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2010 年度 実績報告書

GTP結合型Rasの立体構造遷移の分子機構

研究課題

研究課題/領域番号 10J00683
研究機関神戸大学

研究代表者

井尻 悠一  神戸大学, 医学研究科, 特別研究員(DC1)

キーワード低分子量Gタンパク質 / Ras / シグナル伝達 / 立体構造 / 遷移 / X線結晶構造解析 / ^<31>P-NMR
研究概要

近年の^<31>P-核磁気共鳴(NMR)による解析から、一般的に活性型と考えられてきたGTP結合型Rasには、エフェクターとの結合に有利なstate2とエフェクターとの結合に不利なstate1が相互変換(遷移)可能な状態で存在することが明らかとなっている。これはRasファミリー低分子量GTPase全般に見られる普遍的な性質であり、2種類のstateの占有比率は各GTPase間で大きく異なることが分かっているが、state遷移のメカニズムについては全く解明されていない。その原因として、H-Rasではstate1構造が、M-Rasではstate2構造が不明であるように、1種類のポリペプチドから2種類のstate構造が決定されたRasファミリー低分子量GTPaseが存在しないことが挙げられる。本研究では、H-Ras型アミノ酸置換を導入したM-Ras変異体、M-RasD41Eを作成し、1種類のRasポリペプチドに由来する2種類のstate構造の決定に成功した。詳細な分子内相互作用の解析の結果、state1構造では、switchI領域のN末端近傍のアミノ酸残基間での水素結合、並びに、switchII領域とα3ヘリックスの間の水素結合の多くが欠失していた。一方、state2構造ではこれら2種類の分子内相互作用により、2つのswitch領域とGTPの間の水素結合の形成が促進され、立体構造の安定性が保たれていた。以上の結果から、前述の分子内相互作用に起因する2つのswitch領域とGTPの間の水素結合がstate2構造の安定化、並びに、state2の占有比率の増加を引き起こすことが明らかになった。

  • 研究成果

    (4件)

すべて 2010 その他

すべて 雑誌論文 (2件) (うち査読あり 2件) 学会発表 (1件) 備考 (1件)

  • [雑誌論文] Structural Basis for Conformational Dynamics of GTP-bound Ras Protein.2010

    • 著者名/発表者名
      島扶美
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: 285巻・29号 ページ: 22696-22705

    • 査読あり
  • [雑誌論文] Critical Roles of Interactions Among Switch I-preceding Residues and Between Switch II and Its Neighboring α-helix on Conformational Dynamics of the GTP-bound Ras Family Small GTPases.

    • 著者名/発表者名
      松本耕祐
    • 雑誌名

      The Journal of Biological Chemistry

      巻: 印刷中

    • 査読あり
  • [学会発表] GTP結合型M-Ras変異体の二種類の結晶構造から考察される立体構造遷移メカニズム2010

    • 著者名/発表者名
      松本耕祐
    • 学会等名
      第33回日本分子生物学会年会・第83回日本生化学会合同大会
    • 発表場所
      神戸国際展示場(兵庫県)
    • 年月日
      2010-12-08
  • [備考]

    • URL

      http://www.med.kobe-u.ac.jp/molbiol/index.html

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公開日: 2012-07-19  

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