ヒト化を特徴づける遺伝子変化探索システムの開発

1999 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 11354011
• 研究種目: 基盤研究(A)
• 研究機関: 国立遺伝学研究所
• 研究代表者: 斎藤 成也 国立遺伝学研究所, 集団遺伝研究系, 助教授 (30192587)
• 研究分担者: 植田 信太郎 東京大学, 大学院・理学系, 助教授 (20143357) ; 五條堀 孝 国立遺伝学研究所, 生命情報センター, 教授 (50162136)
• キーワード: ヒト化 / 類人猿 / ゲノム / 遺伝子 / 進化 / Silver

研究概要

本研究では、ヒト化を特徴づける遺伝子の変化を発見することを目的として、系統的にヒトに近縁な類人猿{チンパンジー(chimpanzee)、ボノボ(bonobo)、ゴリラ(gorilla)、オランウータン(orangutan)}の遺伝子の塩基配列の大規模比較を行なった。まず、既にDNAデータベースに登録されてあるヒトとチンパンジー、ゴリラ、オラウータンなどの他の類人猿の遺伝子の塩基配列の比較データベースの作成を行なった。現在のところ約60遺伝子の比較データベースを作成している。
一方、ヒトにおいて知られているさまざまな遺伝子の塩基配列からプライマーを設計して、チンパンジー、ゴリラ、オランウータンなどの他の類人猿からそれらの相同遺伝子の塩基配列決定を行なった。これにはPCRダイレクトシーケンス法を用いて、それらの大規模配列比較解析を行なった。特に、遺伝子のコード領域やその上流の制御領域に的を絞って行なっている。現在のところ、ヒト、チンパンジー、ゴリラ、オランウータンのそれぞれについて、およそ30遺伝子座、約23kbずつ配列を決定し、ヒトと類人猿の塩基配列比較データベースの作成、およびそれらの大規模比較解析を行なっている。これらの結果は、類人猿ゲノム計画:Silver Projectのホームページ(http://sayer.lab.nig.ac.jp/〜silver/index.html)で公開している。

研究成果

• [文献書誌] Keneko M.: "Molecular cloning, characterization and chromosomal mapping of Human al, 3-fucoslytransterase 1X(hFuc-TIX) ; Fuc-TIX is very highly conserved between human and moouse"FEBS Letter. vol. 452. 237-242 (1999)
• [文献書誌] Kaneko M.: "Assignment of the human alpha 1,3-fucosyltransferase IX(FUT9) gene to chromosome band 6q16 by in situhybridization"Cytogenetics and Cell Genetics. vol.86. 329-330 (1999)
• [文献書誌] Kitano T.: "Evolution of the Rh blood group genes has experienced gene conversions and positive selection"Journal of Molecular Evolution. 49・5. 615-626 (1999)
• [文献書誌] Kitano T.: "Molecular evolutionary analyses of the Rh blood group genes and Rh50 genes"Zoological Studies. 38・4. 379-386 (1999)
• [文献書誌] Kitano T.: "Gene diversity of chimpanzee ABO blood group genes elucidated from intron 6 sequences"Journal of Heredity. (in press). (2000)
• [文献書誌] 斎藤成也: "ABO式およびRh式血液型遺伝子の進化"細胞工学. 18・7. 1039-1047 (1999)