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タンパク質のC末端Lys-Asp-Glu-Leu(KDEL)配列は小胞体残留シグナルとして機能することが植物・動物を通じてひろく知られている。一方、ケツルアズキ発芽子葉中でde novo合成されプロテインボディー中の貯蔵タンパク質の分解に関与するシステインエンドペプチダーゼ(SH-EP)は、液胞プロテアーゼであるにもかかわらずそのcDNAより導き出されるC末端にはKDEL配列が存在している。このSH-EP前駆体に存在するKDEL配列はSH-EPを不活性な前駆体として小胞体に一時的に蓄積させる機能を持つこと、および、小胞体内腔にはSH-EPのC末端プロペプチドのプロセシングに関与するプロテアーゼが存在することを示した。この小胞体に局在し、SH-EPのC末端プロセシングに関与しているプロテアーゼ(小胞体プロセシング酵素)のcDNAクローニングを、酵母を用いた機能的スクリーニングにより試みたが、cDNAの単離には至らなかった。そこで、ケツルアズキ発芽子葉から小胞体プロセシング酵素の精製を行ったところ、分子量32 kDaの単一ポリペプチドにまで精製できた。さらに、ケツルアズキ発芽子葉から調整したcDNAライブラリーより、小胞体プロセシング酵素をコードするcDNAを得た。その配列より、その酵素はパパインファミリーに属するプロテアーゼであることが示された。また小胞体プロセシング酵素に対する抗体を調製し、子葉細胞の細胞内分画を行った結果、その酵素は膜画分に局在することが示唆された。
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