DNA二本鎖情報を増幅するナフタレンジイミド誘導体に関する研究

2000 年度 実績報告書

• 研究課題/領域番号: 11680590
• 研究機関: 九州大学
• 研究代表者: 竹中 繁織 九州大学, 大学院・工学研究院, 助教授 (60188208)
• キーワード: ビオチン / DNA / 縫い込み型インターカレータ / インターカレーション / 遺伝子検出 / ドットブロッティング / 粘度滴定 / 円二色性スペクトル

研究概要

今回、ビオチン化ナフタレンジイミドBNDを設計・合成した。分光学的,流体力学的検討から、このビオチン化ナフタレンジイミドBNDが2本鎖DNAにインターカレーションすることが明らかにでき、当初の目的を達成できた。しかしながら、その展開としてのビオチン化ナフタレンジイミドBNDを用いたドットブロッティングによる遺伝子検出は、十分な結果を得ることはできなかった。今後、条件を検討していく必要がある。十分な結果を得ることができなかった理由として、アビジンを加えた際に、DNAにインターカレーションしているビオチン化ナフタレンジイミドBNDの一部が引き剥がされて可能性が挙げられる。この点を解決するため、ビオチン化ナフタレンジイミドBNDのリンカー部を長くした分子設計が必要である。
本研究により、新規縫い込み型インターカレータの遺伝子検出試薬としての可能性を示すことができた。今後、更なる分子設計・モデル実験などを通じて従来の手法を凌駕する遺伝子検出システムが構築できるものと期待している。

研究成果

• [文献書誌] Hiroyuki Ueyama et al.: "Novel Synthesis of a tetra-acridinyl peptide as a new DNA polyintercalator"Nucleic.Acids.Symposium Series. 44. 133-134 (2000)
• [文献書誌] Shinobu Sato et al.: "Ferroceneacetyl naphthalene diimide as a new electrochemical ligand for DNA sensing"Nucleic.Acids.Symposium Series. 44. 171-172 (2000)
• [文献書誌] Kenichi Yamashita et al.: "Fluorescence microscopic visualization of a DNA-cationic fullerene complex"Nucleic.Acids.Symposium Series. 44. 173-174 (2000)
• [文献書誌] Kenichi Yamashita et al.: "Electrochemical Detection of Base Pair Mutation"Chemistry Letters. 1038-1039 (2000)
• [文献書誌] Shigeori Takenaka et al.: "DNA Sensing on a DNA Probe-Modified Electrode Using Ferrocenylnaphthalene Diimide as the Electrochemically Active Ligand"ANALYTICAL CHEMISTRY. 72. 1334-1341 (2000)
• [文献書誌] Shigeori Takenaka et al.: "Photo-induced DNA Cleavage by Water-soluble Cationic Fullerene Derivatives"Chemistry Letters. 713-714 (2000)
• [文献書誌] 内田和彦,竹中繁織: "DNAマイクロアレイと最新PCR法"秀潤社. 8/113 (2000)
• [文献書誌] 竹中繁織: "DNAチップ応用技術"CMC. 13/225 (2000)