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swayingマウスの生後0日-5日において、小脳あるいは中脳の欠如が肉眼的に観察された。成獣swayingマウスではオリーブ核の細胞数の減少や左右オリーブ核の非対称性が観察された。また片側の小脳の欠如も成獣のswayingマウスでみられ、対応する側のオリーブ核の細胞は完全に消失していた。発生過程のswayingマウスでは、中脳と小脳の形成は胎生14日では見られず、脳幹部から第四脳室に突出する脈絡組織のみが観察された。Calbindinによる成獣swayingマウスの観察で、位置異常の少数のプルキンエ細胞と異所性の小脳組織の一部が中脳の上丘や下丘内で観察され、この領域のプルキンエ細胞は虫部前葉(スクランブル様構造)内で見られたプルキンエ細胞と同様に多極性や貧弱に伸びた樹状突起をもっていた。さらに成獣のswayingマウスの中脳のMBPあるいはCNPaseによる観察で、後交連の領域から下丘交連として下丘に入る線維は下丘の変異のため、下丘にのびることなく途中で消失していた。
平成11年度の検索で、swayingマウスでは、胎生14日以前から中脳と小脳は欠如しているが、出生までにこれらの皮質が形成されることがわかった。さらに、成獣で見られる形態異常は、胎生15日以降に出現することが分かった。また、これまで報告されていない脳幹のオリーブ核の異常が小脳の形態学的な変化の2次的な現象によるものである事が明らかになった。
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