するため、これらの酵素を用いたサブタイピングを検討したところアリル28及び30では新たな分類が可能であった。
|