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本研究では、古代日本の遺構から出土した動物遺体の遺伝子DNAを調べ、家畜等の伝播経路について有力なデータを得ることを目的としている。古代の動物遺体のDNA分析においては、DNAの劣化が進んでいること、入手できる試料量が少ないこと、細菌やカビ、人間などの現世の生物のコンタミネーションを避けられないなど制約がある。研究代表者らはこれまでの研究において、古代試料中に含まれる細菌やカビなどの汚染微生物の遺伝子の中から目的の生物種の遺伝子を単離するための方法の確立に取り組んできた。初年度はこれまでの研究を発展させて、目的とする生物種について地域的な分布(産地)等についての情報を得るには、どのようなDNA領域が適当か検討を開始した。まず、いろいろな地域の個体の試料を入手し、情報収集に努めた。さらに、古代試料1例より目的のDNA領域を増幅することを試みているが、試料に含まれる色素によりDNA増幅が阻害されることがわかり、阻害を抑制する条件を現在検討している。
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