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2010 年度 実績報告書

ゲノムワイド関連解析における正確確率検定の応用

研究課題

研究課題/領域番号 10J00226
研究機関東京大学

研究代表者

岡田 随象  東京大学, 医学部附属病院, 特別研究員(DC2)

キーワードゲノムワイド関連解析 / 関節リウマチ / SNP
研究概要

ゲノムワイド関連解析を用いて、関節リウマチを初めとする複数の疾患の原因遺伝子や、身長の個人差、血液学的/生化学的検査値(白血球数、C反応性タンパク)の個人差に関与する遺伝子を多数同定した。ゲノムワイド関連解析とは、ヒトゲノム上に存在する数十万~数百万の一塩基多型(SNP)における個人間の違いと対象形質との関連を、統計学的に解析する手法である。本研究においては、理化学研究所ヒトゲノム解析センターにおいてタイピングされた最大3万人の日本人集団を対象とした大規模なゲノムワイド関連解析を実施し、多数の原因遺伝子の同定することに成功した。
ゲノムワイド関連解析の過程においては、各SNPのタイピング結果におけるエラーの有無を確認する際に、正確確率検定を採用した。正確確率検定を用いることにより、従来の漸近近似に基づく検定と比較してより正確な評価が可能となった。特に本研究においては対象サンプル数が3万人と大規模であるため漸近近似における不正確さが増大することが予想されたため、正確確率検定の採用は効果的であったと考えられた。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2011 2010

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (1件)

  • [雑誌論文] Identificatino of nine novel loci associated with white blood cell subtypes in a Japanese population2011

    • 著者名/発表者名
      岡田随象
    • 雑誌名

      PLoS Genetics

      巻: (掲載確定)

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Genome-wide association study for C-reactive protein levels identified pleiotropic associations in the IL6 locus2011

    • 著者名/発表者名
      岡田随象
    • 雑誌名

      Human Molecular Genetics

      巻: 20 ページ: 1224-1231

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A genome-wide association study in 19 633 Japanese subjects identified LHX3-QSOX2 and IGF1 as adult height loci2010

    • 著者名/発表者名
      岡田随象
    • 雑誌名

      Human Molecular Genetics

      巻: 19 ページ: 2303-2312

    • 査読あり
  • [学会発表] ゲノムワイド関連解析による量的形質関連遺伝子の同定2010

    • 著者名/発表者名
      岡田随象
    • 学会等名
      日本人類遺伝学会第55回大会
    • 発表場所
      大宮ソニックシティ
    • 年月日
      2010-10-28

URL: 

公開日: 2012-07-19  

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