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2013 年度 実績報告書

リボソームの翻訳伸長停止と共役したmRNA分解 : 植物における新規転写後制御の研究

研究課題

研究課題/領域番号 11J01971
研究機関北海道大学

研究代表者

山下 由衣  北海道大学, 大学院生命科学院, 特別研究員(DC1)

キーワード翻訳アレスト / 翻訳伸長 / シロイヌナズナ
研究概要

本研究はS-アデノシルメチオニン(SAM)に応答して, シロイヌナズナのCGS1 mRNA上で起こる翻訳停止がmRNA分解を誘導する機構を明らかにすることを目的としている。この制御では, 翻訳停止したリボソームを認識してmRNA分解機構が働くと考えられるため, まずはじめに, 翻訳停止したリボソームの状態を明らかにすることを目指した。平成23と24年度はSAMによって翻訳停止したリボソームが抗生物質のピューロマイシンと反応しにくいことを明らかにした。平成25年度は, 翻訳停止したリボソームとピューロマイシンの反応性をさらに詳しく解析した。前年度よりもタイムポイントを増やし, 3秒~15分までに設けた17点を測定し, ピューロマイシン反応の速度を定量的に比較した。その結果, SAMによって翻訳停止したリボソームは転座前の状態で止まっていることが明らかになり, 先行研究を強く支持した。一方, SAMで翻訳停止したリボソームに追突した後続のリボソームのピューロマイシン反応は, 転座前と転座後の中間的な値を示した。この, 中間的なピューロマイシン反応速度から, 追突したリボソームの約6割が転座前, 約4割が転座後であることが明らかになった。以上の内容をまとめた学術論文は, Yui Yamashita et al., "Ribosomes in a Stacked Array"として, Journal of Biological Chemistry誌に採択され, 印刷中である。

今後の研究の推進方策

(抄録なし)

  • 研究成果

    (7件)

すべて 2014 2013

すべて 雑誌論文 (3件) (うち査読あり 3件) 学会発表 (3件) 図書 (1件)

  • [雑誌論文] Ribosomes in a Stacked Array : Elucidation of the Step in Translation Elongation at Which They Are Stalled During S-Adenosyl-L-methionine-Induced Translation Arrest of CGS1 mRNA2014

    • 著者名/発表者名
      Yui Yamashita, Yoshitomo Kadokura, Naoyuki Sotta, Toru Fujiwara, Ichigaku Takigawa, Akiko Satake, Hitoshi Onouchi, and Satoshi Naito
    • 雑誌名

      Journal of Biological Chemistry

      巻: (印刷中)

    • DOI

      10.1074/jbc.M113.526616

    • 査読あり
  • [雑誌論文] SS-mPMG and SS-GA : tools for finding pathways and dynamic simulation of metabolic networks.2013

    • 著者名/発表者名
      Tetsuo Katsuragi, Naoaki Ono, Keiichi Yasumoto, Masami Y. Hirai, Kansuporn Sriyudthsak, Yuji Sawada, Yui Yamashita, Yukako Chiba, Hitoshi Onouchi, Toru Fujiwara, Satoshi Naito
    • 雑誌名

      Plant and Cell Physiology

      巻: 54 ページ: 728-739

    • DOI

      10.1093/pcp/pct052

    • 査読あり
  • [雑誌論文] A halt in poly(A) shortening during S-adenosyl-L-methionine-induced translation arrest in CGS1 mRNA of Arabidopsis thaliana2013

    • 著者名/発表者名
      Yui Yamashita, Ingrid Lambein, Soko Kobayashi, Hitoshi Onouchi, Yukako Chiba and Satoshi Naito
    • 雑誌名

      Genes and Genetic Systems

      巻: 88 ページ: 241-249

    • DOI

      10.1266/ggs.88.241

    • 査読あり
  • [学会発表] A halt in Poly(A) shortening during S-adenosyl-L-methionine-induced translation arrest in CGS1 mRNA of Arabidopsis2014

    • 著者名/発表者名
      山下由衣
    • 学会等名
      第55回日本植物生理学会年会
    • 発表場所
      富山大学(富山市)
    • 年月日
      2014-03-21
  • [学会発表] CGS1 mRNAの翻訳制御におけるリボソームの停滞と新生ペプチドの収縮.2013

    • 著者名/発表者名
      山下由衣
    • 学会等名
      第31回日本植物細胞分子生物学会大会
    • 発表場所
      北海道大学(札幌市)
    • 年月日
      2013-09-10
  • [学会発表] S-アデノシルメチオニンはシロイヌナズナCGS1 mRNAにおける翻訳アレストに先立って新生ペプチドの収縮を引き起こす.2013

    • 著者名/発表者名
      山下由衣
    • 学会等名
      第15回日本RNA学会年会
    • 発表場所
      ひめぎんホール(愛媛県)
    • 年月日
      2013-07-25
  • [図書] Translation elongation arrest induced by S-adenosyl-L-methionine-sensing nascent peptide in plants. In "Regulatory Nascent Polypeptides" (Ed. K. Ito)2014

    • 著者名/発表者名
      Yui Yamashita, Noriyuki Onoue, Katsunori Murota, Hitoshi Onouchi and Satoshi Naito
    • 出版者
      Springer(印刷中)

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公開日: 2015-06-25  

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