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2012 年度 実績報告書

農業水域に生息する魚類個体群の保全遺伝生態学的研究

研究課題

研究課題/領域番号 10J06719
研究機関独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構

研究代表者

西田 一也  独立行政法人農業・食品産業技術総合研究機構, 農村工学研究所・資源循環工学研究領域, 特別研究員(PD)

キーワード農業水域 / 淡水魚 / 遺伝的集団構造 / 遺伝的多様性 / 在来・非在来
研究概要

当該年度は,全国スケールにおけるアブラハヤ・タカハヤのミトコンドリアDNA(mtDNA)Dloopの解析を行った.解析には33地点281個体の957bpを供した.ハプロタイプ(配列の種類)を基に系統樹を作成して,各地域で得られたハプロタイプ間の類縁関係を把握した.
系統樹はまずタカハヤとアブラハヤに分かれ,両種間の平均塩基置換率は5.8%であった.タカハヤのハプロタイプは地理的にまとまったクレードを形成し,それらのクレード間の平均塩基置換率は1.1~2.4%であった.アブラハヤのハプロタイプにも地理的にまとまったクレードを形成するものが存在したが,なかには地理的にまとまらないハプロタイプもみられた.地理的にまとまったクレード間の平均塩基置換率は1.1~2.6%であった.仮に一般的な動物のミトコンドリアの進化速度とされる100万年当たり2%の塩基置換(Brown et al., 1979)を適用すると,アブラハヤとタカハヤはおよそ290万年前(鮮新世)に分化し,タカハヤとアブラハヤそれぞれのクレードはおよそ55~130万年前(更新世中期~前期)に分化したと推定された.
関東地方で得られたタカハヤのハプロタイプは琵琶湖・淀川水系と同じクレードに属したことから,関東地方のタカハヤは同水系からの移植に由来する。と考えられた.また,アブラハヤについても,地理的に離れた東北地方と琵琶湖・淀川水系のハプロタイプが同じクレードに属したことから,同水系からの移植があった可能性も示唆された.
なお,アブラハヤとタカハヤの共存水域で得たサンプリング個体の中には,ごく少数ではあるが,両種の交雑により生じたと考えられる個体が存在したことから,アブラハヤとタカハヤおよび交雑個体を簡便に判別する方法として,RAPD分析による両種および交雑個体の判別方法を開発した.

  • 研究成果

    (2件)

すべて 2012

すべて 学会発表 (2件)

  • [学会発表] DNA解析による関東地方のタモロコの在来・非在来の予備的検討2012

    • 著者名/発表者名
      西田一也, 小出水規行, 渡部恵司, 竹村武士, 森淳
    • 学会等名
      農業農村工学会大会講演会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2012-09-19
  • [学会発表] 農村の生き物モニタリング調査研究の動向と具体的事例および今後の課題2012

    • 著者名/発表者名
      西田一也
    • 学会等名
      農業農村工学会大会講演会
    • 発表場所
      北海道大学
    • 年月日
      2012-09-19

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公開日: 2014-07-16  

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