脊椎動物ゲノムにおけるパラロガス領域の起源

1999 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 11149209
• 研究機関: 総合研究大学院大学
• 研究代表者: 笠原 正典 総合研究大学院大学, 先導科学研究科, 教授 (30241318)
• キーワード: パラロガス領域 / MHC / ゲノム重複 / 無顎類

研究概要

本研究では,1)MHCパラロガス・グループに属する新規遺伝子群を体系的に同定すること,2)系統発生的にMHCパラロガス領域を形成した重複の直前に位置すると考えられる無顎類(メクラウナギ)のゲノムに存在するMHCパラロガス領域数を同定することを目的とした.
1.MHCパラロガス・グループに属するヒト遺伝子群の同定
これまでに,約20の遺伝子群が,HLAとそのパラロガスな領域(ヒト染色体9q33-q34,19p13.1-13.3,1q21-q25/p11-p32領域)にコピーをもつことを示してきた.今回,新たにデータベースを検索することにより,1)HLA領域に存在する全遺伝子の約3〜4分の1に相当する37個の遺伝子が9q33-q34,19p13.1-13.3,1q21-q25/p11-p32領域のいずれかにパラロガスなコピーをもっていること,2)MHC領域内にはコピーをもたないが,9q33-q34,19p13.1-13.3,1q21-q25/p11-p32領域間でパラロガスなコピーを共有する遺伝子群が少なくとも50個存在することがあきらかになった.以上から,ほぼ90に近い多種多様な遺伝子族がMHCパラロガス群に属することが判明した.
2.メクラウナギのゲノムに存在するMHCパラロガス領域数の同定
MHCパラロガス・グループのメンバーであるPBX遺伝子をメクラウナギからクローニングした.ヒトでは,3個のPBX遺伝子(PBX1,PBX2,PBX3)が存在するが,メクラウナギには2個のPBX遺伝子が存在するとの予備的なデータを得た.現在,MHCパラロガス・グループに属するRXR遺伝子,RING3遺伝子をメクラウナギからクローニング中である.これらのデータが得られた段階で,メクラウナギのゲノムに存在するMHCとパラロガスな領域の数を推定することができると期待している.

研究成果

• [文献書誌] Kasahara, M.: "The chromosomal duplication model of the major histocompatibility complex"Immunol. Rev.. 167. 17-32 (1999)
• [文献書誌] Nishi, S., Hoshi, N., Kasahara, M., Ishibashi, T. and Fujimoto, S.: "Existence of human DAZLA protein in the cytoplasm of human oocytes"Mol. Hum. Reprod.. 5. 495-497 (1999)
• [文献書誌] Flajnik, M. F., Ohta, Y., Greenberg, A. S., Salter-Cid, L., Carrizosa, A., Du Pasquier, L. and Kasahara, M.: "Two ancient allelic lineages at the single classical class I Iocus in the Xenopus MHC"J. Immunol.. 163. 3826-3833 (1999)
• [文献書誌] Kasahara, M.: "Genome dynamics of the major histocompatibility complex : insights from genome paralogy"Immunogenetics. 50. 134-145 (1999)
• [文献書誌] Murata, S., Kawahara. H., Tohma, S., Yamamoto, K., Kasahara, M., Nabeshima, Yi., Tanaka, K. and Chiba, T.: "Growth retardation in mice lacking the proteasome activator PA28γ"J. Biol. Chem.. 274. 38211-38215 (1999)
• [文献書誌] Kirchhoff, C., Osterhoff, C., Kasahara, M. and Ivell, R: "Molecular biology of sperm maturation -New strategies for make contraception?"Male Contraception : Present and Future. 103-123 (1999)
• [文献書誌] Kasahara, M. and Tanaka, K.: "Proteasomes and antigen presentation : biochemistry and genetics"Recent Res. Dev. Immunol.. 1(印刷中). (2000)
• [文献書誌] Kasahara, M., Ywata, M. and Suzuki, T.: "The MHC paralogous group : Listing of members and a brief overview"Major Histocompatibility Complex : Evolution, Structure, and Function. 27-44 (2000)
• [文献書誌] Kasahara, M.: "Genome paralogy : A new perspective on the organization and origin of the major histocompatibility complex"Curr. Top. Microbiol. Immunol.. 248. 53-66 (2000)
• [文献書誌] Kasahara, M.(ed.): "Major Histocompatibility Complex : Evolution, Structure, and Function"Springer-Verlag, Tokyo-Berlin-Heidelberg-New York. 561 (2000)