遺伝性痙性対麻痺と紀伊筋萎縮性側索硬化症・パーキンソン認知症複合の遺伝子解析研究

2010 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 10J05639
• 研究機関: 東京大学
• 研究代表者: 石浦 浩之 東京大学, 医学部・附属病院, 特別研究員(DC2)
• キーワード: 遺伝性痙性対麻痺 / 紀伊筋萎縮性側索硬化症 / 遺伝子解析 / SNPタイピング / 連鎖解析

研究概要

遺伝性痙性対麻痺に関しては、Resequencing microarrayとarray-based comparative genomic hybridizationという2種類のマイクロアレイを用いたハイスループット遺伝子解析を進め、症例数を増やして解析を行った。また、遺伝子未同定例に関して家系収集を行い、3家系についてご家族の診察とDNA採取を行った。3家系については、Affymetrix SNP6.0アレイを用いて遺伝子型を決定し、SNP-HiTLinkとAllegroを用いてパラメトリック多点連鎖解析を行った。常染色体劣性モデルにおいて、3家系中2家系においては既知の常染色体劣性遺伝性痙性対麻痺の遺伝子座への連鎖は認めず、新規疾患であると考えられた。残りの1家系においては、SPG35の遺伝子座に関しては完全には除外することができなかったが、その他の常染色体劣性遺伝性痙性対麻痺の遺伝子座に関しては連鎖を認めなかった。
紀伊筋萎縮性側索硬化症・パーキンソン認知症複合(紀伊ALS/PDC)の多くには家族歴が存在し、遺伝的な原因の存在が考えられてきた。今回、マイクロサテライトによるタイピングを用いたパラメトリック二点連鎖解析と、一塩基多型(SNP)によるタイピングを用いたノンパラメトリック多点連鎖解析を両方用いて解析を試みた。いくつかの候補となる領域を見出すことができたが、2つの手法で得られた候補領域については従来のシークエンスで原因遺伝子を同定するほどには十分に絞り込みはできなかった。

研究成果

• [雑誌論文] Posterior column ataxia with retinitis pigmentosa in a Japanese family with a novel mutation in FLVCR1. (2011)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H, Fukuda Y, Mitsui J, Nakahara Y, Ahsan B, Takahashi Y, Ichikawa Y, Goto J, Sakai T, Tsuji S.
  • 雑誌名: Neurogenetics 巻: In press(掲載確定)
  • 査読あり
• [雑誌論文] 遺伝性痙性対麻痺の分子遺伝学と遺伝子診断. (2011)
  • 著者名/発表者名: 石浦浩之
  • 雑誌名: 神経内科 巻: 74 ページ: 146-151
• [雑誌論文] 臨床医学への展望2011-血管系を除く- (2011)
  • 著者名/発表者名: 辻省次(分担共著)
  • 雑誌名: 日本医事新報 巻: 4533 ページ: 146-151
• [雑誌論文] Multiplexed resequencing analysis to identify rare variants in pooled DNA with barcode indexing using next-generation sequencer (2010)
  • 著者名/発表者名: Mitsui J, Fukuda Y, Azuma K, Tozaki H, Ishiura H, Takahashi Y, Goto J, Tsuji S.
  • 雑誌名: Journal of Human Genetics 巻: 55 ページ: 448-455
  • 査読あり
• [雑誌論文] A case of atypical amyloid polyneuropathy with predominant upper-limb involvement with the diagnosis unexpectedly found at lung operation. (2010)
  • 著者名/発表者名: Shirota Y, Iwata A, Ishiura H, Hashimoto M, Goto J, Shimizu J, Hanajima R, Nakajima J, Takazawa Y, Tsuji S.
  • 雑誌名: Internal medicine 巻: 49 ページ: 1627-1631
  • 査読あり
• [雑誌論文] Dominant mutations in RP1L1 are responsible for occult macular dystrophy. (2010)
  • 著者名/発表者名: Akahori M, Tsunoda K, Miyake Y, Fukuda Y, Ishiura H, Tsuji S, Usui T, Hatase T, Nakamura M, Ohde H, Itabashi T, Okamoto H, Takada Y, Iwata T.
  • 雑誌名: American Journal of Human Genetics 巻: 87 ページ: 424-429
  • 査読あり
• [雑誌論文] 臨床医学への展望2010-血管系を除く- (2010)
  • 著者名/発表者名: 辻省次(分担共著)
  • 雑誌名: 日本医事新報 巻: 4484 ページ: 46-59
• [学会発表] Siblings of pathologically proven multiple system atrophy : an application of whole genome analysis toward finding strong genetic factors for sporadic diseases. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H, et al.
  • 学会等名: Annual meeting of American Society of Human Genetics
  • 発表場所: ワシントン(アメリカ)
  • 年月日: 2010-11-03
• [学会発表] Massively parallel sequence analysis for revealing causes of neur omuscular disorders. (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浦, ら
  • 学会等名: 第51回日本神経学会総会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-05-21
• [学会発表] SNPアレイを用いたハイスループット連鎖解析システムの診療への応用 (2010)
  • 著者名/発表者名: 石浦, ら
  • 学会等名: 第51回日本神経学会総会
  • 発表場所: 東京
  • 年月日: 2010-05-20
• [学会発表] Application of a microarray-based whole mitochondrial DNA sequence analys is for molecular diagnosis of mitochondrial diseases. (2010)
  • 著者名/発表者名: Ishiura H, et al.
  • 学会等名: Annual meeting of American Academy of Neurology
  • 発表場所: トロント(カナダ)
  • 年月日: 2010-04-14