| 研究概要 |
コンパクトなミトコンドリアDNA(mtDNA)は,DNAレベルからの魚類の集団解析や系統解析の第1義的な手がかりとして注目されるところとなっているが,その進化様式についてはまだ不明な点が多い。そこで本研究では,まず第1に,魚類のmtDNAの進化特性を,とくに2つのリボソームRNA遺伝子,転移RNA遺伝子群,いくつかのタンパク質遺伝子,それに制御領域のそれぞれについて解析することを目的とした。第2に,その結果に基づいて,魚類における集団構造解析や近縁・遠縁種間の系統解析のためには,どのような領域をどのようなデータ処理法によって用いたらよいかを検討することとした。
上記の目的にそって,種々の魚類グループにおいて,様々なDNA領域の塩基配列分析を進めた。その結果,現在までに,概略つぎのような点が明らかになっている。1)種内集団や近縁種間の系統解析には,制御領域の解析が適切であるが,魚類グループによっては,この領域の変異性が必ずしも高くない場合もある。2)科間レベルといった遠縁グループの系統関係の解析には,リボソームRNA遺伝子の塩基配列データだけでは,2つ分を足しても不足する可能性が高い。3)遠縁のグループの比較には,多くのタンパク遺伝子の情報を足し合わせるとよさそうである。4)この場合,データをアミノ酸配列データに置き換え,適切な多重置換補正をほどこすと系統再現性が高くなる。5)こうした高次系統解析という目的に適した,mtDNAゲノムの全塩基配列分析の効率的な方法を確立し,いくつかの魚類については既に解析を進めている。
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