| 研究課題/領域番号 |
11460085
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| 研究機関 | 東京大学 |
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研究代表者 |
大和田 紘一 東京大学, 海洋研究所, 教授 (30013585)
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| 研究分担者 |
和田 実 東京大学, 海洋研究所, 助手 (70292860)
西村 昌彦 東京大学, 海洋研究所, 助手 (10242174)
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| キーワード | 多様性 / 海底堆積物 / 非培養解析 / 16S rRNA / 微生物コミュニティー |
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| 研究概要 |
平成10年度に白鳳丸航海の際にマリアナ海溝、伊豆小笠原海溝など8,000mを越す深海から採取された堆積物も冷凍保管されている。さらに今年度は白鳳丸による南太平洋、や淡青丸による伊豆小笠原海溝の堆積物も採取した。現場サンプルから直接抽出したDNAをTGGE法あるいはDGGE法によりアガロースゲル上に展開し、そこで得られたバンドに関し、遺伝的多様性解析システムを用いて解析した。その中では試料によって共通のバンドや共通性のないバンドに関し解析すると同時にそれらのシークエンスを調べ、これまでに得られているデータベースとコンピュータを通じてダイレクトに比較できるのが、新しく購入する遺伝的多様性解析システムの強みである。また、16SリボソームのRNA塩基配列のみでなく、キノンを用いる微生物群集解析に関しても並行して行い、両者を比較した。沿岸の堆積物に関しては、かなりの成果が得られたが、外洋の堆積物に関しての研究はまだまとまらなかった。
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