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1999 年度 実績報告書

ヒトメガサテライトDNAのゲノム構造と超可変性

研究課題

研究課題/領域番号 11149225
研究機関理化学研究所

研究代表者

権藤 洋一  理化学研究所, マウス変異開発研究チーム, チームリーダー(研究職) (40225678)

研究分担者 秦野 伸二  東海大学, 総合医学研究所, 助手 (60281375)
桝屋 啓志  理化学研究所, マウス変異開発研究チーム, 研究員 (40321814)
井上 麻紀  理化学研究所, マウス変異開発研究チーム, リサーチアソシエイト(研究職) (90321728)
斎藤 靖史  岩手大学, 農学部, 助教授 (70287100)
キーワードゲノム / 反復配列 / サテライトDNA / 超可変性,ゲノム / ヒト / 不安定性,ゲノム / タンデムリピート / 多型
研究概要

98年度にヒトゲノムにおけるRS447メガサテライトDNAという新しい概念を公に認められ(Gondo et al.,Genomics 1998)、詳細な解析を進めたところ、タンデムコピー数が親子間で10%の高頻度で変動し(Okada et al.,in preparation)、また、junk DNAなどと異なりその反復単位のなかに活性をもつ脱ユビキチン化酵素をコードし、5'上流にプロモーター活性もあった(Saitoh et al.,Molec.Cell Biol.submitted)。この全く新しい機能をもちながら超可変性を示すヒトゲノム構造機能を実験的に解析できるよう、モデル動物系の探索も行った。調べた哺乳動物すべてにRS447メガサテライト相同配列が存在し、チャイニーズハムスター、ラットから相同クローンを得た。タンデム構造、コピー数、脱ユビキチン化酵素をコードすることなど全て確認できた。このRS447配列群と最も高い相同性を示す配列として、すでにマウス脱ユビキチン化酵素であるDUB-1、DUB-2がわかっていた。しかし、マウスゲノムにはこれらの遺伝子はタンデム構造をしておらず、他にもタンデム反復した相同配列はない。そのかわりに多数の散在する相同配列は存在する。ヒトをはじめタンデム構造のRS447メガサテライト配列は種内ではほぼ100%相同(>99.3%)であり、協調進化によって変化しないような機構があることが考えられるが、マウスにはその機構がないわけであり、ヒトRS447導入トランスジェニックマウスの利用によって検討している。現在12系統得られ3系統について詳細な解析を行っている。また、類似の不安定なタンデムリピートとして、ヒトNAIP遺伝子のcDNAクローン(Yamamoto et al.,BBRC 1999)およびミニブタハンチントン病遺伝子cDNAクローン(Matsuyama et al.,in preparation)も得て解析している。

  • 研究成果

    (4件)

すべて その他

すべて 文献書誌 (4件)

  • [文献書誌] S.Nakamura: "Radiation-induced mutation in the spleen and brain of lacZ transgenic mouse"Int. J. Radiation Biol.. (in press).

  • [文献書誌] K.Yamamoto: "Identification of two distinct transcripts for the neuronal apoptosis inhibitory protein (NAIP) gene"Biochem. Biophys. Res. Commun.. 264. 998-1006 (1999)

  • [文献書誌] S.Muto: "Inhibition of benzo[a]pyrene-induced mutagenesis by (-)-epigallocatechin gallate in the lung of rpsL transgenic mice"Carcinogenesis. 20. 421-424 (1999)

  • [文献書誌] T.Shiroishi: "Mouse Initiatives : Advanced Functional Genomics"The Jackson Laboratory. 1 (1999)

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公開日: 2001-10-23   更新日: 2016-04-21  

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