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本研究は肝癌発癌の初期過程において、メチル化状態の変化がどのような形で発癌に関与するかを明らかにする事を目的とした。まず肝癌染色体DNAのRLGS法による解析と、RH panelsによる染色体へのマッピングを、メチル化の変化によるとみられるスポットに注目して進めた。その結果、多くの肝癌で観察されたスポットの変化のいくつかは、実際にCpGアイランドのメチル化の亢進によることを確認し報告した(Hanafusa T.et al.Genome aberrations observed by restriction landmark genome scanning analysis of chromosomal DNA in various types of primary hepatocellular carcinoma.Hepato-Gastroenterology(2001)(in press))。さらにRLCS法による解析との比較検討を一つの目的とした肝癌のマイクロアレイ解析により、いくつかの遺伝子にメチル化の亢進と関連する発現低下が見られることを報告した(第3回日本肝臓学会大会1999年)。マイクロアレイおよびRLCS法を用いた解析の結果、増殖の抑制に関与する遺伝子IGFBP-3が肝癌で高頻度に発現低下を引き起こしており、これに染色体のLOHとプロモーターのメチル化の亢進が関与する事を明らかにした(manuscript in submission)。IGFBP-3は肝癌の癌抑制遺伝子であると予想し、IGFBP-3をターゲットとした肝癌治療法の開発をすすめるべきであると結論した。
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